簡介：分類號分類號R7351密級密級表觀遺傳學(xué)表觀遺傳學(xué)沉默沉默DACH1抑制抑制TGFΒ信號通路信號通路并促進(jìn)食管癌促進(jìn)食管癌的生長生長EPIGEICSILENCINGDACH1PROMOTESESOPHAGEALCANCERGROWTHBYINHIBITINGTGFΒSIGNALING作者姓名吳亮學(xué)科專業(yè)內(nèi)科學(xué)（消化系?。?dǎo)師郭明洲研究員答辯委員會主席論文答辯日期二〇一四年五月二十八日院校地址北京市復(fù)興路28號郵政編碼100853解放軍醫(yī)學(xué)院博士學(xué)位論文目錄英文縮略詞表1中文摘要2英文摘要4前言6第一部分DACH1在食管癌細(xì)胞系中的表達(dá)及甲基化改變111實(shí)驗(yàn)材料112實(shí)驗(yàn)方法133結(jié)果204討論225小結(jié)24第二部分DACH1在人食管癌組織中的表達(dá)及甲基化改變251實(shí)驗(yàn)材料252實(shí)驗(yàn)方法273結(jié)果324討論355小結(jié)36第三部分DACH1在食管癌中的功能研究371實(shí)驗(yàn)材料372實(shí)驗(yàn)方法403結(jié)果494討論535小結(jié)55第四部分DACH1對TGFΒ信號通路的影響561實(shí)驗(yàn)材料562實(shí)驗(yàn)方法583結(jié)果604討論625小結(jié)63結(jié)論64參考文獻(xiàn)65文獻(xiàn)綜述69攻讀學(xué)位期間文章發(fā)表情況78致謝79

簡介：我國藝術(shù)院校和工科院校相既在上世紀(jì)80年代初期開始設(shè)立工業(yè)設(shè)計(jì)學(xué)科，走上了對產(chǎn)品造型設(shè)計(jì)的教學(xué)體系，涌現(xiàn)了大量對工業(yè)設(shè)計(jì)史的研究書籍文獻(xiàn)。這些文獻(xiàn)對設(shè)計(jì)工作者了解世界工業(yè)設(shè)計(jì)發(fā)展史，啟發(fā)設(shè)計(jì)史思維方面起作重大的作用。但是這些設(shè)計(jì)史文獻(xiàn)都是對世界設(shè)計(jì)史作縱向概括性論述，而對于設(shè)計(jì)發(fā)展過程中的橫向遺傳基因鏈卻未作更詳細(xì)的論述與分析，對于為什么會在設(shè)計(jì)發(fā)展過程中浮現(xiàn)歷史產(chǎn)品的影子以及為什么會出現(xiàn)這樣風(fēng)格那樣風(fēng)格的反復(fù)與輪回均未作分析說明。因而，研究產(chǎn)品設(shè)計(jì)史的遺傳基因鏈，以更好地把握歷史和現(xiàn)在的關(guān)系成為當(dāng)前設(shè)計(jì)史教育中一項(xiàng)迫切的任務(wù)。一從社會學(xué)和心理學(xué)的角度來分析產(chǎn)品設(shè)計(jì)中的遺傳學(xué)我們知道，當(dāng)一種社會形態(tài)不適應(yīng)生產(chǎn)力發(fā)展的時候，必然會被另一種社會形態(tài)所取代，社會形態(tài)也會在原有基礎(chǔ)上得到進(jìn)一不發(fā)展；同樣，當(dāng)一種設(shè)計(jì)風(fēng)格、流派變得呆板、干巴、千篇一律時，也會引起人們的不滿，受到大眾的抵制，而大眾在這個時候又會把目光拋向一些新穎并具有過去影子的新產(chǎn)品，以滿足自己的求異心理和懷舊情懷。二、從文化的角度分析產(chǎn)品設(shè)計(jì)中的遺傳學(xué)產(chǎn)品設(shè)計(jì)是一種社會創(chuàng)造活動，是在一定社會環(huán)境中進(jìn)行的，因而必將受到環(huán)境中的人文、歷史等因素的影響，會辨證地繼承該環(huán)境中歷史長期以來遺留下來的優(yōu)秀文化；而現(xiàn)在產(chǎn)品設(shè)計(jì)的優(yōu)秀成果，會作為一種當(dāng)代歷史的沉淀物流傳下去，進(jìn)一步指導(dǎo)將來地設(shè)計(jì)，形成新的設(shè)計(jì)文化。如此不斷的延續(xù)、發(fā)展，從而推動整個社會的向前發(fā)展。近年來設(shè)計(jì)在全球范圍內(nèi)得到了迅速的發(fā)展，各國根據(jù)本國的情況走上不同的設(shè)計(jì)文化道路日本針對本國貧乏的的能源背景形成節(jié)能、價廉、體積小的設(shè)計(jì)文化方向；斯堪的納維亞國家結(jié)合自己精湛的手工藝傳統(tǒng)特色形成獨(dú)樹一幟的區(qū)域個性設(shè)計(jì)特色；中國人面對祖先五千年的悠悠歷史文化，在設(shè)計(jì)中該如何繼承，如何去發(fā)展三、產(chǎn)品設(shè)計(jì)中的遺傳學(xué)要研究工業(yè)設(shè)計(jì)史就必須了解建筑設(shè)計(jì)史，了解建筑設(shè)計(jì)史中的各種風(fēng)格和流派，因?yàn)榻ㄖO(shè)計(jì)和工業(yè)設(shè)計(jì)總是有著千絲萬縷的關(guān)系，在西方現(xiàn)代主義風(fēng)卷過全球之后，世界建筑正向一體化方向發(fā)展，專家呼吁地方建筑必須同地方歷史特色結(jié)合起來，以形成自己的獨(dú)特文化。就拿重慶來說吧，一座座的吊角樓正在消失，取而代之的是一幢幢四方體的高樓大廈。我們要改變“窮”、“舊”的面貌是應(yīng)該的，但我們又不能把老祖宗的東西一股兒全拋棄，那樣我們會被子孫罵后腦的。