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文檔簡介
1、房顫伴瓣膜性心臟?。ˋtrial fibrillation with valvular heart disease,AF-VHD)是一類瓣膜性疾病,易于引起一系列連鎖疾病的發(fā)生,比如心力衰竭、心肌梗塞、血栓等嚴重的并發(fā)癥,故具有非常高的傷害性以及致死率。隨著現(xiàn)代分子生物學理論和技術不斷的發(fā)展,國內外對于AF-VHD的致病分子機制研究有了較大的發(fā)展,但是其研究角度相對單一,沒有從網(wǎng)絡的整體性去探尋疾病的致病機理。因此,本文結合數(shù)學網(wǎng)絡的篩
2、選方法和生物信息分析的手段,分別構建出瓣膜性心臟?。╒HD)和AF-VHD兩種疾病的共調控網(wǎng)絡,主要研究內容為:
?。?)從已經發(fā)表的文獻中收集到與VHD相關的15個miRNAs,根據(jù)基因、miRNA、轉錄因子共調控網(wǎng)絡構建方法,構建VHD的混合共調控網(wǎng)絡。對網(wǎng)絡節(jié)點進行度篩選,找出了關鍵的4個miRNA、4個TF、31個基因,利用關鍵miRNA和靶基因進行GO功能富集分析和KEGG數(shù)據(jù)庫以及單獨解析34個基因的生物功能,映射到
3、生物空間揭示VHD致病的分子機理。
(2)基于本實驗室APCA&靴帶抽樣方法提取的32個與AF-VHD疾病相關的miRNAs,利用與上一部分相同的網(wǎng)絡構造方法原理,構建出 AF-VHD混合調控共網(wǎng)絡。通過網(wǎng)絡特征分析,篩選出關鍵的5個miRNA、5個TF、41個基因,映射到生物空間挖掘AF-VHD致病的分子機理。隨后對比VHD和AF-VHD兩者的網(wǎng)絡,提取共同的生物特征進行分析,從而挖掘出其中的重要分子調節(jié)機制,闡述從VHD到
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