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文檔簡介
1、第一部分:CARLo-5在食管癌組織和細(xì)胞中的表達(dá)及對其生物學(xué)特性的影響
目的:研究癌癥相關(guān)區(qū)域長鏈非編碼RNA CARLo-5在食管癌組織和細(xì)胞中的表達(dá)及對食管癌細(xì)胞增殖、遷移、侵襲、凋亡和周期的影響。
方法:
1.應(yīng)用 Realtime-PCR法檢測食管癌組織、癌旁組織以及食管癌細(xì)胞中LncRNA CARLo-5的表達(dá)。
2.應(yīng)用MTS法、Transwell遷移、Matrigel侵襲和劃痕愈合
2、實(shí)驗(yàn)檢測敲低/過表達(dá)CARLo-5基因?qū)κ彻馨┘?xì)胞增殖活性、侵襲和遷移能力的影響。
3.應(yīng)用流式細(xì)胞術(shù)檢測CARLo-5對KYSE30和KYSE180細(xì)胞周期和早期凋亡的影響。
4.應(yīng)用 MTS和流式細(xì)胞術(shù)檢測 CARLo-5在 KYSE30和 KYSE180細(xì)胞中對5氟尿嘧啶藥物敏感性的影響。
結(jié)果:
1.Realtime-PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,與癌旁組織相比,食管癌組織中CARLo-5表達(dá)水平顯
3、著上調(diào)(P<0.05);與正常食管上皮細(xì)胞相比,多種食管癌細(xì)胞中CARLo-5表達(dá)水平上調(diào)(P<0.05)。
2.MTS檢測結(jié)果顯示,敲低 CARLo-5基因可抑制 KYSE30和KYSE180細(xì)胞的增殖活性(P<0.05);而過表達(dá)CARLo-5基因?qū)YSE30和KYSE180細(xì)胞的增殖具有促進(jìn)作用(P<0.05)。Transwell和劃痕愈合實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,敲低 CARLo-5基因能抑制食管癌 KYSE30和 KYSE18
4、0細(xì)胞遷移和侵襲能力(P<0.05),過表達(dá)CARLo-5基因能夠促進(jìn)KYSE30和KYSE180細(xì)胞的遷移和侵襲能力(P<0.05)。
3.流式細(xì)胞術(shù)檢測結(jié)果顯示,與對照組相比,敲低CARLo-5基因后KYSE30和KYSE180細(xì)胞的早期凋亡率增高(P<0.05);G1期細(xì)胞比例均顯著增加(P<0.05),S期細(xì)胞比例均顯著降低(P<0.05)。
4.MTS分析結(jié)果顯示,敲低 CARLo-5基因可降低 KYSE3
5、0和KYSE180細(xì)胞對5氟尿嘧啶的藥物敏感性(P<0.05);流式細(xì)胞術(shù)法檢測結(jié)果顯示,過表達(dá)CARLo-5基因可降低5氟尿嘧啶處理后的KYSE30和KYSE180細(xì)胞凋亡率(P<0.05)。
第二部分: CARLo-5對食管癌細(xì)胞作用機(jī)制研究
目的:研究CARLo-5與蛋白和microRNA相互作用的機(jī)制從而探討CARLo-5發(fā)揮的促癌作用的可能機(jī)制。
方法:
1.應(yīng)用Western blot
6、法檢測敲低CARLo-5基因表達(dá)對食管癌KYSE30和KYSE180細(xì)胞周期、侵襲遷移、凋亡相關(guān)蛋白表達(dá)水平的影響。
2.應(yīng)用RNA pulldown實(shí)驗(yàn)、質(zhì)譜檢測、RIP實(shí)驗(yàn)及Western blot實(shí)驗(yàn)檢測CARLo-5能否與PTBP1結(jié)合。
3.應(yīng)用 MTS法、Transwell遷移法檢測敲低 PTBP1基因,過表達(dá)CARLo-5基因同時(shí)敲低PTBP1基因?qū)κ彻馨┘?xì)胞增殖活性和遷移能力的影響。
4.應(yīng)
7、用 Western blot法檢測食管癌細(xì)胞經(jīng)放線菌酮處理后,或經(jīng)Mg132聯(lián)合放線菌酮處理后,過表達(dá)CARLo-5基因?qū)TBP1蛋白表達(dá)水平的影響。
5.應(yīng)用Western blot法檢測敲低PTBP1基因?qū)YSE30和KYSE180細(xì)胞凋亡相關(guān)蛋白和代謝相關(guān)蛋白表達(dá)水平的影響。
6.應(yīng)用Realtime-PCR法檢測食管癌細(xì)胞中敲低和過表達(dá)CARLo-5基因后不同microRNA的表達(dá)變化,并篩選出差異顯著的
8、miR-218-5p進(jìn)行后續(xù)研究。
7.應(yīng)用MTS法、Transwell遷移、Matrigel侵襲和劃痕愈合實(shí)驗(yàn)檢測敲低/過表達(dá)miR-218-5p對食管癌細(xì)胞增殖活性、侵襲和遷移能力的影響。
8.應(yīng)用MTS法、Transwell遷移法檢測過表達(dá)CARLo-5基因同時(shí)敲低miR-218-5p對食管癌細(xì)胞增殖和遷移能力的影響。
9.應(yīng)用Realtime-PCR法檢測食管癌細(xì)胞中敲低和過表達(dá)miR-218-5p
9、后靶基因的表達(dá)變化,并篩選出差異顯著的靶基因進(jìn)行后續(xù)研究。
10.應(yīng)用Western blot法檢測敲低和過表達(dá)miR-218-5p后對KYSE30和KYSE180細(xì)胞ROBO1、BMI1、RELN蛋白表達(dá)水平的影響。
結(jié)果:
