簡介：HUAZHONGAGRICULTURALUNIVERSITY博士學(xué)位論文博士學(xué)位論文PHDDISSERTATION珙桐遺傳多樣性與保護(hù)生物學(xué)研究GEICDIVERSITYCONSERVATIONBIOLOGYRESEARCHEOFDAVIDIAINVOLUCRATA研究生羅世家研究生羅世家CIDATELUOSHIJIA導(dǎo)師包滿珠教授導(dǎo)師包滿珠教授SUPERVISPROFESSBAOMANZHU專業(yè)園林植物與觀賞園藝專業(yè)園林植物與觀賞園藝MAJLSCAPEPLANTSNAMENTALHTICULTURE研究方向研究方向FIELD園林植物種質(zhì)資源園林植物種質(zhì)資源PLANTGERMPLASMRESOURCES中國武漢中國武漢WUHAN，CHINA二○一二年十二月二○一二年十二月DECEMBER，2012

簡介：腦機(jī)接口BRAINCOMPUTERINTERFACE，BCI或BRAINMACHINEINTERFACE，BMI作為一種不依賴腦的正常輸出通路的通訊系統(tǒng)，實(shí)現(xiàn)了大腦與外部環(huán)境之間的直接信息交互。腦機(jī)接口主要可以指“腦控”和“機(jī)控”兩種形式“腦控”形式通過對(duì)大腦神經(jīng)信號(hào)的提取和分析來實(shí)現(xiàn)對(duì)于外部設(shè)備的控制“機(jī)控”形式則通過向大腦施加特定的刺激信號(hào)實(shí)現(xiàn)對(duì)于大腦活動(dòng)的調(diào)控?！皺C(jī)控”形式的腦機(jī)接口已被廣泛的應(yīng)用于神經(jīng)功能調(diào)控、感覺信息反饋等研究，其典型的應(yīng)用范例即為動(dòng)物機(jī)器人系統(tǒng)。動(dòng)物機(jī)器人指利用動(dòng)物自身的神經(jīng)系統(tǒng)，通過施加特定的刺激信號(hào)調(diào)控大腦活動(dòng)，進(jìn)而影響動(dòng)物整體的行為，從而實(shí)現(xiàn)動(dòng)物行為的人為控制。其中，大鼠機(jī)器人在軍事勘測(cè)、路障排除、消防救援等方面具有重要的實(shí)際應(yīng)用價(jià)值。然而，目前的大鼠機(jī)器人運(yùn)動(dòng)調(diào)控存在兩個(gè)主要瓶頸第一，電刺激方式的影響范圍難以精確控制，容易干擾非相干腦區(qū)的正常電活動(dòng)，不利于大鼠機(jī)器人的精確運(yùn)動(dòng)控制。第二，電刺激方式影響的對(duì)象為所有細(xì)胞，無法針對(duì)特定類型的神經(jīng)元進(jìn)行調(diào)控研究，因此難以在神經(jīng)機(jī)制上對(duì)控制命令做出解釋和優(yōu)化?；谝陨显?，探索一種能夠與電刺激互補(bǔ)的全新刺激調(diào)控方式，是大鼠機(jī)器人研究領(lǐng)域十分關(guān)注的研究內(nèi)容。本研究采用當(dāng)前新興的光遺傳學(xué)技術(shù)，通過在相關(guān)腦區(qū)的特定神經(jīng)元內(nèi)表達(dá)光敏感蛋白，并利用光刺激替代電刺激，對(duì)大鼠機(jī)器人的“前進(jìn)”、“停止”和“左右轉(zhuǎn)向”運(yùn)動(dòng)調(diào)控進(jìn)行了深入的研究。本研究實(shí)現(xiàn)了對(duì)大鼠運(yùn)動(dòng)行為的光刺激調(diào)控，對(duì)運(yùn)動(dòng)行為調(diào)控的神經(jīng)機(jī)制做出了相應(yīng)解釋，并探討了光遺傳學(xué)技術(shù)用于大鼠機(jī)器人運(yùn)動(dòng)調(diào)控的優(yōu)勢(shì)和劣勢(shì)。本研究的主要?jiǎng)?chuàng)新點(diǎn)如下第一，將光遺傳學(xué)神經(jīng)調(diào)控技術(shù)引入動(dòng)物機(jī)器人的運(yùn)動(dòng)控制研究，采用光刺激方式精確誘導(dǎo)了動(dòng)物運(yùn)動(dòng)行為的調(diào)控，并與傳統(tǒng)的電刺激方式形成功能上的互補(bǔ)，為動(dòng)物機(jī)器人的精確運(yùn)動(dòng)調(diào)控提出了一種嶄新的實(shí)現(xiàn)思路。第二，利用光遺傳學(xué)調(diào)控方式，對(duì)于參與大鼠運(yùn)動(dòng)調(diào)控的獎(jiǎng)賞學(xué)習(xí)機(jī)制和防御行為機(jī)制進(jìn)行了一定程度的探索和解釋，并且深入探討了部分多巴胺能神經(jīng)元和谷氨酸能神經(jīng)元在大鼠獎(jiǎng)賞學(xué)習(xí)機(jī)制中的貢獻(xiàn)上述研究工作對(duì)于動(dòng)物機(jī)器人運(yùn)動(dòng)調(diào)控的神經(jīng)機(jī)制解釋與調(diào)控方法優(yōu)化有非常重要的參考價(jià)值。第三，自行設(shè)計(jì)了光纖微電極植入子陣列接口裝置以及大鼠背包式無線通信光刺激裝置，實(shí)現(xiàn)了同步在體的光刺激調(diào)控與電生理信號(hào)提取，建立了雙向調(diào)控的完整閉環(huán)腦機(jī)接口系統(tǒng)，為光遺傳學(xué)和腦機(jī)接口系統(tǒng)研究提供了新的手段。綜上所述，本研究通過將光遺傳學(xué)神經(jīng)調(diào)控技術(shù)與植入式腦機(jī)接口技術(shù)相結(jié)合，開展了基于光刺激的新型大鼠機(jī)器人運(yùn)動(dòng)調(diào)控研究，實(shí)現(xiàn)光刺激大鼠機(jī)器人運(yùn)動(dòng)調(diào)控指令，并且借助光遺傳學(xué)技術(shù)，對(duì)于參與大鼠運(yùn)動(dòng)調(diào)控過程的獎(jiǎng)賞學(xué)習(xí)機(jī)制和防御行為機(jī)制等進(jìn)行了深入探索該研究目前未見報(bào)道。本研究為神經(jīng)工程以及動(dòng)物機(jī)器人控制領(lǐng)域提供了一種具有啟發(fā)性的、且具有更強(qiáng)精確性和特異性的實(shí)現(xiàn)方案和思路同時(shí)，為神經(jīng)科學(xué)領(lǐng)域研究神經(jīng)通路、投射關(guān)系和內(nèi)在作用機(jī)制等提供了一種定位性強(qiáng)、準(zhǔn)確度高的調(diào)控研究方法。

簡介：應(yīng)用IONTORRENTPGM’RM平臺(tái)檢測(cè)中國漢族124SNP基因座及群體遺傳學(xué)研究APPLICATIONANDGENETICPOLYMORPHISMFOR124SNPSFROMCHINESEHANUSINGIONPGMTMPLATFORM導(dǎo)論文課題起止時(shí)間2Q堇主魚旦蘭Q魚生5旦論文完成時(shí)間2Q魚生5旦中國醫(yī)科大學(xué)遼寧2016年5月目錄一、摘要中文論著摘要????????????????????????L英文論著摘要????????????????????????4二、英文縮略語?????????????????????????7三、論文前言????????????????????????????8材料與方法?????????????????????????9實(shí)驗(yàn)結(jié)果?????????????????????????13討論???????????????????????????25結(jié)論???????????????????????????29四、本研究創(chuàng)新性的自我評(píng)價(jià)???????????????????31五、參考文獻(xiàn)??????????????????????????32六、附錄綜述????????????????????????????34在學(xué)期間科研成績??????????????????????47致謝????????????????????????????48個(gè)人簡介??????????????????????????49

