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文檔簡(jiǎn)介
1、蛋白質(zhì)在水溶液中主要能夠觀測(cè)到兩種構(gòu)象,起始態(tài)(去折疊肽)和終止態(tài)(折疊肽)。最近的研究表明,模型短肽在水溶液中主要以PPⅡ?yàn)橹鞯臉?gòu)象存在,說(shuō)明蛋白質(zhì)在水溶液中亦有可能主要以PPⅡ構(gòu)象存在。蛋白質(zhì)在去折疊狀態(tài)下為什么主要以PPⅡ構(gòu)象存在?多種非共價(jià)鍵相互作用力如溶劑化作用力、空間位阻效應(yīng)、主鏈側(cè)鏈相互作用力、偶極偶極相互作用力及n-π*超共軛效應(yīng)等都可能對(duì)穩(wěn)定蛋白質(zhì)去折疊狀態(tài)下的PPⅡ構(gòu)象發(fā)揮著重要作用。
本論文主要研究:n-
2、π*超共軛效應(yīng)及它對(duì)模型短肽構(gòu)象的影響;n-π*超共軛效應(yīng)如何隨溶劑極性的改變而變化。Raines小組基于脯氨酸衍生物對(duì)n-π*超共軛效應(yīng)開(kāi)展了系列研究。脯氨酸衍生物可能以順式和反式兩種構(gòu)象存在,n-π*超共軛效應(yīng)僅存在于反式構(gòu)象中。因此,脯氨酸衍生物的Ktrans/cis值將反映n-π*超共軛效應(yīng)的強(qiáng)弱。
本文設(shè)計(jì)了p-X-C6H4-aa-OMe和Ac-aa-NH-C6H4-p-X兩個(gè)系列的模型短肽(aa=Ala,Val,P
3、he,Leu,Ile,Pro;X=OMe,Me,H,Cl,NO2)。因不同取代基X拉電子效應(yīng)強(qiáng)弱不同,預(yù)期n-π*超共軛效應(yīng)的強(qiáng)度將會(huì)相應(yīng)地變化。脯氨酸衍生物的順?lè)幢壤赏ㄟ^(guò)1H NMR圖譜測(cè)得;非脯氨酸衍生物的PPⅡ含量和ΔG可通過(guò)3JαN計(jì)算得到。依據(jù)脯氨酸衍生物的順?lè)幢壤赏茰y(cè)相應(yīng)n-π*超共軛效應(yīng)的強(qiáng)弱,其大小是否和PPⅡ含量之間存在相關(guān)可用于推斷n-π*超共軛效應(yīng)是否有利于PPⅡ構(gòu)象的穩(wěn)定。
實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明:隨著取代基
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