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文檔簡介
1、為了研究低溫脅迫對中華鱉(Pelodiscus sinensis)早期炎性因子IL6腸道表達(dá)的影響,本論文首先細(xì)致劃分了中華鱉的腸道。采用形態(tài)學(xué)觀察、組織切片的方式研究了中華鱉的九段腸道。使用已經(jīng)在哺乳動物和魚類的腸道中報(bào)道的9個基因,從功能上區(qū)分中華鱉腸道各區(qū)段。其次,為研究腸道部分的免疫功能,聚焦于免疫因子il6,在克隆了中華鱉il6的cDNA全長后,從啟動子、基因結(jié)構(gòu)、共線性關(guān)系、相似性分析、系統(tǒng)發(fā)育和蛋白結(jié)構(gòu)等方面對其進(jìn)行生物信
2、息學(xué)分析;采用 qPCR手段進(jìn)行了組織表達(dá)模式分析。最后,為了探究il6免疫功能,利用免疫刺激劑(LPS、Con A和PolyI:C)在體外刺激脾臟原代細(xì)胞的實(shí)驗(yàn);為了探究低溫脅迫對il6的影響,我們采用兩個溫度(25℃,15℃)、兩種細(xì)菌(革蘭氏陰性與陽性菌)體內(nèi)攻毒的方式從5個時間點(diǎn)(6h,12h,24h,72h和7d)來檢測il6在腸道以及脾臟中的表達(dá)變化情況。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:
1.傳統(tǒng)手段與分子生物學(xué)方法相結(jié)
3、合對中華鱉腸道的劃分
根據(jù)標(biāo)記分子在各區(qū)段的表達(dá)情況,對比形態(tài)學(xué)、組織學(xué)觀察分析得到,從S1到 S3(從腸道起始占總長度的29.9%的位置,29.9%)的區(qū)域相當(dāng)于哺乳動物十二指腸,而S4(40.2%)到S5(65.4%)、S8(92.7%)與 S9分別相當(dāng)于哺乳動物回腸和大腸。而對于S6(81.3%)和S7(87.3%),其功能多樣,并且取決于功能基因。它們可能是小腸和大腸之間的過渡區(qū)或者屬于大腸部分。
2.中華鱉
4、il6的克隆及組織表達(dá)模式分析
啟動子分析顯示,il6的啟動子含有保守的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)。il6 cDNA全長為2069bp,開放閱讀框長度為663bp,而il6ns cDNA全長為2194bp,開放閱讀框長度為615bp,兩者差異僅限于信號肽位置(il6編碼信號肽的序列中插入了一段125bp的序列導(dǎo)致il6ns不編碼信號肽)。中華鱉il6與鳥類、哺乳類相比均有保守的共線性關(guān)系,且相似性一致性較高。中華鱉il6與哺乳類、魚類的
5、基因結(jié)構(gòu)類似,而中華鱉il6ns與鳥類的基因結(jié)構(gòu)相似。蛋白二級結(jié)構(gòu)主要包括α-螺旋、延伸鏈、無規(guī)則卷曲、β-轉(zhuǎn)角。三級結(jié)構(gòu)包含IL-6/G-CSF/MGF家族特征序列(C–X(9)–C–X(6)–G–L–X(2)–Y–X(3)–L),序列末端還具有aataaa加尾信號等。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示,與鳥類首先聚類,其次是哺乳類,最后是魚類。同時,以人 IL6蛋白為模型構(gòu)建了中華鱉 IL6蛋白的3D結(jié)構(gòu)模型。組織表達(dá)模式分析結(jié)果則顯示,兩個il6在
6、體內(nèi)的分布差異較大。
3.低溫脅迫對中華鱉腸道免疫因子il6 mRNA表達(dá)的影響
il6/il6ns兩個轉(zhuǎn)錄本在金黃色葡萄球菌或嗜水氣單胞菌脅迫后,表達(dá)量隨時間推移整體均呈現(xiàn)先升后降的趨勢,且 il6的表達(dá)受低溫脅迫的影響表現(xiàn)出“應(yīng)答延遲”和“表達(dá)增強(qiáng)”的現(xiàn)象。此外還發(fā)現(xiàn),在受到細(xì)菌入侵后,il6的mRNA表達(dá)量對細(xì)菌的應(yīng)答反應(yīng)要強(qiáng)于 il6ns的。體外實(shí)驗(yàn)表明,脾臟細(xì)胞在 PolyI: C的刺激下6h il6/il
7、6ns表達(dá)極顯著上調(diào)(P<0.01),在24h和48h表達(dá)量迅速回落。但是,在Con A和LPS的刺激下,兩個基因在各個時刻均沒有顯著性變化。
綜合以上研究結(jié)果得出如下結(jié)論:
1.通過檢測中華鱉中一些與哺乳類以及斑馬魚同源的標(biāo)記分子,可以得到一個與傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)及組織學(xué)不同的、更為精確的中華鱉腸道劃分結(jié)果。
2.克隆得到了兩個中華鱉的il6的cDNA序列,并對其進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。彌補(bǔ)了爬行類il6研究的空白
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