簡介：河北師范大學(xué)碩士學(xué)位論文褐馬雞保護(hù)遺傳學(xué)研究姓名付玉明申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別碩士專業(yè)動(dòng)物學(xué)指導(dǎo)教師吳躍峰200805306對(duì)多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn)，其多態(tài)信息含量POLYMORPHICINFORMATIONCONTENT，PZC3值最低為0635，平均為O736，遠(yuǎn)大于05的高多態(tài)性臨界值。6個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)在褐馬雞野生種群中N叫3，共檢測(cè)到44個(gè)等位基因。其中共享等位基因39個(gè)，特有等位基因5個(gè)。平均每個(gè)位點(diǎn)等位基因數(shù)為733個(gè)，平均有效等位基因數(shù)為454個(gè)，平均期望雜合度為0773，遺傳多樣性處于較高水平。這與用線粒體控制區(qū)所檢測(cè)到的結(jié)果截然不同。線粒體DNA遺傳多樣性較低而核DNA遺傳多樣性較高的遺傳模式表明，歷史上褐馬雞雌性的有效種群比較小，該物種可能是一個(gè)進(jìn)化歷史比較短的的物種。在圈養(yǎng)種群中N20，檢測(cè)到‘28個(gè)等位基因。平均每個(gè)位點(diǎn)等位基因數(shù)為457個(gè)，平均有效等位基因數(shù)為276個(gè)，平均雜合度為O39，均低于野生種群。圈養(yǎng)種群平均近交系數(shù)達(dá)到173％，已經(jīng)表現(xiàn)出小種群中普遍存在的遺傳衰變。4分子變異分析AMOVA表明，小五臺(tái)山種群與龐泉溝種群之間發(fā)生了顯著的遺傳分化，而與蘆芽山種群遺傳分化不明顯。此結(jié)果與用線粒體控制區(qū)標(biāo)記所獲得的結(jié)果略有差異。綜合線粒體控制區(qū)與核內(nèi)微衛(wèi)星的檢測(cè)結(jié)果，褐馬雞野生種群在遺傳結(jié)構(gòu)上可分為2個(gè)不同的類群1河北小五臺(tái)山種群2蘆芽山和龐泉溝所屬的山西呂梁種群。建議將褐馬雞劃分為2個(gè)管理單元MU1河北小五臺(tái)山單元；2LI西呂梁山單元。目前的圈養(yǎng)種群，由于建群時(shí)的奠基者數(shù)量過少，加上繁殖過程中譜系不清，缺乏科學(xué)的遺傳管理，已經(jīng)表現(xiàn)出了小種群普遍存在的遺傳問題。為使該圈養(yǎng)種群能夠長期有效地維持其遺傳多樣性，建議優(yōu)化更新圈養(yǎng)種群的血緣，同時(shí)盡快建立譜系，加強(qiáng)繁殖過程中的遺傳管理。IV關(guān)鍵字褐馬雞線粒體DNA調(diào)控區(qū)微衛(wèi)星遺傳多樣性遺傳結(jié)構(gòu)基因流譜系

簡介：背景與目的本次研究首次通過分子篩查一個(gè)大樣本中國人群來調(diào)查KLF1基因的突變率與突變譜，并通過表型研究來評(píng)估KLF1突變是否對(duì)Β地貧具有遺傳修飾作用。設(shè)計(jì)與方法一、研究人群、病人和表型檢測(cè)本研究通過隨機(jī)抽樣對(duì)長期居住在中國南方地區(qū)的3918例非親緣關(guān)系個(gè)體進(jìn)行了突變分析，這個(gè)大人群隊(duì)列包括3839例連續(xù)采集的樣本和79例表型導(dǎo)向型樣本（HBA2水平33％41％和或HBF水平大于15％）。與此同時(shí)，我們通過采集攜帶KLF1突變的Β地貧患者進(jìn)行了家系研究，以確認(rèn)突變是自發(fā)突變還是遺傳性突變。另外，我們還召集了中國非地貧高發(fā)區(qū)域的1190例個(gè)體作為對(duì)照研究，他們來自中國北方地區(qū)山東省。所有的血液學(xué)參數(shù)均用自動(dòng)血細(xì)胞計(jì)數(shù)儀測(cè)定，血紅蛋白組分分析運(yùn)用高效液相色譜法進(jìn)行測(cè)定。紅細(xì)胞表面抗原CD44表達(dá)量運(yùn)用流式細(xì)胞儀分析。二、分子遺傳檢測(cè)DNA提取采用傳統(tǒng)的酚氯仿抽提法。通過高分辨率熔解曲線技術(shù)分析（HRMASSAY）篩查所有參加者的KLF1變異，運(yùn)用第一代測(cè)序?qū)λY查的變異進(jìn)行驗(yàn)證。對(duì)于KLF1變異是否是功能性突變主要基于兩點(diǎn)標(biāo)準(zhǔn)1根據(jù)表型的變化攜帶者HBF水平大于1％同時(shí)或紅細(xì)胞表面抗原CD44表達(dá)下降2生物信息學(xué)預(yù)測(cè)應(yīng)用SIFTSIFTJCVIG和POLYPHEN2GEICSBWHHARVARDEDUPPH2軟件來預(yù)測(cè)所發(fā)現(xiàn)的KLF1變異是否影響其蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能。三、統(tǒng)計(jì)分析所有的統(tǒng)計(jì)分析均使用SPSS190統(tǒng)計(jì)軟件或R語言進(jìn)行，P＜005視為具有顯著的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。結(jié)果一、中國南方地區(qū)人群具有相對(duì)高的KLF1突變率中國南方人群KLF1突變率在隊(duì)列A，隊(duì)列B，隊(duì)列C的突變率分別是127％251971，116％11946，130％12922，且這三組之間沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異，P0959，但南方人群KLF1總突變率顯著高于北方人群125％VS008％，P＜0001，說明KLF1突變?cè)谥袊戏饺巳河邢鄬?duì)高的突變頻率，且在地中海貧血流行區(qū)域更為常見。二、廣泛的KLF1突變譜3839例連續(xù)采集的南方人群樣本（隊(duì)列A，B，C）中共鑒定出48個(gè)突變的KLF1等位基因，79例表型導(dǎo)向型樣本共發(fā)現(xiàn)16個(gè)，檢出率為2025％。從突變譜看，PGLY176ALAFSX179和PHIS299ASP為最主要的兩種突變，占所有突變的906％。另外本研究還報(bào)道了13種新的中性KLF1變異，包括4種錯(cuò)義突變、4種同義突變和5種3UTR突變。所發(fā)現(xiàn)的這些突變首次展現(xiàn)了KLF1基因人群廣泛的突變譜。三、KLF1突變可改變正常個(gè)體血液學(xué)參數(shù)通過對(duì)41例攜帶KLF1突變的非地貧人群（25例來自隊(duì)列A，16例來自隊(duì)列D）進(jìn)行血液學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)無論是平均紅細(xì)胞體積MEANCPUSCULARVOLUME，MCV還是平均紅細(xì)胞血紅蛋白量（MEANCPUSCULARHEMOGLOBIN，MCH）與1946例未攜帶KLF1突變的非地貧人群相比都輕微的降低了MCV8245±539VS8929±477FLP＜0001MCH2695±211VS2946±144PGP＜0001。另外，這41例個(gè)體的HBA2和HBF水平也有一定程度的升高，分別為328±045％和344±175％。因此，本研究首次通過人群研究發(fā)現(xiàn)輕微升高或者處于臨界值的MCV和MCH是KLF1基因突變的重要表型，與升高的HBA2和HBF這兩個(gè)已發(fā)現(xiàn)的指標(biāo)一樣，可以提高篩查KLF1基因突變的陽性率。四、KLF1突變可改變?chǔ)⒌刎殧y帶者的血液學(xué)表型本研究對(duì)14例KLF1雜合突變與Β0雜合突變共遺傳的個(gè)體進(jìn)行了血液學(xué)分析，其中7例Β0ΒN來自隊(duì)列B（隊(duì)列B中1例ΒΒN，1例ΒEΒN，2例Β0ΒN合并Α地貧被排除分析），另外7例Β0ΒN來自家系樣本。意外的是，這14例個(gè)體MCV或MCH與217例Β0雜合突變攜帶者相比，并未顯得更低，無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異MCV6353±394VS6511±434FL，P0112MCH2026±142VS2034±137PG，P0567。