基于分子標(biāo)記柑橘遺傳多樣性研究.pdf

1、柑橘由于栽培歷史悠久、種屬間易雜交、天然突變頻繁以及長期的自然和人工選擇等因素，導(dǎo)致種類繁多，遺傳多樣性極其豐富，品種區(qū)分難，進(jìn)化起源問題極其復(fù)雜。本研究利用SSR、InDel及來自lncRNA的分子標(biāo)記對我國不同地區(qū)的45份野生、半野生及地方寬皮柑橘資源進(jìn)行了遺傳多樣性分析，并利用SSR和InDel分子標(biāo)記對58份柑橘大翼橙資源和26份來自不同國家與地區(qū)的椪柑資源、開展了遺傳多樣性研究，結(jié)果如下：
　　1.利用SSR和InDel

2、分子標(biāo)記的對26份來自不同國家與地區(qū)的椪柑資源進(jìn)行了分析。21對引物共獲得62個(gè)標(biāo)記位點(diǎn)，產(chǎn)生了105條多態(tài)性條帶，平均每對引物檢測到5條多態(tài)性擴(kuò)增條帶。多態(tài)性標(biāo)記位點(diǎn)的平均PIC值為0.32，平均期望雜合度為0.30。群體遺傳結(jié)構(gòu)和主坐標(biāo)軸分析均表明，椪柑資源內(nèi)部遺傳多樣性水平低，遺傳變異較小。印度酸橘與椪柑遺傳關(guān)系較遠(yuǎn)，Emperor、瀨戶見及早香等椪柑雜交后代，與椪柑存在明顯的遺傳差異，通過不同的分子標(biāo)記組合可以有效鑒別區(qū)分椪柑材

3、料。
　　2.利用SSR和InDel分子標(biāo)記引物對來自不同地區(qū)的45份野生、半野生及地方寬皮柑橘資源進(jìn)行了遺傳多樣性分析。22對引物共獲得56個(gè)標(biāo)記位點(diǎn)，產(chǎn)生了197條多態(tài)性條帶，平均每對引物檢測到8.9條擴(kuò)增條帶，多態(tài)性標(biāo)記位點(diǎn)的平均PIC值為0.40，平均期望雜合度為0.29。群體遺傳結(jié)構(gòu)、主坐標(biāo)軸和聚類分析均表明，莽山野柑是一類原始獨(dú)特的柑橘種質(zhì)；起源于南嶺山脈的野生寬皮柑橘，如道縣野橘、懸崖野橘、莽山橘、江永野橘、崇義野橘

4、等構(gòu)成了一類獨(dú)特于其它寬皮柑橘的原始野生類群；古老栽培柑橘中的皺皮柑類型，包括旺蒼皺皮柑、皺皮柑、藏橘等構(gòu)成了另一個(gè)原始古老類群；現(xiàn)代栽培柑橘城固冰糖橘中具有典型皺皮柑的基因滲入。寬皮柑橘中的一些育成品種及雜柑資源，具有較豐富的遺傳多樣性。本研究證實(shí)了起源于南嶺山脈一帶的野生寬皮柑橘在遺傳背景上較為接近，其多樣性也低于現(xiàn)代栽培寬皮柑橘，缺乏人為馴化和外源基因滲入，為南嶺山脈是我國寬皮柑橘的起源中心這一論斷提供了科學(xué)依據(jù)。由于長期的人為馴

5、化和外源基因的滲入，寬皮柑橘的演化伴隨著遺傳多樣性水平由低向高逐漸演變的過程。
　　3.利用SSR與InDel共21對引物對58份柑橘大翼橙資源進(jìn)行了遺傳多樣性分析。共獲得57個(gè)標(biāo)記位點(diǎn)，產(chǎn)生了131條多態(tài)性條帶，平均每對引物檢測到6.2個(gè)多態(tài)性條帶，多態(tài)性標(biāo)記位點(diǎn)的基因多樣性為0.14-1.11，期望雜合度為0.04-0.97，PIC值為0.13-1.04。群體遺傳結(jié)構(gòu)分析、聚類分析和主坐標(biāo)分析均表明元江野生宜昌橙是不同于現(xiàn)有宜

6、昌橙資源的新類型，在元江宜昌橙野生種群內(nèi)存在較高的遺傳分化。研究結(jié)果表明元江野生宜昌橙是有別于其它地區(qū)宜昌橙資源的新類型，需加強(qiáng)對該資源的原位保護(hù)，在進(jìn)行元江宜昌橙野生資源的收集時(shí)，以居群為單位加以收集保護(hù)，可獲得更高的遺傳多樣性。
　　4.基于LncRNA數(shù)據(jù)開發(fā)分子標(biāo)記，通過利用野生與地方柑橘品種群體進(jìn)行驗(yàn)證，結(jié)果表明，基于LncRNA開發(fā)的分子標(biāo)記的遺傳多樣性水平與SSR和InDel分子標(biāo)記的水平相當(dāng)，且整體結(jié)果與利用SSR