1.Western blot實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,敲低 CARLo-5可誘導(dǎo) KYSE30和KYSE180周期相關(guān)蛋白cyclinB1、cyclinD1、CDK2、CDK4表達(dá)水平降低,P2
10、1表達(dá)水平增高(P<0.05);侵襲遷移相關(guān)蛋白 MMP9和 MMP2表達(dá)水平降低(P<0.05);凋亡相關(guān)蛋白MCL-1表達(dá)水平降低(P<0.05), Caspase-3表達(dá)水平增高(P<0.05)。
2.RNA pulldown、聯(lián)合質(zhì)譜分析、RIP和Western blot實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示, CARLo-5在食管癌細(xì)胞中能夠與PTBP1蛋白相結(jié)合。
3.MTS法檢測結(jié)果顯示,與對照組相比,敲低 PTBP1基因可抑制
11、KYSE30和 KYSE180細(xì)胞增殖(P<0.05);Transwell遷移結(jié)果顯示,敲低PTBP1基因可抑制KYSE30和KYSE180細(xì)胞遷移能力(P<0.05)。
4.MTS法檢測結(jié)果顯示,敲低PTBP1基因能夠降低CARLo-5過表達(dá)對KYSE30和KYSE180細(xì)胞增殖的增強(qiáng)作用(P<0.05);Transwell遷移結(jié)果顯示,敲低 PTBP1基因能夠降低 CARLo-5過表達(dá)對 KYSE30和KYSE180細(xì)胞遷
12、移能力的增強(qiáng)作用(P<0.05)。
5.Western blot法分析結(jié)果顯示, KYSE30和KYSE180細(xì)胞經(jīng)放線菌酮處理后,與對照組相比,過表達(dá)CARLo-5可降低PTBP1降解程度(P<0.05)。
6.Western blot法分析結(jié)果顯示,KYSE30和KYSE180細(xì)胞經(jīng)MG132聯(lián)合放線菌酮處理后,與對照組相比,PTBP1蛋白表達(dá)水平無明顯差異。
7.Western blot實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,
13、敲低 PTBP1基因可促進(jìn) KYSE30和KYSE180細(xì)胞 PKM2蛋白水平降低, Mcl-1、PKM1蛋白水平升高(P<0.05)。
8.Realtime-PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,敲低和過表達(dá)CARLo-5后KYSE30和KYSE180細(xì)胞中miR-218-5p表達(dá)水平分別增高和降低(P<0.05)。
9.MTS法檢測結(jié)果顯示,敲低 miR-218-5p可促進(jìn) KYSE30和KYSE180細(xì)胞增殖活性(P<0.05)
14、;而過表達(dá)miR-218-5p對KYSE30和KYSE180細(xì)胞增殖具有抑制作用(P<0.05)。Transwell和劃痕愈合實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,敲低miR-218-5p表達(dá)能促進(jìn)KYSE30和KYSE180細(xì)胞遷移和侵襲能力,過表達(dá)miR-218-5p能抑制KYSE30和KYSE180細(xì)胞的遷移和侵襲能力(P<0.05)。
10.MTS法檢測結(jié)果顯示,敲低 miR-218-5p表達(dá)能夠部分降低CARLo-5過表達(dá)對KYSE30和K
15、YSE180細(xì)胞增殖的增強(qiáng)作用(P<0.05);Transwell遷移結(jié)果顯示,敲低 miR-218-5p表達(dá)能夠部分降低 CARLo-5過表達(dá)對KYSE30和KYSE180細(xì)胞遷移能力的增強(qiáng)作用(P<0.05)。
11.Realtime-PCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,敲低 miR-218-5p和過表達(dá)miR-218-5p后KYSE30和KYSE180細(xì)胞中ROBO1、BMI1、RELN蛋白表達(dá)水平分別增高和降低(P<0.05)。
16、> 12.Western blot實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,在 KYSE30和KYSE180細(xì)胞中敲低miR-218-5p和過表達(dá)miR-218-5p后可顯著影響ROBO1蛋白表達(dá)水平分別增高和降低(P<0.05),BMI1和RELN蛋白表達(dá)水平無明顯改變。
第三部分:CARLo-5對食管癌細(xì)胞裸鼠種植瘤的影響
目的:研究CARLo-5在體內(nèi)對食管癌增殖的影響。
方法:
1.構(gòu)建穩(wěn)定敲低CARLo-5的食管
17、癌細(xì)胞,進(jìn)行裸鼠皮下種植瘤實(shí)驗(yàn),并觀察種植瘤的生長情況。
2.應(yīng)用免疫組織化學(xué)法檢測裸鼠種植瘤組織中PTBP1的表達(dá)情況。
結(jié)果:
1.與對照組相比,sh-CARLo-5組裸鼠皮下種植瘤增長速度顯著下降(P<0.05)。
2.免疫組織化學(xué)結(jié)果顯示,敲低 CARLo-5組的裸鼠種植瘤組織中PTBP1的表達(dá)水平明顯低于對照組。
結(jié)論:
食管癌組織和細(xì)胞中CARLo-5的表達(dá)水平上調(diào)
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