另外一方面，這14例個(gè)體顯示出了相當(dāng)高的HBA2Α262水平（647±081％，最低510％，最高800％），顯示出KLF1突變和ΒGLOBIN基因突變對(duì)ΔGLOBIN基因表達(dá)升高的疊加作用與此同時(shí)，我們注意到這些樣本具有升高的且變異的HBF水平（767±411％，最低360％，最高1820％），但其變異性有待進(jìn)一步研究。五、KLF1突變可減輕Β地貧患者臨床表型嚴(yán)重性為了評(píng)價(jià)KLF1突變對(duì)Β地貧患者臨床表型的修飾作用，我們?nèi)嫜芯苛?22例Β地貧患者的臨床表型和目前已知的潛在的減輕Β地貧患者臨床表型的遺傳因素。我們意外的發(fā)現(xiàn)2種KLF1突變選擇性的出現(xiàn)在12例中間型Β地貧患者TI中（其中10例攜帶PGLY176ALAFSX179，2例攜帶PHIS299ASP）。通過COX比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型COXPROPTIONALHAZARDSMODEL對(duì)8個(gè)潛在修飾因素進(jìn)行評(píng)估結(jié)果顯示，KLF1基因突變對(duì)Β地貧患者臨床表型修飾作用最大HR0213，P＜0001，其次是HBB基因型Β，HR0353，P＜0001，XMNI，HR0512，P＜0001，HBA突變（HR0671，P＜0001），RS9399137HR0724，P＜0001RS766432（HR0761，P＜0001），但性別因素HR0893，P0107和RS11886868（HR0871，P0415）這2個(gè)因素被模型排除。12例TI的基因型中7例是Β0Β0ΑΑΑΑ，3例Β0ΒΑΑΑΑ，2例Β0Β0SEAΑΑ，我們通過單因素分析Β0Β0，ΑΑΑΑ，XMNI，RS766432AAAC，RS9399137TTCT比較7例攜帶KLF1突變和362例無KLF1突變的Β地貧患者臨床表型，結(jié)果顯示這7例Β地貧患者表現(xiàn)出相對(duì)輕的臨床表型較高的HB水平8257±781VS6633±1753GL，P0006，較高的HBF水平（3958±2180VS917土1105GL，P＜0001），相對(duì)少的輸血次數(shù)（0082，P0007）和較低的TM風(fēng)險(xiǎn)率0009，P＜0001。KAPLANMEIER無輸血生存曲線顯示出顯著的差異存在這兩組中（P＜0001），其第一次輸血的中位時(shí)間分別是36個(gè)月和6個(gè)月。另外，所有攜帶12例KLF1突變的TI第一次輸血的中位時(shí)間是48個(gè)月，而922例Β地貧患者人群中的342例非攜帶KLF1突變的TI第一次輸血的中位時(shí)間是24個(gè)月，但統(tǒng)計(jì)學(xué)并未顯示出兩者間具有差異P0093，顯示出兩組TI具有一定的同質(zhì)性。結(jié)論一、本研究首次設(shè)計(jì)人群遺傳學(xué)大樣本的研究調(diào)查出KLF1基因突變?cè)谥袊戏胶椭袊狈降貐^(qū)的人群突變率，證明KLF1基因突變?cè)诘刂泻Ｘ氀餍袇^(qū)域更常見125％VS008％。與此同時(shí)，鑒定出的64個(gè)KLF1突變?nèi)娴恼宫F(xiàn)出中國人群廣泛的KLF1突變譜。二、首次通過對(duì)攜帶KLF1突變的非地貧樣本和Β雜合子樣本的基因型與表型樣的分析，系統(tǒng)闡明了KLF1突變可以引起MCV和MCH輕微降低或處于臨界值，HBA2水平和HBF水平升高功能性突變可以使紅細(xì)胞表面抗原CD44表達(dá)降低。這些變異的表型有助于KLF1突變的人群篩查。三、應(yīng)用COX比例風(fēng)險(xiǎn)回歸模型全面系統(tǒng)的評(píng)估了包括KLF1突變?cè)趦?nèi)的8個(gè)因素對(duì)922例Β地貧患者的臨床表型修飾作用，發(fā)現(xiàn)KLF1突變可以減輕Β地貧患者的臨床表型且影響作用最強(qiáng)，對(duì)精確診斷Β地貧、產(chǎn)前診斷、遺傳咨詢和基因診斷方面提供了重要依據(jù)和線索。

簡介：目的本學(xué)位論文總的研究目的是，在前期對(duì)中國大陸蛔蟲種群分子遺傳學(xué)研究的基礎(chǔ)上，做進(jìn)一步深入探討，為人蛔蟲和豬蛔蟲的分子遺傳學(xué)、生理學(xué)、分子流行病學(xué)等方面增加新的認(rèn)識(shí)，同時(shí)也為我國人蛔蟲和豬蛔蟲感染的預(yù)防控制提供科研依據(jù)和理論指導(dǎo)。第一章綜述之后的四個(gè)研究章節(jié)各自的研究目的如下1、第二章應(yīng)用譜系地理學(xué)的方法，進(jìn)一步揭示我國蛔蟲種群的遺傳結(jié)構(gòu)和多樣性以及人蛔蟲和豬蛔蟲歷史演化關(guān)系。2、第三章應(yīng)用多個(gè)微衛(wèi)星分子標(biāo)記，對(duì)前期研究中運(yùn)用ITS這一遺傳標(biāo)記未能區(qū)分的G2型人蛔蟲和G2型豬蛔蟲，進(jìn)一步探討其遺傳多樣性的差異。3、第四章在前期發(fā)現(xiàn)人蛔蟲和豬蛔蟲雜交個(gè)體的基礎(chǔ)上，進(jìn)一步了解我國人蛔蟲和豬蛔蟲的交叉感染和雜交個(gè)體的頻數(shù)分布及其在地域、宿主以及基因型方面的分布差異，據(jù)此重新審視我國現(xiàn)行的人群蛔蟲感染的控制對(duì)略，為其改變和完善提供必要的理論指導(dǎo)和客觀依據(jù)。4、第五章了解是否蛔蟲交配行為中，雌性個(gè)體是否存在與多個(gè)雄蟲進(jìn)行交配的問題。方法按照上述各自的研究目的，相應(yīng)的研究方法分述如下1、使用線粒體DNA標(biāo)記COX1和NAD1和軟件程序DNASP50，ARLEQUIN30，MEGA40，WK4516對(duì)來自中國6個(gè)省區(qū)的12個(gè)人蛔蟲和豬蛔蟲同域種群進(jìn)行系統(tǒng)地理學(xué)研究。2、選用20個(gè)常染色體微衛(wèi)星標(biāo)記，結(jié)合毛細(xì)管電泳技術(shù)確定等位基因大小，使用軟件CERVUSV20、ARLEQUINV311、FSTATV293和GEIXV405進(jìn)行G2型人蛔蟲和豬蛔蟲遺傳多樣性分析。3、采用20個(gè)多態(tài)性豐富的微衛(wèi)星標(biāo)記，結(jié)合毛細(xì)管電泳技術(shù)，使用軟件STRUCTURE、BAPS和NEWHYBRIDS，確定中國6個(gè)省區(qū)12個(gè)蛔蟲和和豬蛔蟲同域種群的宿主交叉感染情況和雜交子的蛔蟲個(gè)體。4、采用7個(gè)性連鎖微衛(wèi)星位點(diǎn)對(duì)3條雌性豬蛔蟲F1子代62個(gè)個(gè)體進(jìn)行父系遺傳分析。使用毛細(xì)管電泳檢測(cè)等位基因大小及基因型，根據(jù)孟德爾遺傳分離和自由組合規(guī)律推斷母本和父本基因型，用等位基因計(jì)數(shù)法和GUARDV20軟件進(jìn)行父系遺傳分析。結(jié)果上述四個(gè)研究章節(jié)主要的研究結(jié)果分別如下1、蛔蟲遺傳多樣性因宿主和地理種群而異，但其單倍型之間未形成明顯的地理分布差異；豬來源的蛔蟲種群的遺傳多樣性普遍高于人來源的蛔蟲種群；而且在人來源的蛔蟲種群中，我國南部種群的遺傳多樣性明顯高于中部和北部省份的蛔蟲種群，而在豬來源的蛔蟲種群中未發(fā)現(xiàn)此類地理差異；在很大一部分的人來源的蛔蟲種群中，檢測(cè)到種群歷史的擴(kuò)張，但在豬來源的蛔蟲中未檢測(cè)到；人來源的蛔蟲和豬來源的蛔蟲之間存在較高水平的基因交流，人來源的蛔蟲種群間比豬來源的蛔蟲種群之間具有更高水平的基因交流；COX1基因單倍型的網(wǎng)絡(luò)分析表明存在一個(gè)古老的人來源的蛔蟲單倍型，即H9。2、對(duì)69個(gè)G2型人蛔蟲和豬蛔蟲樣本的檢測(cè)，發(fā)現(xiàn)G2型人蛔蟲有378個(gè)等位基因，范圍在331，平均每對(duì)引物可檢測(cè)189個(gè)等位基因；G2型豬蛔蟲有229個(gè)等位基因，范圍在519，平均每對(duì)引物可檢測(cè)1145個(gè)等位基因。