因此，我們必須學(xué)會怎樣把歷史和現(xiàn)代結(jié)合起來，正確把握設(shè)計(jì)中的遺傳學(xué)。從現(xiàn)代設(shè)計(jì)開始就有兩種造型形態(tài)（理性形態(tài)與曲面形態(tài)）共同構(gòu)成產(chǎn)品外觀造型形態(tài)。兩種形態(tài)你唱罷來我登場，彼此斗爭，同時又促進(jìn)對方的向前發(fā)展，當(dāng)理性形態(tài)占據(jù)主流地位時，曲面形態(tài)便退后次要位置完善自己，等待理性形態(tài)發(fā)展到頂峰下滑時，它會又重振旗鼓，以嶄新的面貌逐步又占據(jù)設(shè)計(jì)的主流，直到自己衰退時，又讓理性形態(tài)重新登場，如此反復(fù)與輪回，共同推動著設(shè)計(jì)形態(tài)的向前發(fā)展。從近幾年國際著名車展上的概念車可以看出“新鋒銳”和“復(fù)古風(fēng)”正成為兩種主要的產(chǎn)品設(shè)計(jì)造型語言。新鋒貌的棱線風(fēng)格可以看作是對60年代“硬邊藝術(shù)”及包豪斯理性風(fēng)格的回歸與發(fā)展，它繼承了后兩者的棱線遺傳基因；而“復(fù)古風(fēng)”更是遺傳了三、四十年代汽車造型的圓潤古典風(fēng)格，形成了新的造型語言。

簡介：胚胎植入前遺傳學(xué)診斷（PREIMPLANTATIONGEICDIAGNOSIS，PGD）胚胎植入前遺傳學(xué)篩查（PREIMPLANTATIONGEICSCREENING，PGS）是在輔助生殖技術(shù)（ASSISTEDREPRODUCTIVETECHNIQUES，ART）時，針對于有特定遺傳疾病風(fēng)險的夫婦，對體外受精（INVITROFERTILIZATION，IVF）胚胎進(jìn)行活檢，采用多種技術(shù)進(jìn)行遺傳學(xué)診斷，以選擇正常胚胎進(jìn)行移植，提高臨床妊娠率和臨床分娩率，降低流產(chǎn)率，是輔助生殖技術(shù)與分子生物學(xué)技術(shù)相結(jié)合而形成的一種產(chǎn)前診斷技術(shù)。PGS是對植入前的胚胎進(jìn)行染色體非整倍進(jìn)行檢測，目前所用的PGDPGS技術(shù)有聚合酶鏈反應(yīng)（POLYMERASECHAINREACTION，PCR），熒光原位雜交（FLUESCENCEINSITUHYBRIDIZATION，F(xiàn)ISH），全基因組擴(kuò)增技術(shù)（WHOLEGENOMEAMPLIFICATION，WGA），比較基因組雜交芯片（COMPARATIVEGENOMICHYBRIDIZATIONARRAYS，ACGH），單核苷酸多態(tài)性芯片（SINGLENUCLEOTIDEPOLYMPHISMARRAYS，SNP），二代測序技術(shù)（NEXTGENERATIONSEQUENCINGTECHNOLOGY，NGS）等。WGA是一種能對微量甚至是極微量DNA進(jìn)行有效擴(kuò)增的技術(shù)，其擴(kuò)增產(chǎn)物可被多種常規(guī)分子技術(shù)用于下游的遺傳學(xué)分析。盡管現(xiàn)有多種被優(yōu)化的WGA技術(shù)，但本質(zhì)上都可歸于擴(kuò)增前引物延伸反應(yīng)PRIMEREXTENSIONPREAMPLIFICATION，PEP、簡并寡核苷酸引物PCRDEGENERATEOLIGONUCLEOTIDEPRIMERPCR，DOPPCR和多重置換擴(kuò)增MULTIPLEDISPLACEMENTAMPLIFICATION，MDA1這三種方法。WGA技術(shù)已在臨床廣泛應(yīng)用，如循環(huán)腫瘤細(xì)胞的基因分型2，法醫(yī)樣本的鑒定，PGDPGS胚胎的染色體和單基因病的基因分析等。通過ART所獲得的胚胎發(fā)生染色體異常的可能性較高，這是導(dǎo)致胚胎植入失敗、孕早期胎停育及自發(fā)性流產(chǎn)的重要原因。在PGDPGS領(lǐng)域，ACGH和SNP芯片因能夠檢測胚胎24條染色體且具有較高的可靠性和準(zhǔn)確性，而被廣泛應(yīng)用于鑒別整倍體與非整倍體胚胎34。無論是芯片技術(shù)還是NGS平臺，都依賴于WGA技術(shù)這一關(guān)鍵步驟將胚胎活檢樣本的微量DNA高保真擴(kuò)增，產(chǎn)生的足量DNA能夠用于芯片的雜交或NGS的建庫。關(guān)于WGA技術(shù)在PGDPGS領(lǐng)域的應(yīng)用多有研究，但是基于現(xiàn)有NGS平臺，針對于不同WGA技術(shù)在PGDPGS領(lǐng)域應(yīng)用的橫向研究未見報(bào)道。在PGDPGS的臨床實(shí)踐中，ACGH和SNP芯片在染色體異常的檢測方面顯現(xiàn)出較高的可靠性和準(zhǔn)確性。但是，現(xiàn)有的商業(yè)化的芯片平臺在探針設(shè)計(jì)、探針定制以及染色體探針密度分布方面存在顯著不同，此外，某些平臺因檢測分辨率較低難以檢測出具有顯著臨床意義的IVF胚胎染色體異常。另外，SNP芯片在檢測染色體三體和其它由于未減數(shù)分裂重組導(dǎo)致的染色體重復(fù)方面也存在不足。在臨床實(shí)踐中，從胚胎樣本活檢到出具檢測報(bào)告，芯片平臺工作流程繁瑣，且需對DNA進(jìn)行標(biāo)記、雜交。因芯片及相關(guān)試劑費(fèi)用高昂，探針數(shù)量有限等客觀因素，致使芯片檢測效率較低。