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文檔簡介
1、目的:β1,3-N-乙酰氨基葡萄糖轉移酶(β3GnTs)家族是糖基轉移酶的重要成員。其中β1,3葡萄糖基轉移酶8(β3Gn-T8),又名β1,3半乳糖基轉移酶7(β3GalT7),是本課題組首先在國際上克隆獲得的人類糖基轉移酶新基因。本論文通過生物信息學方法分析了β3Gn-T8上游調控序列啟動子區(qū),發(fā)現β3Gn-T8啟動子區(qū)有多個c-Jun結合位點。為了進一步闡明β3GnT8與c-jun的相關性,本研究以c-jun中等表達和β3Gn-T
2、8高表達的人胃癌SGC-7901細胞株為研究對象,探討胃癌SGC-7901細胞株中轉錄因子c-Jun對糖基轉移酶β3Gn-T8的轉錄調控。
方法:
1、應用三種生物信息學軟件對β3Gn-T8啟動子區(qū)的轉錄因子c-Jun的結合位點進行預測,并構建c-Jun基因的正義表達載體,經酶切、測序鑒定重組質粒。
2、根據預測結果構建β3Gn-T8啟動子區(qū)系列截短體,應用雙熒光素酶報告基因技術分析β3Gn-T
3、8啟動子區(qū)系列截短體的轉錄激活活性。
3、設計并構建4條針對c-Jun mRNA靶點的siRNA真核表達質粒載體pGPU6/GFP/Neo-shRNA,同時設計shRNA無關序列作為陰性對照(negativecontrol,NC),并構建表達載體;以脂質體法轉染胃癌SGC-7901細胞,熒光顯微鏡觀察以最高轉染效率和最低細胞死亡率為原則,優(yōu)化轉染條件,根據優(yōu)化的條件將pGPU6/GFP/Neo-shRNA質粒轉染胃癌SGC
4、-7901細胞,應用RT-PCR和Western blot方法在mRNA水平和蛋白水平上檢測四組pGPU6/GFP/Neo-shRNA對c-Jun基因表達的抑制作用,篩選出干擾效果最好的一組表達載體用于后續(xù)實驗。
結果:
1、生物信息學分析:AliBaba2.1、PATCH和TESS三種在線軟件預測結果分析β3Gn-T8啟動子區(qū)存在著c-Jun基因的多個結合位點。
2、雙熒光素酶報告基因結果顯示
5、:c-Jun對β3Gn-T8啟動子區(qū)具有轉錄激活作用,其中啟動子區(qū)—561/+8片段的轉錄活性最高,且對c-Jun呈劑量依賴性。
3.pGPU6/GFP/Neo-shRNA重組質粒表達載體構建:靶向c-Jun mRNA的四個pGPU6/GFP/Neo-shRNA重組質粒表達載體經酶切、測序鑒定,證實載體構建成功;重組質粒表達載體通過脂質體介導轉染人胃癌SGC-7901細胞,在熒光顯微鏡下觀察到綠色熒光,RT-PCR和Wes
6、tern blot結果證實pGPU6/GFP/Neo-shRNA-1949對c-Jun表達抑制的效果最好。
結論:
1、生物信息學軟件預測結果顯示β3Gn-T8啟動子區(qū)存在著轉錄因子c-Jun的多個結合位點。
2、雙熒光素酶報告基因結果顯示c-Jun對β3Gn-T8啟動子區(qū)具有轉錄激活作用,啟動子區(qū)—561/+8片段的轉錄活性最高,且對c-Jun呈劑量依賴性。
3.針對c-Jun基
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