G2型人蛔蟲的等位基因頻率在00821之間；G2型豬蛔蟲的等位基因頻率在00833之間。20個(gè)基因位點(diǎn)中有14個(gè)位點(diǎn)在G2型人、豬蛔蟲中的優(yōu)勢(shì)等位基因一致，6個(gè)基因位點(diǎn)位點(diǎn)1、6、10、12、16和17在G2型人、豬蛔蟲中的優(yōu)勢(shì)等位基因不一致。在位點(diǎn)13G2型豬蛔蟲無特有等位基因，在位點(diǎn)15G2型人蛔蟲無特有等位基因外，其它位點(diǎn)中均存在G2型人、豬蛔蟲各自的特有等位基因，其中G2型人蛔蟲有204個(gè)特有等位基因，G2型豬蛔蟲有55個(gè)特有等位基因。G2型人蛔蟲和豬蛔蟲的平均期望雜合度分別為0802和0777，多態(tài)信息含量分別為0779和0737。分子變異方差分析AMOVA結(jié)果顯示，遺傳變異26％來自種群間，686來自個(gè)體間，兩蛔蟲種群間FST值為00268，基因流NM為908。3、在人體和豬體內(nèi)都檢測(cè)出交叉感染和雜交個(gè)體，兩者的檢出總數(shù)均為20。在這20例宿主交叉感染中，有19例是人體被豬蛔蟲感染的情況，只有一例是豬被人蛔蟲感染。交叉感染的分布，還明顯受蛔蟲基因型的影響，在20例宿主交叉感染中，基因型為G1人型、G2共有型和G3豬型的蛔蟲各占45，45％和10％。在共檢出的20個(gè)人蛔蟲和豬蛔蟲的雜交子中，只有1個(gè)為豬體內(nèi)來源的蛔蟲，其余19個(gè)均在人體內(nèi)發(fā)現(xiàn)，雜交子的分布同時(shí)呈現(xiàn)明顯的南、北地域性，因南方兩省雜交個(gè)體的數(shù)目多于其北部4省11對(duì)9。雜交個(gè)體的分布也具有明顯的基因型差異，在這20個(gè)雜交個(gè)體中，基因型為G1人型、G2共有型和G3豬型的蛔蟲各占比例分別為55％，30％和15％。4、所采用的7個(gè)性連鎖微衛(wèi)星位點(diǎn)均表現(xiàn)出較高的多態(tài)性，表明其適合于進(jìn)行父系遺傳分析，等位基因計(jì)數(shù)發(fā)現(xiàn)三個(gè)家系中有1個(gè)家系的F1子代來自于多個(gè)父本，而GUARD軟件揭示，這三個(gè)家系中有2個(gè)家系的F1子代來自于多個(gè)父本。結(jié)論1、本研究在蛔蟲種群的遺傳多樣性、種群分化、歷史種群結(jié)構(gòu)、基因流、系統(tǒng)發(fā)育重建和單倍型網(wǎng)絡(luò)等方面均揭示了新的信息，認(rèn)為我國人蛔蟲和豬蛔蟲遺傳多樣性的差異可能與中國人口遷移和野豬的馴化的歷史有關(guān)，根據(jù)分析結(jié)果，對(duì)兩種蛔蟲的進(jìn)化關(guān)系提出了不同的假設(shè)，即豬蛔蟲的祖先可能來自于人體的蛔蟲。該研究對(duì)人蛔蟲和豬蛔蟲的流行病學(xué)、歷史進(jìn)化和分類具有一定的啟示作用。2、G2型人蛔蟲和G2型豬蛔蟲均存在較高的遺傳多樣性，兩者間未見明顯的遺傳分化，并存在基因交流。但兩者特有等位基因的差異和不同的優(yōu)勢(shì)等位基因的存在，同時(shí)提示了兩者遺傳上的重要差異，似可部分解釋其宿主寄生特異性方面的不同。3、我國人蛔蟲和豬蛔蟲的交叉感染具有明顯的宿主和基因型差異，而雜交個(gè)體的發(fā)生除具有明顯的宿主偏好和基因型差異外，還表現(xiàn)出明顯的南北地域差異。這表明在我國這樣的人蛔蟲和豬蛔蟲感染共存的流行區(qū)，豬蛔蟲已成為人群蛔蟲感染的重要來源，這也是蛔蟲流行病學(xué)中不可忽視的新動(dòng)向。因此有必要重新審視我國現(xiàn)行人群蛔蟲感染控制的對(duì)策并作出必要的調(diào)整。本研究關(guān)于豬蛔蟲和人蛔蟲交叉感染以及雜交個(gè)體的發(fā)生頻率及其宿主、地理及基因型的分布差異的結(jié)果，不僅可為我國蛔蟲防制對(duì)策的改變和完善提供必要的理論指導(dǎo)和客觀依據(jù)，也對(duì)深入探討蛔蟲的遺傳進(jìn)化、分類地位以及分子流行病學(xué)方面具有裨益。4、本研究首次發(fā)現(xiàn)和報(bào)道了豬蛔蟲雌性成蟲存在和多個(gè)雄蟲進(jìn)行交配的分子遺傳學(xué)證據(jù)，增加了蛔蟲生殖生理學(xué)的新知識(shí)，具有生殖遺傳學(xué)和分子流行病學(xué)意義，并對(duì)進(jìn)一步研究其它寄生蟲的遺傳多樣性、不同宿主的潛在感染和抗藥性的傳播率方面，具有啟示作用。

簡介：南京師范大學(xué)博士學(xué)位論文中國水域江豚和中華白海豚的保護(hù)遺傳學(xué)研究姓名陳煉申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別博士專業(yè)動(dòng)物學(xué)指導(dǎo)教師楊光20090524摘要第4章通過114個(gè)擴(kuò)增片段長度多態(tài)AFLP標(biāo)記分析棲息在完全不同的自然環(huán)境中的3個(gè)江豚種群，尋找與選擇作用相關(guān)的遺傳特征。通過3個(gè)種群間的比較，結(jié)果顯示，有4個(gè)AFLP位點(diǎn)其風(fēng)T值大于0975的范圍，表明它們可能受到分化選擇作用的影響；有2個(gè)AFLP位點(diǎn)其咫T值小于0025的范圍，有可能受到平衡選擇作用的影響。這一結(jié)果提示通過基因組掃描將有助于識(shí)別與江豚淡水適應(yīng)機(jī)制相關(guān)的特異基因組區(qū)域或基因。第5章介紹了從中華白海豚中分離出的11個(gè)二堿基重復(fù)類型和5個(gè)四堿基重復(fù)類型的多態(tài)的微衛(wèi)星座位。篩選到的這些微衛(wèi)星座位能夠用于種群遺傳學(xué)研究，如評(píng)估種群結(jié)構(gòu)及遺傳多樣性等，這些對(duì)物種的保護(hù)是很重要的。檢測(cè)到的等位基因數(shù)在29之間，觀察雜合度在01670917之間，期望雜合度在0159O913之間。對(duì)5個(gè)其它鯨類物種進(jìn)行了跨種擴(kuò)增檢驗(yàn)，結(jié)果表明10～13個(gè)座位能有效擴(kuò)增。第6章探討了白海豚屬的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系和種群遺傳學(xué)特征。分析了印度洋、太平洋和大西洋的124個(gè)白海豚個(gè)體的286BP的線粒體控制區(qū)序列。所有中國水域的白海豚個(gè)體聚為單獨(dú)的一支，并獲得較高的支持率，表明中國水域的白海豚均應(yīng)屬于同一個(gè)物種。中國的白海豚并沒有和澳大利亞的白海豚聚為一支，而是和來自南非，印度的白海豚，以及STEUSZII聚為一支。這一結(jié)果表明將中國的白海豚和澳大利亞白海豚劃為一個(gè)種的提法需要修正。通過分析中國水域廈門種群和珠江口種群的65個(gè)個(gè)體的334BP的線粒體控制區(qū)序列，發(fā)現(xiàn)了6個(gè)單元型。種群內(nèi)極低的遺傳多樣性水平和種群間顯著的較高的遺傳分化表明制定保護(hù)措施時(shí)應(yīng)將這兩個(gè)種群作為兩個(gè)不同的保護(hù)管理單元。關(guān)鍵詞江豚，中華白海豚，MTDNA，AFLP微衛(wèi)星，進(jìn)化，保護(hù)H

簡介：復(fù)旦大學(xué)碩士學(xué)位論文學(xué)校代碼10246學(xué)號(hào)10210700139性染色體多態(tài)性遺傳標(biāo)記的法醫(yī)遺傳學(xué)研究院系專業(yè)姓名導(dǎo)師指導(dǎo)小組成員完成日期生命科學(xué)學(xué)院人類生物學(xué)馬騰金力教授李士林副教授2013年5月22日目錄中文摘要3ABSTRACT。S前言7日U舌71法醫(yī)遺傳學(xué)72遺傳標(biāo)記73性染色體多態(tài)性遺傳標(biāo)記在法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用現(xiàn)狀。11第一部15個(gè)XSTR遺傳標(biāo)記的群體遺傳學(xué)研究及法醫(yī)學(xué)應(yīng)用。1411樣本DNA的采集和提取141215個(gè)XSTR遺傳標(biāo)記多重?zé)晒鈹U(kuò)增體系構(gòu)建1613數(shù)據(jù)分析2314結(jié)果與討論2315討論56第二部分13個(gè)YSTR遺傳標(biāo)記的群體遺傳學(xué)研究5721DNA樣本采集5722YSTR遺傳標(biāo)記的篩選。572。3T3個(gè)YSTR遺傳標(biāo)記多重?cái)U(kuò)增熒光檢測(cè)體系構(gòu)建5824數(shù)據(jù)分析5925結(jié)果及討論62結(jié)論84參考文獻(xiàn)。85論文發(fā)表情況89復(fù)Q大學(xué)碩學(xué)位論文1