而NGS結(jié)合強(qiáng)有效的生物信息學(xué)算法，使對IVF胚胎染色體異常的檢測更加全面且更加經(jīng)濟(jì)有效，為PGDPGS領(lǐng)域的發(fā)展帶來新機(jī)遇。我們將NGS技術(shù)與生物信息學(xué)聯(lián)合應(yīng)用開發(fā)出適用于單細(xì)胞PGS分析的高分辨率拷貝數(shù)變異測序技術(shù)（COPYNUMBERVARIATIONSEQUENCING，CNVSEQ），以解決胚胎活檢樣本的CNV檢測問題，同時將基于PCR的SUREPLEXWGA方法引入現(xiàn)有PGS流程，評估其檢測染色體異常的效能，使CNVSEQ的臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用成為可能，并有望取代ACGH及SNP芯片在PGS領(lǐng)域的應(yīng)用，對胚胎染色體異常進(jìn)行精準(zhǔn)檢測。目的1依托所研發(fā)的CNVSEQ技術(shù)平臺，對三種WGA方法以PCR為基礎(chǔ)的SUREPLEX和MALBAC與以MDA為基礎(chǔ)的REPLIG，從擴(kuò)增覆蓋度、敏感性、特異性和可重復(fù)性等方面進(jìn)行對比研究。希望通過我們的研究，將具有擴(kuò)增優(yōu)勢的WGA方法引入現(xiàn)有的測序流程。2分別用回顧性研究和雙盲研究，以ACGH為金標(biāo)準(zhǔn)，利用CNVSEQ檢測染色體非整倍性和非平衡易位，全面評估其檢測染色體異常的效能，并進(jìn)一步將CNVSEQ技術(shù)臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用至PGS領(lǐng)域。方法1選取6名具有臨床表型的染色體疾病患者為研究對象，1名正常核型的男性為陰性對照，收集研究對象的外周血，提取基因組DNA（GENOMICDNA，GDNA），純化后梯度稀釋至15PG，顯微操作從患者的凍融外周血中分離單細(xì)胞，分別在稀釋GDNA單細(xì)胞水平和單細(xì)胞水平，對SUREPLEX、MALBAC和REPLIG三種WGA方法全基因組覆蓋度、敏感性、特異性和可重復(fù)性等方面進(jìn)行對比研究。2選取24例經(jīng)ACGH檢測的WGA產(chǎn)物，其中10例WGA產(chǎn)物用于回顧性研究，14例WGA產(chǎn)物用于雙盲研究，我們以ACGH為金標(biāo)準(zhǔn)，驗(yàn)證CNVSEQ在檢測染色體非整倍體和非平衡易位方面的效能，通過直接比較ACGH和CNVSEQ對同一例胚胎單卵裂球活檢的WGA產(chǎn)物的檢測結(jié)果，來驗(yàn)證CNVSEQ的檢測效能。選擇3對需行PGS檢測的夫婦進(jìn)行初步的臨床轉(zhuǎn)化。結(jié)果1從技術(shù)方法、產(chǎn)量、濃度、平均擴(kuò)增產(chǎn)物長度、所需時間、操作難易程度等方面對SUREPLEX、MALBAC和REPLIG這三種WGA方法進(jìn)行了比較，SUREPLEX和MALBAC在可操作性上確有一定優(yōu)勢。2SUREPLEX和MALBAC這兩種基于PCR的WGA方法較MDA具有更好的基因組覆蓋度、較少的擴(kuò)增偏倚。3針對于低起始模板量的DNA，無論是15PGGDNA還是單細(xì)胞，基于PCR的WGA方法在擴(kuò)增覆蓋度、穩(wěn)定性、敏感性、特異性和可重復(fù)性等方面均優(yōu)于不依賴PCR的MDA技術(shù)。4回顧性研究和雙盲研究驗(yàn)證了CNVSEQ在檢測染色體非整倍體和非平衡易位方面的效能，結(jié)果證實(shí)CNVSEQ在對染色體CNV的檢測方面具有高準(zhǔn)確率和特異性。5CNVSEQ初步實(shí)現(xiàn)其臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用，已成功在3對不孕不育夫婦實(shí)施，其中一對夫婦在選擇染色體整倍體胚胎植入后分娩一健康女嬰，使不孕不育患者真正受益。結(jié)論1針對低起始模板量的DNA，無論是稀釋GDNA單細(xì)胞水平還是單細(xì)胞水平，基于PCR的SUREPLEX和MALBACWGA方法在擴(kuò)增覆蓋度、穩(wěn)定性、敏感性、特異性和可重復(fù)性等方面均優(yōu)于不依賴PCR的REPLIGMDA技術(shù)，聯(lián)合使用CNVSEQ技術(shù)能有效對臨床病理性CNVS做出診斷。2CNVSEQ在對染色體CNV的檢測方面具有高準(zhǔn)確率和特異性，隨著NGS技術(shù)的迅速發(fā)展，其有望取代ACGH及SNP芯片在PGS領(lǐng)域的應(yīng)用，對胚胎染色體異常進(jìn)行精準(zhǔn)檢測。

