mEGF8基因突變小鼠的lncRNA與mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)研究.pdf

1、lncRNA與某些特定疾病之間存在著顯著的關(guān)系,但現(xiàn)在lncRNA的研究處于起步階段，不過(guò)隨著高通量基因測(cè)序技術(shù)的發(fā)展，相信會(huì)有更多的關(guān)于lncRNA和疾病關(guān)系的秘密將被發(fā)現(xiàn)。另外，lncRNA與mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)的建立將會(huì)對(duì)研究?jī)烧唛g的相互作用提供一個(gè)嶄新的思路，這將幫助我們進(jìn)一步挖掘以及理解lncRNA的作用機(jī)制。
　　差異共表達(dá)分析（DCEA)能檢測(cè)出兩種不同狀態(tài)下的基因?qū)Φ淖兓瑤椭覀兲骄咳洲D(zhuǎn)錄機(jī)制中的底層表型變化。在

2、此基礎(chǔ)上增加的差異調(diào)控分析算法能通過(guò)利用已知的小鼠轉(zhuǎn)錄因子和靶基因的調(diào)控關(guān)系，鑒定差異共表達(dá)基因及基因?qū)Φ恼{(diào)控因子。本文利用的對(duì)照組是mEGF8基因突變小鼠和正常小鼠，通過(guò)探究這兩種小鼠的整體基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的差別，并對(duì)比現(xiàn)存靶向基因庫(kù)找出 mEGF8基因的關(guān)鍵調(diào)控因子；與此同時(shí)，由于實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的來(lái)源方式不同，還可以通過(guò)最后結(jié)果來(lái)分析哪種數(shù)據(jù)來(lái)源方式更適合此種方法，這對(duì)以后的實(shí)驗(yàn)也具有指導(dǎo)作用。
　　本文首先描述了lncRNA和差異共表