簡介：目的組蛋白的翻譯后修飾是表觀遺傳調(diào)控的重要內(nèi)容，已被證實(shí)在腫瘤的發(fā)生和發(fā)展過程中扮演了重要的角色。環(huán)指蛋白2（RINGFINGERPROTEIN2，RNF2）是多梳蛋白抑制性復(fù)合物1（POLYCOMBREPRESSIVECOMPLEX1，PRC1）的催化亞單位，可介導(dǎo)組蛋白H2A（HISTONE2A，H2A）的單泛素化修飾。研究表明，RNF2在多種腫瘤中呈特異性高表達(dá)，且具有促腫瘤效應(yīng)。但是RNF2在前列腺癌（PROSTATECANCER，PCA）中的研究還鮮有報(bào)導(dǎo)。在本研究中，我們首先通過對(duì)PCA組織和良性前列腺增生組織（BENIGNPROSTATICHYPERPLASIA，BPH）中RNF2的表達(dá)進(jìn)行檢測(cè)，以明確RNF2在PCA中的表達(dá)水平。隨后，通過在PCA細(xì)胞系中特異性下調(diào)RNF2的表達(dá)，檢測(cè)細(xì)胞周期、凋亡和細(xì)胞活力的變化，以明確RNF2在PCA中的生物學(xué)功能。進(jìn)一步，我們通過尋找差異性表達(dá)基因，篩選、驗(yàn)證受RNF2調(diào)控的下游靶基因并探索其相關(guān)的分子機(jī)制。方法1利用免疫組織化學(xué)染色（IMMUNOHISTOCHEMISTRY，IHC）對(duì)含有PCA（N81）和BPH（N71）的組織芯片（TISSUEMICROARRAY，TMA）進(jìn)行RNF2的染色并利用HSCE評(píng)分系統(tǒng)對(duì)RNF2的表達(dá)水平進(jìn)行評(píng)分，對(duì)PCA組織和BPH組織中RNF2的表達(dá)進(jìn)行差異性分析，并對(duì)PCA組織中RNF2的表達(dá)水平與腫瘤的GLEASON評(píng)分進(jìn)行相關(guān)性分析。2設(shè)計(jì)并合成靶向RNF2的特異性小干擾RNA（SMALLINTERFERINGRNA，SIRNA）（SIRNF2＃1和SIRNF2＃2）以及陰性對(duì)照SIRNA（SINC）。將它們轉(zhuǎn)染DU145和LNCAP細(xì)胞并利用實(shí)時(shí)定量PCR（QUANTITATIVEREALTIMEPCR，RTQPCR）和蛋白電泳（WESTERNBLOT，WB）對(duì)下調(diào)效果分別在MRNA水平和蛋白水平進(jìn)行驗(yàn)證。利用流式細(xì)胞術(shù)（FLOWCYTOMETRY，F(xiàn)CM）對(duì)各處理組細(xì)胞的凋亡和細(xì)胞周期進(jìn)行檢測(cè)。利用噻唑藍(lán)比色法（3（45DIMETHYL2THIAZOLYL）25DIPHENYL2HTETRAZOLIUMBROEASSAY，MTTASSAY）檢測(cè)各處理組細(xì)胞的活力。3設(shè)計(jì)并合成靶向RNF2的特異性短發(fā)卡RNA（SHTHAIRPINRNA，SHRNA）（SHRNF2＃1和SHRNF2＃2）及對(duì)照SHRNA（SHSCR），構(gòu)建帶綠色熒光蛋白（GREENFLUESCENCEPROTEIN，GFP）的SHRNA慢病毒表達(dá)載體。將慢病毒包裝載體及SHRNA表達(dá)載體共同轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞進(jìn)行慢病毒的包裝，所得慢病毒分別命名為SHRNF2＃1、SHRNF2＃2和SHSCR。所得慢病毒分別感染DU145和LNCAP細(xì)胞，熒光顯微鏡下觀察感染效率。利用RTQPCR和WB檢測(cè)RNF2的下調(diào)效果，利用FCM和MTT檢測(cè)各處理組細(xì)胞的周期、凋亡和細(xì)胞活力變化。4將SHRNF2＃1、SHRNF2＃2和SHSCR感染后的DU145細(xì)胞進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng)，以5106個(gè)細(xì)胞分別接種于裸鼠背外側(cè)近右側(cè)大腿處，觀察各處理組移植瘤的生長情況，繪制生長曲線。觀察結(jié)束后對(duì)所有實(shí)驗(yàn)小鼠實(shí)施安樂死，對(duì)腫瘤組織進(jìn)行固定、包埋和切片。利用IHC對(duì)各處理組腫瘤組織中增殖細(xì)胞核抗原（PROLIFERATINGCELLNUCLEARANTIGEN，PCNA）和活化型半胱天冬酶3（CLEAVEDCASPASE3，CLEAVEDCASP3）進(jìn)行染色，以評(píng)價(jià)細(xì)胞的增殖和凋亡情況。5SIRNF2＃1、SIRNF2＃2和SINC分別轉(zhuǎn)染DU145細(xì)胞，72小時(shí)后提取各處理組細(xì)胞總RNA并送上海伯豪生物技術(shù)公司進(jìn)行數(shù)字基因表達(dá)譜檢測(cè)，尋找RNF2下調(diào)組細(xì)胞與正常對(duì)照組細(xì)胞的差異性表達(dá)基因，并利用GENEONTOLOGY、BIOCARTAATCG等在線數(shù)據(jù)庫對(duì)差異性表達(dá)基因進(jìn)行基因本體（GENEONTOLOGY，GO）分析。利用RTQPCR和WB進(jìn)行驗(yàn)證，尋找RNF2的潛在功能性下游靶基因。對(duì)方法4中所得各處理組移植瘤組織進(jìn)行RNF2和相應(yīng)靶基因的IHC染色，驗(yàn)證二者的相關(guān)性。6針對(duì)前期實(shí)驗(yàn)篩選出的RNF2潛在下游靶基因硫氧還蛋白結(jié)合蛋白基因（THIEDOXININTERACTINGPROTEIN，TXNIP）設(shè)計(jì)合成特異性SIRNA和SHRNA，構(gòu)建SHRNA的慢病毒表達(dá)載體并進(jìn)行慢病毒包裝，分別命名為SITXNIP和SHTXNIP。利用SITXNIP和SHTXNIP對(duì)RNF2下調(diào)細(xì)胞進(jìn)行功能學(xué)挽救實(shí)驗(yàn)。SIRNA實(shí)驗(yàn)分組為SIRNF2＃1、SITXNIP、SIRNF2＃1SITXNIP和SINC；SHRNA實(shí)驗(yàn)分組為SHRNF2＃1、SHTXNIP、SHRNF2＃1SHTXNIP和SHSCR。利用RTQPCR和WB檢測(cè)各處理組細(xì)胞RNF2和TXNIP的表達(dá)水平，利用FCM和MTT檢測(cè)細(xì)胞的周期、凋亡和細(xì)胞活力的變化。7針對(duì)TXINP基因啟動(dòng)子區(qū)設(shè)計(jì)特異性PCR引物，利用染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)（CHROMATINIMMUNOPRECIPITATION，CHIP）檢測(cè)TXNIP啟動(dòng)子區(qū)RNF2的富集和組蛋白H2AK119UB的水平。利用SIRNA特異性下調(diào)RNF2的表達(dá)后，檢測(cè)RNF2和H2AK119UB在TXNIP啟動(dòng)子區(qū)的富集和水平變化。結(jié)果1對(duì)TMA的IHC染色和HSCE評(píng)分結(jié)果顯示，PCA組織中RNF2的表達(dá)水平（HSCE11753±6234）明顯高于BPH組織（HSCE9014±6366）。