簡介：燃料乙醇是第一個實(shí)現(xiàn)大規(guī)模生產(chǎn)應(yīng)用的生物質(zhì)可再生能源，主要通過釀酒酵母發(fā)酵轉(zhuǎn)化淀粉和糖類原料獲得。當(dāng)前，燃料乙醇的生產(chǎn)應(yīng)用仍面臨諸多資源與成本制約因素，主要集中在原料受到土地和水資源限制、生產(chǎn)過程能耗高及廢料處理等難題。針對燃料乙醇的生產(chǎn)現(xiàn)狀，世界各國學(xué)者和工程技術(shù)人員認(rèn)為高溫發(fā)酵、濃醪發(fā)酵和非糧纖維乙醇三種發(fā)酵技術(shù)是提升燃料乙醇經(jīng)濟(jì)與社會效益的有效途徑。但這幾種發(fā)酵技術(shù)的運(yùn)用對釀酒酵母菌株耐受環(huán)境中生長和發(fā)酵抑制因子（如高溫、高滲、高乙醇濃度和纖維原料抑制物乙酸、糠醛及酚類物質(zhì)）的能力提出了更苛刻的要求。研究釀酒酵母對這些脅迫因子的耐性機(jī)制，以及選育具高抗逆性和乙醇轉(zhuǎn)化率的釀酒酵母菌株成為了突破這些新發(fā)酵技術(shù)瓶頸的關(guān)鍵所在，也是一項(xiàng)具有重大理論與實(shí)際應(yīng)用意義的科學(xué)研究課題。本文主要通過比較功能基因組學(xué)研究方法，揭示不同釀酒酵母菌株間的基因組差異，以及這些差異如何影響菌株的耐性和發(fā)酵性能。同時也利用基因組變構(gòu)和基因工程等方法來選育性能改進(jìn)的釀酒酵母菌株。主要研究內(nèi)容和結(jié)果如下1、燃料乙醇工業(yè)菌株的耐受性和發(fā)酵性能比較選取實(shí)驗(yàn)室菌株Z1和乙醇發(fā)酵工業(yè)上常用的釀酒酵母Z2Z7系列菌株，研究比較其對高溫等脅迫抑制因子的耐受性及其在高溫、濃醪和纖維素水解液三種條件下的發(fā)酵性能。結(jié)果表明，即便是同一生產(chǎn)用途的釀酒酵母菌株在多種脅迫耐受性和發(fā)酵性能上存在顯著差別、各具優(yōu)勢。相比之下，菌株Z7（ZT系列）在濃醪條件下的乙醇產(chǎn)量和糖醇轉(zhuǎn)化率上要明顯優(yōu)于其它常用工業(yè)菌株，菌株Z5在高溫條件下乙醇產(chǎn)量最高，菌株Z3對纖維素水解液中抑制物耐性要高于其它菌株。2、比較功能基因組學(xué)指導(dǎo)菌株個性化育種對工業(yè)菌株YJS329Z5和實(shí)驗(yàn)室菌株BYZ1進(jìn)行表型比較分析，發(fā)現(xiàn)Z5在對多種環(huán)境脅迫因子耐性和發(fā)酵性能上要優(yōu)于BYZ1。兩菌株在海藻糖、質(zhì)膜成分和抗氧化因子等生化因子的含量上也有明顯差異。脈沖場凝膠電泳PFGE和比較基因組雜交結(jié)果表明，Z5是一株核型規(guī)則的二倍體菌株。利用二代高通量測序技術(shù)對Z5的一株單倍體菌株YJSH1進(jìn)行深度測序和從頭組裝，并與S288C基因組進(jìn)行了SNP、進(jìn)化關(guān)系、INDEL和F的差異分析。利用RNASEQ研究了該兩株菌株的表達(dá)譜，在基因表達(dá)水平上對兩株菌株的表型差異進(jìn)行機(jī)制探討。重點(diǎn)分析了轉(zhuǎn)錄因子MSN24，HAP1，HSF1，和ARR1自身表達(dá)差異原因和對整個表達(dá)譜和菌株表型的影響。同時結(jié)合基因組序列信息舉例分析了一些SNPS、INDELS和基因拷貝數(shù)變化對基因表達(dá)的影響。在了解Z5基因組信息以及一些序列變異對表型的影響后，用基因操作的方法對Z5進(jìn)行針對性的分子改造，并提出了比較功能基因組學(xué)指導(dǎo)微生物個性化育種的育種新理念。3、基因組結(jié)構(gòu)變異對菌株表型的影響及其機(jī)制利用PFGE和比較基因組雜交對菌株Z27進(jìn)行了基因組結(jié)構(gòu)比較，結(jié)果顯示Z3和Z5是二倍體菌株，Z2，Z4，Z6和Z7是非整體菌株，在多條染色體上發(fā)生大片段的擴(kuò)增現(xiàn)象。綜合菌株Z27的DNA序列進(jìn)化關(guān)系、表型和生理生化的分析的結(jié)果，我們推測基因組結(jié)構(gòu)變異在這些菌株表型分化中的作用可能比序列差異的作用大。通過對CUP1和YFL052W等特定基因的過表達(dá)和敲除發(fā)現(xiàn)這些基因的拷貝數(shù)變化會對菌株的表型產(chǎn)生顯著影響。此外，對Z7和Z5在生長和發(fā)酵條件下的表達(dá)譜和生理生化比較研究發(fā)現(xiàn)，“非整倍壓力應(yīng)激”可能是這些菌株脅迫耐性和發(fā)酵性能差異的重要機(jī)制。4、通過基因組結(jié)構(gòu)變異改進(jìn)菌株的復(fù)雜性狀對Z7進(jìn)行多輪的基因組重構(gòu)后，獲得濃醪發(fā)酵性能顯著提高的SV突變株，證明了基因組變構(gòu)能有效改進(jìn)酵母菌株的復(fù)雜性狀。其中一株突變株ZTS3較Z7在乙醇產(chǎn)量上提高66％，而且對乙醇、H2O2和高溫的耐受性也明顯改進(jìn)。ZTS3相對于Z7來說在多條色體上發(fā)生了大片段的拷貝數(shù)增多或減少。我們證明了基因YFL052W拷貝數(shù)和表達(dá)量的增加是ZTS3多種脅迫耐性提高的一個重要原因。對ZTS3和Z7所有差異基因的功能分類及相關(guān)生理代謝分析發(fā)現(xiàn)，ZTS3的非整倍壓力應(yīng)激反應(yīng)要少于Z7，具體反映在參于核苷酸等小分子的合成、細(xì)胞增殖、海藻糖和抗氧化因子等抗逆因子合成基因在ZTS3上調(diào)參于蛋白折疊、轉(zhuǎn)運(yùn)和定位、能量代謝和離子平衡等過程的基因在ZTS3中發(fā)生下調(diào)。因此推斷特定基因拷貝數(shù)的變化和非整倍性的調(diào)整是基因組變構(gòu)改進(jìn)菌株復(fù)雜性狀的兩種重要機(jī)制。