PCA組織中，RNF2的表達(dá)水平與GLEASON評(píng)分的相關(guān)性分析結(jié)果顯示，GLEASON評(píng)分高（GLEASON評(píng)分＞7）的PCA組織中RNF2的表達(dá)水平（HSCE15050±6203）明顯高于GLEASON評(píng)分低（GLEASON評(píng)分≤6）的PCA組織（HSCE9710±5363）。2RTQPCR和WB結(jié)果顯示，SIRNF2＃1和SIRNF2＃2均能在MRNA水平和蛋白水平有效下調(diào)RNF2的表達(dá)。FCM檢測(cè)結(jié)果顯示，與對(duì)照組細(xì)胞相對(duì)，RNF2下調(diào)組DU145和LNCAP的G1期細(xì)胞和凋亡細(xì)胞顯著增加。MTT結(jié)果提示，RNF2下調(diào)組細(xì)胞的活力較正常對(duì)照組顯著降低。3成功包裝能特異性下調(diào)RNF2的慢病毒顆粒并能有效感染目的細(xì)胞。RTQPCR和WB結(jié)果顯示，SHRNF2＃1和SHRNF2＃2均能在MRNA水平和蛋白水平有效下調(diào)RNF2的表達(dá)。細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示，SHRNF2＃1和SHRNF2＃2可誘導(dǎo)DU145和LNCAP細(xì)胞的G1期阻滯、凋亡增加和細(xì)胞活力下降。4成功建立了SHSCR、SHRNF2＃1和SHRNF2＃2慢病毒感染后的DU145細(xì)胞裸鼠移植瘤模型。結(jié)果顯示，SHSCR、SHRNF2＃1和SHRNF2＃2處理組移植瘤在觀察終點(diǎn)的體積分別為84680±5529MM3、30433±6372MM3和33193±8442MM3。腫瘤生長曲線結(jié)果顯示，實(shí)驗(yàn)組移植瘤的生長速度顯著低于對(duì)照組。IHC染色結(jié)果顯示，與SHSCR處理組相比，SHRNF2＃1和SHRNF2＃2處理組腫瘤組織中PCNA的表達(dá)水平明顯降低，而CLEAVEDCASP3的水平顯著增加。5對(duì)數(shù)字基因表達(dá)譜結(jié)果的分析顯示，特異性下調(diào)RNF2所導(dǎo)致的≥15倍的差異化表達(dá)基因達(dá)632個(gè)，其中144個(gè)基因表達(dá)上調(diào)。利用GENEONTLOGY和BIOCARTATCGA等數(shù)據(jù)庫的GO分析結(jié)果顯示，大量差異性表達(dá)基因參與細(xì)胞周期、有絲分裂、增殖和凋亡等生物學(xué)行為的調(diào)控?；赑CGS的轉(zhuǎn)錄抑制功能考慮，我們重點(diǎn)對(duì)表達(dá)顯著上調(diào)的基因進(jìn)行了分析、篩選并利用RTQPCR和WB進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果顯示，與細(xì)胞增殖、凋亡和周期調(diào)控密切相關(guān)的TXNIP是RNF2潛在的重要功能性下游靶基因。對(duì)DU145細(xì)胞裸鼠移植瘤組織的IHC染色結(jié)果顯示，RNF2下調(diào)組的腫瘤組織中TXNIP的表達(dá)水平顯著高于對(duì)照組腫瘤組織。6RTQPCR和WB結(jié)果顯示，SITXNIP和SHTXNIP均能有效下調(diào)TXNIP的MRNA水平和蛋白水平。FCM結(jié)果顯示，通過SIRNA或SHRNA同時(shí)下調(diào)RNF2和TXNIP可有效挽救單獨(dú)下調(diào)RNF2所導(dǎo)致的DU145和LNCAP細(xì)胞凋亡增加和G1期阻滯。MTT實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示，同時(shí)下調(diào)RNF2和TXNIP可有效挽救單獨(dú)下調(diào)RNF2所導(dǎo)致的DU145和LNCAP細(xì)胞活力降低。7CHIP實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示，RNF2可直接結(jié)合于TXNIP的啟動(dòng)子區(qū)并促進(jìn)組蛋白H2AK119的單泛素化。利用SIRNA特異性下調(diào)RNF2的表達(dá)后，RNF2的富集和H2AK119UB的水平均顯著降低。結(jié)論1RNF2在PCA中的表達(dá)水平顯著高于BPH，且其表達(dá)水平與腫瘤的GLEASON評(píng)分呈正相關(guān)，RNF2在PCA的發(fā)生發(fā)展過程中具有促腫瘤效應(yīng)。2RNF2對(duì)PCA細(xì)胞的周期、凋亡和細(xì)胞活力有重要的調(diào)控作用，下調(diào)RNF2可誘導(dǎo)PCA細(xì)胞發(fā)生周期阻滯，凋亡增加和細(xì)胞活力下降，并可顯著抑制PCA裸鼠移植瘤的生長。3RNF2下調(diào)可誘導(dǎo)大量下游靶基因的表達(dá)變化，其中TXNIP是其中一種功能性下游靶基因，RNF2的生物學(xué)功能部分依賴于它對(duì)TXNIP的表達(dá)調(diào)控。4RNF2可直接結(jié)合于TXNIP的啟動(dòng)子區(qū)，并促進(jìn)組蛋白H2AK119的單泛素化從而調(diào)控TNXIP的轉(zhuǎn)錄。5RNF2是PCA潛在的生物標(biāo)志分子和治療靶點(diǎn)。

簡介：環(huán)孢子蟲（CYCLOSPA）為艾美球蟲科EIMERIIDAE環(huán)孢子蟲屬CYCLOSPA成員，在世界范圍內(nèi)流行傳播，具廣泛宿主。環(huán)孢子蟲為一種新近發(fā)現(xiàn)的腸道寄生原蟲，主要寄生于宿主小腸的上皮細(xì)胞，可引起宿主食欲減退、體重減輕、持續(xù)性腹瀉、腸痙攣及其它胃腸炎等臨床癥狀。免疫功能止常者感染環(huán)孢子蟲后主要引起白限性腹瀉，而對(duì)于免疫抑制者或免疫功能缺陷者，感染環(huán)孢子蟲后則可致持續(xù)性腹瀉甚至死亡。近年來，環(huán)孢子蟲病受到國內(nèi)外越來越多研究人員的廣泛關(guān)注和重視。2008年7月劍2010年1月，采用福爾馬林乙酸乙酯沉淀法、飽和蔗糖溶液漂浮法和改良抗酸染色法對(duì)河南省鄭州地區(qū)3家醫(yī)院的病人進(jìn)行環(huán)孢子蟲的感染情況進(jìn)行調(diào)查，共發(fā)現(xiàn)環(huán)孢子蟲感染者29例。用PCR方法對(duì)其18SRRNA基因和ITS1基因擴(kuò)增，序列比對(duì)結(jié)果經(jīng)系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)育分析，所獲環(huán)孢子蟲蟲株均屬于卡耶塔環(huán)孢子蟲。本次試驗(yàn)共調(diào)查5285名病人，總感染率為05％295825。其中，河南省人民醫(yī)院、鄭州市兒童醫(yī)院和鄭州大學(xué)三附院病人環(huán)孢子蟲感染率分別為05224836、053608和104381春季、夏季、秋季和冬季環(huán)孢子蟲感染率分別為000823、10212017、0481878和000567，表明環(huán)孢子蟲感染與季節(jié)具有明顯相關(guān)性P＜001；此次調(diào)查發(fā)現(xiàn)各個(gè)年齡段均發(fā)現(xiàn)有環(huán)孢子蟲感染，其中以0～17歲和60歲以上感染率較高，表明環(huán)孢子蟲感染與年齡具有相關(guān)性P＜005；男性的環(huán)孢子蟲感染率為06193154，女性的感染率為05102131，表明環(huán)孢子蟲感染與性別無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義P＞005。100倍光學(xué)顯微鏡下測(cè)量50個(gè)環(huán)孢子蟲卵囊，大小為75ΜM75ΜM?；?8SRRNA基因和ITS1基因?qū)?9個(gè)環(huán)孢子蟲陽性樣品進(jìn)行巢式PCR擴(kuò)增，對(duì)擴(kuò)增出的29個(gè)環(huán)孢子蟲樣品的18SRRNA基因和7個(gè)環(huán)孢子蟲樣品的ITS1基因進(jìn)行測(cè)序，拼接比對(duì)后的序列通過NCBI、EMBL和DDBJ三大分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫搜索同源序列，然后運(yùn)用CLUSTALXL81、PHYLIP364和DNASTAR50等分子生物學(xué)軟件對(duì)所獲得的序列進(jìn)行比對(duì)分析、構(gòu)建分子進(jìn)化樹?；?8SRRNA基因位點(diǎn)分析，結(jié)果表明29個(gè)人源環(huán)孢子蟲樣品與CCAYETANENSIS進(jìn)化關(guān)系最為接近，僅存在兩個(gè)堿基差異。而根據(jù)在ITS1基因位點(diǎn)種系進(jìn)化分析，表明同一地理位置的分離株同源性較高。本研究對(duì)河南省鄭州地區(qū)人源環(huán)孢子蟲流行狀況進(jìn)行了調(diào)查，了解對(duì)了人源環(huán)孢子蟲在河南省的流行情況及特點(diǎn)，并運(yùn)用分子生物學(xué)方法進(jìn)行了分析，掌握了河南省人源環(huán)孢子蟲遺傳特征及分子特性，為以后人源環(huán)孢子蟲在全國范圍內(nèi)的研究奠定了基礎(chǔ)。

簡介：“LLLFLLHLLLLIRMLIILY3268598分類號(hào)；避密級(jí)蛩五中文越目荽文臆目單位代碼學(xué)號(hào)10159201410068博士學(xué)位論文應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)檢測(cè)人線牲體奎基因姐檢測(cè)方法、數(shù)據(jù)分析簌略的建立與群體遺傳學(xué)研究＆MTCGIESFORCOR印LETCMITOCHONDRLALGENOMCSEQUENCLNGANDPOPULATIONSMDI％USILTGMASSIVEPBMILOLSEQUENCINGTCDMOLOGY論文作者旦墼豎指導(dǎo)教師蓋盤堡絲熊學(xué)科專業(yè)鎏匿塹塹莖完成時(shí)間T墊Z主3旦中國醫(yī)科大學(xué)學(xué)位論文獨(dú)創(chuàng)性聲明本人鄭重聲明本論文是我個(gè)人在導(dǎo)師指導(dǎo)下獨(dú)立進(jìn)行的研究工作及取得的研究成果，論文中除加以標(biāo)注的內(nèi)容外，不包含其他人或機(jī)構(gòu)已經(jīng)發(fā)表或撰寫過的研究成果，也不包含本人為獲得其他學(xué)位而使用過的成果。對(duì)本研究提供貢獻(xiàn)的其他個(gè)人和集體均己在文中進(jìn)行了明確的說明并表示謝意。本人完全意識(shí)到本聲明的法律結(jié)果由本人承擔(dān)。論文作者簽名最私鈞日期2017年5月24日中國醫(yī)科大學(xué)學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)書本學(xué)位論文作者完全了解學(xué)校有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定，同意學(xué)校保留并向國家有關(guān)部門或機(jī)構(gòu)送交學(xué)位論文的原件、復(fù)印件和電子版，允許學(xué)位論文被查閱和借閱。本人授權(quán)中國醫(yī)科大學(xué)可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索，可以采用影印、縮印或掃描等復(fù)制手段保存和匯編學(xué)位論文。保密，在年后解密適用本授權(quán)書。保密請(qǐng)?jiān)诶ㄌ?hào)內(nèi)劃“4“論文作鋼私名’論文作者簽名F汐＼鍵玉幣。1日期2017年5月24目＼J孑。／M∥2哆月◇彳七年名“簽加JJY幣教導(dǎo)期指日

簡介：研究目的通過分析16名46，XY性發(fā)育異常（46XYDISDEROFSEXDEVELOPMENT，46，XYDSD）患者的臨床表現(xiàn)、生化特征以及分子遺傳學(xué)改變，探討46，XYDSD的臨床表型譜和分子病因。研究方法對(duì)來自14個(gè)家系共計(jì)16名46，XYDSD患者進(jìn)行血清激素水平的測(cè)定，并對(duì)患者的SRD5A2基因及雄激素受體（AR）基因的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行直接測(cè)序。通過定點(diǎn)誘變、細(xì)胞轉(zhuǎn)染以及體外酶活性分析檢測(cè)的3種新的SRD5A2基因突變類型對(duì)5Α還原酶功能的影響。采用單倍型分析方法探索5ΑRD2患者中常見的突變類型PQ6X在中國人群中是否存在祖先效應(yīng)（FOUNDEREFFECT）。研究結(jié)果16名患者染色體核型均為46，XY，且都存在小陰莖、尿道下裂和隱睪等不同程度外生殖器發(fā)育異常的表現(xiàn)。從13名患者中檢出SRD5A2基因的14種突變類型；另外3名患者存在2種AR基因的突變類型。在所有SRD5A2基因的突變類型中，突變PK35N、PH162P及PY136X為首次報(bào)道。體外實(shí)驗(yàn)證明，突變PY136X使5Α還原酶2型同工酶的活性完全喪失，而突變PK35N及PH162P僅部分影響酶的活性。單倍型分析結(jié)果顯示突變PQ6X在中國人群中不存在祖先效應(yīng)。結(jié)論本研究描述了16例中國46，XYDSD患者的臨床特征及生化異常，通過分子遺傳學(xué)研究進(jìn)一步揭示了相關(guān)基因突變譜。體外功能實(shí)驗(yàn)探索了新發(fā)現(xiàn)的SRD5A2基因突變類型對(duì)酶活性的影響，為理解46，XY性發(fā)育異常疾病的發(fā)病機(jī)制以及疾病的早期診斷提供了更多依據(jù)。

簡介：重慶醫(yī)科大學(xué)碩士學(xué)位論文4個(gè)WINISTR位點(diǎn)的遺傳學(xué)調(diào)查姓名姚嵐申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別碩士專業(yè)法醫(yī)學(xué)指導(dǎo)教師萬立華201205重慶醫(yī)科大學(xué)碩士研究生學(xué)位論文別明顯，所以不同地區(qū)的非CODIS系統(tǒng)調(diào)查有必要性，目前尚缺乏重慶地區(qū)的相關(guān)研究。為了給國產(chǎn)試劑盒的研究提供基礎(chǔ)，對(duì)D1S1627，D2S441，D10S1248，D22S1045的4個(gè)MINISTR基因座進(jìn)行3色熒光標(biāo)記，并制作相應(yīng)的等位基因分型標(biāo)準(zhǔn)物，進(jìn)行本地區(qū)的遺傳學(xué)的相關(guān)調(diào)查。方法采用CHELEXL00的方法提取170份重慶地區(qū)無關(guān)的健康個(gè)體全基因組DNA，將PCR的擴(kuò)增體系為10UL，將反應(yīng)體系中的引物濃度、M92濃度，循環(huán)數(shù)，退火溫度，DNTP，DNATAQ酶都進(jìn)行優(yōu)化找出最適合的反應(yīng)條件，然后再用聚丙烯酰胺凝膠電泳PAGE分離擴(kuò)增產(chǎn)物后銀染，選擇適合的等位基因后將凝膠內(nèi)的DNA回收，將回收物純化后再次擴(kuò)增，進(jìn)行聚丙烯酰胺凝膠電泳檢驗(yàn)和測(cè)序，按照國際法庭血液遺傳學(xué)會(huì)ISFH推薦的命名方式將其命名，將通過調(diào)整其濃度使電泳圖上得峰高達(dá)到一致。將實(shí)驗(yàn)室自制的等位基因標(biāo)準(zhǔn)物進(jìn)行樣本的遺傳學(xué)研究。然后用TAMPA、6FAM、HEX分別標(biāo)記引物D10S1248，D2S441和D1S1627，D22S1045的上游引物的5’端。將自制的等位基因標(biāo)準(zhǔn)物和引物一起在ABI公司的3130測(cè)序儀上面電泳，進(jìn)行基因分型分析。結(jié)果復(fù)合擴(kuò)增結(jié)果，LOUL的復(fù)合擴(kuò)增10PCR緩沖液LU1，LMMOL／L；MGCL20．6P1，25MMOL／L；DNTP1U1，2。5MMOL／LD2S441，D1S1627上、下游引物各0．20UL，10BMOL／L；D10S1248，D22S1045上、下游引物各0．30UL，10UMOL／L，TAQDNA聚合酶0．15P1，L5U／U1，模板DNA1UL1NG／UL，滅菌雙蒸水2．55U1。PCR擴(kuò)增4