簡介：天津大學(xué)碩士學(xué)位論文X849001基于神經(jīng)遺傳學(xué)習(xí)算法的模型優(yōu)化研究STUDYOFTHEMODELINGOPTIMIZATIONBASEDONNEURALNETWORKANDGA專業(yè)管理科學(xué)與工程研究生杜健指導(dǎo)教師李波副教授天津大學(xué)管理學(xué)院2005年1月ABSTRACTTHEENSEMBLELEARNINGISAHOTSPOTINTHEINTELLIGENTLEARNINGFIELDITHASBEENPAIDATTENTIONFROMITS’VERYBEGINNINGANDHASBEENUSEDSUCCESSFULLYINMANYFIELDSBECAUSEOFITS’GOODPERFORMANCEANDUSABILITYTHECOMBINATIONOFENSEMBLEALGORITHMSANDUNSTABLELEARNERSHASSHOWNIMPRESSIVEEFFECTBOTHINACCURACYANDSTABILITYATTHESAMETIME，PARTHENOGENETICALGORITHMISAHOTSPOTDUETOITS’MATURITYITISADOREDBYSOMANYRESEARCHERSDUETOITS’ABILITYTOSOLVECOMBINATIONPROBLEMSESPECIALLYPROBLEMSINLARGESCALEBASEDONTHEALGORITHMSDISCUSSEDABOVE，THISARTICLEDOESSOMEUSEFULSTUDYINSOMEASPECTSSOMETHINGWASDONEASBELOW1SOMEEXPERIMENTSWEREDONETOTESTIFYTHEVALIDITYOFTHEBOOSTINGALGORITHMBASEDONTHESTUDYOFTHEENSEMBLEALGORITHMTHEEXPERIMENTSWEREBASEDONTHEUCIDATABASE，ANDTHEPURPOSEISTOPROVETHEGOODPERFORMANCESOFBOOSTINGINSOMEASPECTSASSERVICEABILITY；STABILITYTHEABILITYOFPARAMETEROPTIMIZATIONATLAST，WEDISCUSSTHESERVICEABILITYAND“OVERFITTINGPROBLEM”FROMTHEPOINTOFMARGIN，ANDSHOWITININTUITIONISTICGRAPHICS2BASEDONTHESTUDYABOVE，WEPUTFORWARDANEWMETHODTOULTERIORLYOPTIMIZEPARAMETERSOFBOOSTINGALGORITHMHERETHEMETHODSWEUSEDAREGENETICALGORITHMANDLSEALGORITHMANDTHESIMULATIONRESULTSSHOWTHATBOTHMETHODSCARLIMPROVETHEPERFORMANCEMO∞3ASTOPARTHENOGENETICALGORITHM，WEBRINGFORWARDANIMPROVEDALGORITHMBASEDONPARTHENOGENETICALGORITHMTOSOLVETHECSPPROBLEMANEWMETHODWASBROUGHTFORWARDTOSIMPLI匆THECODINGPROCESS，ATTHESAMETIME，ANOPERATORWASINTRODUCEDTOHEIPTOFINDTHEBESTGLOBALSOLUTIONANDTHEALGORITHMHASBEENTESTIFIEDTOBEAEXCELLENTONETHROUGHTHETESTINMORETHANONEINDUSTRIALENTERPRISESALLPROOFSSHOWTHATITISAGOODMETHODTOSOLVETHECSPPROBLEMBOTHINTHECUTTINGACCURACYANDCALCULATINGEFFICIENCYKEYWORDSENSEMBLELEARNING，PARTHENOGENETICALGORITHMCSPPROBLEM，NEURALNETWORKBOOSTINGBAGGING

簡介：該文的研究對象是基于遺傳算法的數(shù)據(jù)挖掘方法及其這些方法在生物信息學(xué)中的應(yīng)用該文的研究分為相互關(guān)聯(lián)的四個部分該文針對目前廣泛采用的EMBL核酸序列數(shù)據(jù)庫提出了有針對性的聯(lián)機(jī)分析處理OLAP實(shí)現(xiàn)方案第二利用遺傳算法改進(jìn)傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)挖掘方法在這方面該文提出了基于遺傳算法的K均值聚類分析方法并把該方法與傳統(tǒng)的K均值聚類和基于單純遺傳算法的聚類方法做了比較第三將改進(jìn)的數(shù)據(jù)挖掘方法應(yīng)用在生物信息學(xué)中該文針對氨甘酸序列的聚類問題提出了基于遺傳算法的解決方案第四對生物信息學(xué)中已有數(shù)據(jù)挖掘算法做進(jìn)一步的優(yōu)化該文針對蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)預(yù)測問題在前人工作的基礎(chǔ)上提出了基于并行遺傳算法的解決方案