簡介：中國海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文3種刻肋海膽的形態(tài)學(xué)與遺傳學(xué)及中國刻肋海膽科分類學(xué)研究姓名張文峰申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別碩士專業(yè)增殖養(yǎng)殖工程指導(dǎo)教師曾曉起2011053種刻肋海膽的形態(tài)學(xué)與遺傳學(xué)及中國刻肋海膽科分類學(xué)研究II肋海膽和TALEXRI在約500萬年前分化。分化事件主要發(fā)生在中新世晚期（LATEMIOCENE）至上新世早期（EARLYPLIOCENE）。3以雜色角孔海膽（SALMACISSPHAEROIDES）為外群，應(yīng)用距離法NJ、最大簡約法MP、最大似然法ML，分別構(gòu)建16SRRNA和COⅠ基因片段的系統(tǒng)發(fā)育樹。得到的系統(tǒng)發(fā)育樹拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)基本一致均為哈氏刻肋海膽和細(xì)雕刻肋海膽先聚為一支，再與TALEXRI聚類；芮氏刻肋海膽和TMICHAELSENI聚為一支。本文第二部分以刻肋海膽科為研究對(duì)象，對(duì)其中6種海膽細(xì)雕刻肋海膽、哈氏刻肋海膽、芮氏刻肋海膽、刻孔海膽、雜色角孔海膽和疏棘角孔海膽的外部形態(tài)進(jìn)行觀察描述記錄，利用顯微照相與微距照相設(shè)備對(duì)每種海膽的殼、步帶板、間步帶板、頂系、棘等進(jìn)行圖像采集。在此基礎(chǔ)上，與前人對(duì)它們的形態(tài)描述進(jìn)行了比較分析，認(rèn)為刻痕的深度、形狀以及所在位置是判別各個(gè)種的主要特征，另外，根據(jù)各個(gè)板上疣的排列規(guī)律和頂系的特點(diǎn)可進(jìn)行進(jìn)一步判別。同時(shí)，也發(fā)現(xiàn)了和前人描述的結(jié)果存在差異的一些特征。本部分研究補(bǔ)充完善了這6種海膽的分類學(xué)資料。關(guān)鍵詞刻肋海膽屬；形態(tài)學(xué)；線粒體DNA（MTDNA）；16SRRNA；細(xì)胞色素氧化酶Ⅰ（COⅠ）；系統(tǒng)發(fā)育；刻肋海膽科

簡介：西施舌是我國沿海的一種名貴雙殼貝類具有很高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值由于海域污染及濫捕等原因?qū)е沦Y源量受到嚴(yán)重破壞。目前西施舌人工育苗方面雖有較為系統(tǒng)的研究但仍存在一些問題幼貝成活率低成為制約人工養(yǎng)殖的主要因素。西施舌群體遺傳多樣性和遺傳分化的研究對(duì)于其種質(zhì)資源的保護(hù)和良種選育具有重要意義。本研究采用等位酶和AFLP技術(shù)對(duì)我國沿海西施舌群體進(jìn)行了遺傳多樣性和遺傳分化的研究以期為我國西施舌種質(zhì)資源的可持續(xù)利用及保護(hù)加快良種選育提供科學(xué)依據(jù)。1采用非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳對(duì)江蘇啟東、福建漳港和廣西北海3個(gè)地區(qū)的西施舌野生群體進(jìn)行等位酶電泳檢測(cè)和酶譜分析。獲得7個(gè)酶12個(gè)位點(diǎn)其中8個(gè)位點(diǎn)為單態(tài)位點(diǎn)即AAT1、ME1、EST2、EST4、ACP1、ACP2、AMY1、AMY24個(gè)位點(diǎn)為多態(tài)位點(diǎn)即SOD1、MDH1、EST1、EST3。雜合性分析結(jié)果顯示多態(tài)位點(diǎn)中福建漳港群體的SOD1和EST1位點(diǎn)、廣西北海群體的SOD1位點(diǎn)符合HARDYWEINBERG平衡P＞005江蘇啟東西施舌群體的多態(tài)位點(diǎn)中所有位點(diǎn)福建漳港西施舌群體的多態(tài)位點(diǎn)中MDH1、EST3位點(diǎn)廣西北海西施舌群體的多態(tài)位點(diǎn)中MDH1、EST1、EST3位點(diǎn)均非常顯著偏離HARDYWEINBERG平衡P＜001。此外所有多態(tài)位點(diǎn)中除了江蘇啟東和福建漳港群體的EST1位點(diǎn)表現(xiàn)出雜合子缺失F＞0外各群體中每個(gè)位點(diǎn)均表現(xiàn)出雜合子過量F＜0。2等位酶分析西施舌群體遺傳多樣性和遺傳分化結(jié)果顯示3個(gè)群體平均每位點(diǎn)等位基因數(shù)目A為17500平均每位點(diǎn)有效等位基因數(shù)目AE為13939平均多態(tài)位點(diǎn)百分?jǐn)?shù)P為3333％觀察雜合度H0在02389到03083之間平均值為02750期望雜合度HE在01496到02041之間平均值為01765群體間遺傳分化系數(shù)GST為00719群體間的遺傳距離D在00164到00302之間。結(jié)合雜合性分析結(jié)果表明我國西施舌種質(zhì)資源狀況處于較好水平。3利用擴(kuò)增片斷長度多態(tài)性AMPLIFIEDFRAGMENTLENGTHPOLYMPHISMAFLP標(biāo)記技術(shù)對(duì)我國沿海山東青島、江蘇啟東、福建漳港和廣西北海4個(gè)地區(qū)的野生西施舌群體和福建漳港地區(qū)的1個(gè)養(yǎng)殖群體進(jìn)行了遺傳多樣性和遺傳分化的研究。9對(duì)選擇性引物共擴(kuò)增618個(gè)位點(diǎn)。遺傳多樣性結(jié)果顯示西施舌5個(gè)群體的平均每位點(diǎn)等位基因數(shù)A介于1391616036之間平均為15000平均每位點(diǎn)有效等位基因數(shù)AE介于1173312431之間平均為12124多態(tài)位點(diǎn)百分?jǐn)?shù)P介于3916％6036％之間平均為4998％SHANNON氏指數(shù)I介于0168402354之間平均為02067NEIS基因多樣性指數(shù)H介于0107301506之間平均為01320。其中野生群體遺傳多樣性水平略高于養(yǎng)殖群體。群體間遺傳分化結(jié)果顯示群體間的遺傳分化系數(shù)GST介于0099604835之間平均為03318群體間遺傳距離D介于0036502937之間平均為01858說明西施舌群體間分化較大。通過對(duì)遺傳距離進(jìn)行聚類分析山東青島和江蘇啟東的西施舌群體聚為一支福建漳港和廣西北海的西施舌群體聚為一支結(jié)合遺傳距離D及遺傳分化系數(shù)GST初步認(rèn)為兩支已分化達(dá)到亞種水平并在3對(duì)引物組合EACAMCGT、EACTMCGT、EAGAMCGT的擴(kuò)增結(jié)果中找到15個(gè)可作為亞種鑒別的AFLP標(biāo)記。綜合兩項(xiàng)技術(shù)分析結(jié)果認(rèn)為雖然我國西施舌資源受到嚴(yán)重破壞但還未對(duì)其遺傳多樣性造成嚴(yán)重影響應(yīng)及時(shí)采取有效的保護(hù)措施以期為西施舌人工養(yǎng)殖保留可靠的種質(zhì)資源。5以福建漳港野生西施舌為材料采用FIOFASTISOLATIONBYAFLPSEQUENCESCONTAININGREPEATS方法構(gòu)建西施舌CAN、CTN微衛(wèi)星富集文庫篩選微衛(wèi)星標(biāo)記。西施舌的CAN、CTN微衛(wèi)星富集文庫包含768個(gè)克隆從中取140個(gè)片段大小為5001200BP的克隆測(cè)序共獲得30條串聯(lián)重復(fù)序列N≧4其中11條為小衛(wèi)星序列19條為微衛(wèi)星序列陽性克隆率為1357％。從這些微衛(wèi)星序列中開發(fā)出8個(gè)具有多態(tài)性的微衛(wèi)星標(biāo)記以期用于西施舌群體遺傳學(xué)的進(jìn)一步研究。