簡介：南開大學(xué)博士學(xué)位論文中文摘要摘要脂肽類生物表面活性劑屬于細(xì)菌產(chǎn)生的代謝產(chǎn)物，其合成酶基因約占整個基因組染色體大小的O。7％，以結(jié)構(gòu)復(fù)雜的操縱予形式存在，內(nèi)部包含重疊基因。脂肽合成酶基因在芽孢桿菌感受態(tài)形成和分化發(fā)育調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中處于中心地位，感受態(tài)的形成需要5’末端序列，芽孢的有效生成則需要整個操縱子基因轉(zhuǎn)錄與表達(dá)，它本身由兩個QUORUMSENSING系統(tǒng)調(diào)控，目前所有的轉(zhuǎn)錄調(diào)控和作用機(jī)制證據(jù)的獲取均來自非高產(chǎn)脂肽生產(chǎn)菌，對高產(chǎn)脂肽生產(chǎn)菌脂肽基因的調(diào)控模式和作用機(jī)制尚不清楚。本文以高產(chǎn)脂肽生產(chǎn)菌BACILLUSSUBTILISNK．LI為材料，探索脂肽合成酶基因盤玷轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)的分子遺傳學(xué)機(jī)理，特別是早期感受態(tài)基因COMA對矗玎基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控。研究內(nèi)容主要包括以下五部分1對脂肽高產(chǎn)菌株采用多相分類技術(shù)，綜合其表型、基因型和系統(tǒng)發(fā)育的信息，確立分類地位2采用基因敲除技術(shù)構(gòu)建缺失菌株，確立COMA基因與瑤艚基因之間的關(guān)系3采用報(bào)道基因融合技術(shù)研究COMA基因與枷基因的時序表達(dá)模式；4對高產(chǎn)脂肽菌株直接進(jìn)行遺傳操作，研究構(gòu)建工程菌的理論基礎(chǔ)和策略，構(gòu)建一系列穿梭表達(dá)載體，研究∞MA基因?qū)匣虻霓D(zhuǎn)錄調(diào)控模式；5利用BACILLUSLICHENIFORMISNKX3研究脂肽性能及其在突破微生物特重原油開采局限上的可能性。通過對脂肽高產(chǎn)菌株進(jìn)行遺傳操作，制備出轉(zhuǎn)化率高達(dá)1108個轉(zhuǎn)化子／LTGDNA的感受態(tài)；利用COMA基因獲得了提高脂肽產(chǎn)量的證據(jù)，證實(shí)了早期感受態(tài)基因COMA是脂肽合成酶基因轉(zhuǎn)錄和表達(dá)的前提條件；提出了完整的COMA基因與枷基因的時序表達(dá)模式證實(shí)了脂肽具有改變細(xì)胞表面親疏水性的作用和抗生素活性；本研究突破了微生物開采特重原油油藏的局限性，在遼河冷東油田特重原油油藏單井處理中獲得成功，開發(fā)了特重原油油藏蒸汽開采后期的接替技術(shù)。關(guān)鍵詞BACILLUSSUBTILISNKLL脂肽合成酶基因垂蝦早期感受態(tài)基因CDMA轉(zhuǎn)錄調(diào)控微生物提高原油采收率南開大學(xué)博士學(xué)位論文引言1．引言芽孢桿菌BACILLUS作為細(xì)菌分類中的一個屬，歷經(jīng)了百年的歷史。如今，人們對它的研究幾乎涉及到了革蘭氏陽性可生孢細(xì)菌的各個領(lǐng)域。尤其在感受態(tài)的形成、芽孢形成及其調(diào)控、遺傳操作、菌種改良、生物技術(shù)等領(lǐng)域?？莶菅挎邨U菌BACILLUSSUBTILIS作為BACILLUS的模式種，它的研究處于該屬各領(lǐng)域的中心位置。BSUBTILIS為桿狀，G，可產(chǎn)芽孢，好氧的細(xì)菌，廣泛存在于土壤、水域等自然環(huán)境中。它是重要工業(yè)酶的來源，在外界營養(yǎng)供應(yīng)不足的條件下，可通過停止生長，增加代謝強(qiáng)度，產(chǎn)生～系列應(yīng)答反應(yīng)來應(yīng)付環(huán)境的變化。一旦條件適應(yīng)，又可以恢復(fù)正常生長。然而當(dāng)營養(yǎng)條件繼續(xù)惡化時，則通過產(chǎn)生芽孢來抵御惡劣的自然環(huán)境。另外，B．SUBTILIS還可自發(fā)進(jìn)入一種生理狀態(tài)一即感受態(tài)。對B．SUBTILIS的研究包括細(xì)胞壁的合成與細(xì)胞生長及細(xì)胞分裂；中間代訪F過程酶的基因定位；芽孢形成和萌發(fā)有關(guān)的生化和形態(tài)學(xué)變化的基因的確定；轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)導(dǎo)過程中遺傳交換機(jī)制；感受態(tài)等基因的分析與定位；DNA、RNA與蛋白質(zhì)的合成，以及其它如抗生素等產(chǎn)生的基因定位等。這些研究得以進(jìn)展，首先應(yīng)該歸功于SPIZIZENI】及其學(xué)生研究并發(fā)展的B．SUBTILIS168菌株的轉(zhuǎn)化系統(tǒng)，目前國際上用作遺傳工程的B．SUBTILIS宿主幾乎都來自這一菌株。正是這一系統(tǒng)，導(dǎo)致了BACILLUS遺傳學(xué)分析這一時代的來臨。芽孢桿菌遺傳保存中，IJ,BACILLUSGENETICSTOCKCENTER，BGSC將B．SUBTILIS遺傳學(xué)的研究劃分為三個不同的時代，分別是經(jīng)典遺傳學(xué)時代，分子遺傳學(xué)時代及基因組時代?！?58年，SPIZIZENLL】在論文中寫道“DNAISOLATEDFROMAWILDTYPESTRAINCANTRANSFORLNTHESEBACTERIATONUTRITIONALINDEPENDENCE”。揭開了經(jīng)典遺傳學(xué)的序幕。從1958年至1977年19年間，人們關(guān)注著B．SUBTITIS的遺傳交換與重組機(jī)制，這一時期獲得并采用生化方法分析了大量的遺傳突變體營養(yǎng)缺陷型，芽孢產(chǎn)生缺陷型等等，到2001年共有897株B．SUBTILIS遺傳突變菌株保存在美國俄亥俄州立大學(xué)的BACILLUS遺傳保存中心。1977年對研究B．SUBTILIS遺傳學(xué)的科學(xué)家們而言是一個永遠(yuǎn)不會忘記的～年。該年報(bào)道了B．SUBTILIS基因在E．COLI表達(dá)系統(tǒng)中獲得了表達(dá)∞L，同時抗性質(zhì)粒在B．SUBTITIS中獲得了表達(dá)14】。一個RSUBTILIS蛋白表達(dá)的新紀(jì)元宣告來臨，之

簡介：中山大學(xué)碩士學(xué)位論文釀酒酵母ADE13基因缺失致死表型的遺傳學(xué)基礎(chǔ)姓名王丹丹申請學(xué)位級別碩士專業(yè)生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師賀雄雷20100530中【JJ人學(xué)碩士學(xué)位論文有可能是由于該基岡缺失后，使得細(xì)胞內(nèi)其他基岡的功能受到影響，或者使得細(xì)胞內(nèi)積累了某些細(xì)胞毒性物質(zhì)，導(dǎo)致細(xì)胞死亡。本研究不僅為遺傳學(xué)中必需基因等基本概念提供理論參考價值，為進(jìn)一‘步的遺傳學(xué)研究以及腺嘌呤代謝途徑的研究提供方法依據(jù)和理論基礎(chǔ)，而且有助于更深入一步的認(rèn)識基岡間相互作用關(guān)系。關(guān)鍵詞必需基岡；ADEI基岡敲除；挽救Ⅱ

簡介：分類號密級華中農(nóng)業(yè)大學(xué)博士學(xué)位論文甘藍(lán)型油菜諸葛菜異附加系和代換系的建立及遺傳學(xué)ESTABLISHMENTANDCYTOGENETICSOFBRASSICANAP／ZSORYCHOPHRAGVIOLACELLSALIENADDITIONSANDSUBSTITUTIIRA2MUSVIOLACELLSALIENADITIONSANSBSTITUUONS博士研究生丁力學(xué)號09301010035指導(dǎo)老師李再云教授專業(yè)作物遺傳育種研究方向油菜分子細(xì)胞遺傳學(xué)獲得學(xué)位名稱農(nóng)學(xué)博士獲得學(xué)位時間2013年華中農(nóng)業(yè)大學(xué)植物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院作物遺傳改良國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，國家農(nóng)作物分子技術(shù)育種中心中國武漢430070二。一三年六月甘藍(lán)型油菜一諸葛菜附加系和代換系的建立及細(xì)胞遺傳學(xué)目錄摘要IABSTRACTIII1文獻(xiàn)綜述111植物異染色體系研究進(jìn)展及其在植物遺傳改良中的應(yīng)用1111異附加系1112異代換系2113易位系4114異染色體系的鑒定51141形態(tài)學(xué)標(biāo)記51142細(xì)胞學(xué)標(biāo)記51143生化標(biāo)記61144分子標(biāo)記612染色體的異常細(xì)胞遺傳行為7121細(xì)胞有絲分裂染色體異常行為71211體細(xì)胞聯(lián)會和體細(xì)胞交換71212親本染色體組分開現(xiàn)象91213染色體消除91214核內(nèi)有絲分裂91215多次有絲分裂10122細(xì)胞減數(shù)分裂染色體異常行為101221減數(shù)分裂聯(lián)會異常101222未減數(shù)配子現(xiàn)象12123染色體的其他異常行為1612。31染色體的不均等傳遞161232染色體在運(yùn)動中的異常行為1613非整倍體研究進(jìn)展18131單體一19132缺體20T

簡介：點(diǎn)擊查看更多長湖短頜鱭種群生態(tài)學(xué)及遺傳多樣性.pdf精彩內(nèi)容。

簡介：大數(shù)據(jù)處理技術(shù)是近幾年來被熱議的話題，它被廣泛地應(yīng)用于物理，天文，金融及其他科學(xué)研究領(lǐng)域。近年來，大數(shù)據(jù)處理技術(shù)在材料科學(xué)領(lǐng)域也得到了有效的應(yīng)用，自2011年日本福島核電站爆炸事故之后，科學(xué)家嘗試?yán)肧IC材料作為下一代核聚變反應(yīng)堆的包殼材料，本課題的主要工作是利用改進(jìn)的遺傳算法對用于SIC材料大數(shù)據(jù)處理的關(guān)鍵勢能函數(shù)進(jìn)行優(yōu)化，使得針對SIC材料的大數(shù)據(jù)計(jì)算結(jié)果更為準(zhǔn)確。作為改進(jìn)型遺傳算法提出的理論基礎(chǔ)，本文首先介紹了遺傳算法的基本原理和主要流程，對常見的編碼方式，適應(yīng)度函數(shù)構(gòu)造方式以及交叉變異方式做了詳細(xì)介紹。鑒于自適應(yīng)遺傳算法具備的諸多優(yōu)點(diǎn)，本文選用自適應(yīng)遺傳算法作為初始的改進(jìn)框架，并詳細(xì)分析了傳統(tǒng)自適應(yīng)遺傳算法的基本原理和優(yōu)缺點(diǎn)。為了進(jìn)一步遏制自適應(yīng)遺傳算法存在的局部最優(yōu)化和早熟收斂問題，本文將一種適用于實(shí)數(shù)編碼的新型交叉方式引入傳統(tǒng)的自適應(yīng)遺傳算法，并對自適應(yīng)遺傳算法的調(diào)節(jié)公式加以改進(jìn)，提出一種基于算數(shù)交叉的自適應(yīng)遺傳算法，新型算法在優(yōu)化效果方面比傳統(tǒng)自適應(yīng)遺傳算法有較大提高。TERSOFF勢能函數(shù)是SIC材料大數(shù)據(jù)處理的核心函數(shù)，在TERSOFF勢能函數(shù)中，需要優(yōu)化的參數(shù)有30個之多，為了使優(yōu)化能夠達(dá)到預(yù)期效果，就必須使用大規(guī)模種群，同時增加迭代的次數(shù)，這就帶來了算法執(zhí)行時間過長，效率低下的弊端。為了解決這一問題，本文將并行計(jì)算的思想引入到基于算數(shù)交叉的自適應(yīng)遺傳算法中，提出了一種基于算數(shù)交叉的并行自適應(yīng)遺傳算法，并利用這一算法對TERSOFF勢能函數(shù)進(jìn)行了優(yōu)化，然后利用改進(jìn)后的勢能函數(shù)在曙光5000A超級計(jì)算機(jī)上進(jìn)行了大數(shù)據(jù)計(jì)算，并對計(jì)算結(jié)果進(jìn)行評估，證明了優(yōu)化結(jié)果的正確性和算法的有效性。同時，對比了幾種遺傳算法的收斂代數(shù)，運(yùn)行時間等數(shù)據(jù)，說明了新型遺傳算法的改進(jìn)效果。最后，本文利用基于算數(shù)交叉的并行自適應(yīng)遺傳算法開發(fā)了一種用于SICHE材料大數(shù)據(jù)計(jì)算的勢能函數(shù)，并針對輻照損傷條件下SIC材料的關(guān)鍵特性進(jìn)行了分子動力學(xué)大數(shù)據(jù)計(jì)算和分析，證明了新型遺傳算法的有效性。

簡介：CLASSIFIEDINDEXCONFIDENTIALYES／NONOCODE10224NO。130610505DISSERTATIONFORTHEMASTERDEGREEGENETICFEATURESOFENTERICPROTOZOANSANDPOPULATIONGENETICSSTUDYOFENTEROCYTOZOONBIENEUSIINPIGSFROMNORTHEASTCHINACANDIDATEWANQIANGSUPERVISORAPLIWEIDEGREECATEGORYMASTEROFAGRICULTURECOLLEGECOLLEGEOFVETERINARYMEDICINEFIRSTLEVELDISCIPLINEVETERINARYMEDICINESECONDLEVELDISCIPLINEPREVENTIVEVETERINARYMEDICINEHARBINJUNECHINA2016東北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)碩士學(xué)位論文32畢氏腸微孢子蟲多位點(diǎn)序列分析與群體遺傳學(xué)研究一22321各位點(diǎn)基因型與連鎖不平衡分析22322多位點(diǎn)序列分型24323亞群體結(jié)構(gòu)與群體遺傳學(xué)分析254J寸倉2941豬畢氏腸微孢子蟲的流行與基因型分布2942豬隱孢子蟲的流行與蟲種分布3043畢氏腸微孢子蟲多位點(diǎn)序列分型與群體遺傳學(xué)305結(jié)論33致射34參考文獻(xiàn)35攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文44

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簡介：隸南Y大誓博士學(xué)位論文基于神經(jīng)可塑性異常假說的抗抑郁劑藥物遺傳學(xué)研究本論文獲國家863計(jì)劃項(xiàng)目2008AA022413和國家973計(jì)劃項(xiàng)目2007CB512308資助。東南大學(xué)學(xué)位論文獨(dú)創(chuàng)性聲明本人聲明所呈交的學(xué)位論文是我個人在導(dǎo)師指導(dǎo)下進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果。盡我所知，除了文中特別加以標(biāo)注和致謝的地方外，論文中不包含其他人已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含為獲得東南大學(xué)或其它教育機(jī)構(gòu)的學(xué)位或證書而使用過的材料。與我一同工作的同志對本研究所做的任何貢獻(xiàn)均己在論文中作了明確的說明并表示了謝意。研究生簽名犟絲盤魚日期堂墮弘東南大學(xué)學(xué)位論文使用授權(quán)聲明東南大學(xué)、中國科學(xué)技術(shù)信息研究所、國家圖書館有權(quán)保留本人所送交學(xué)位論文的復(fù)印件和電子文檔，可以采用影印、縮印或其他復(fù)制手段保存論文。本人電子文檔的內(nèi)容和紙質(zhì)論文的內(nèi)容相一致。除在保密期內(nèi)的保密論文外，允許論文被查閱和借閱，可以公布包括刊登論文的全部或部分內(nèi)容。論文的公布包括刊登授權(quán)東南大學(xué)研究生院辦理。研究生簽名上扛塑生璽．一導(dǎo)師簽名二三蠡L日期之蚴礦

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