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1、隨著越來(lái)越多的物種的基因測(cè)序的完成,尤其是人類(lèi)基因組的測(cè)序完成,接踵而至的難題就是對(duì)基因組的解釋和分析。面對(duì)龐大的基因數(shù)據(jù),挖掘和分析基因組序列的生命信息就是生物信息學(xué)要解決的主要問(wèn)題?;蝾A(yù)測(cè)是DNA序列分析的一項(xiàng)重要任務(wù),而識(shí)別基因編碼區(qū)是基因預(yù)測(cè)的關(guān)鍵。真核生物基因外顯子的識(shí)別是基因預(yù)測(cè)的重難點(diǎn)。由于真核生物基因編碼區(qū)結(jié)構(gòu)復(fù)雜、外顯子序列較短、存在大量重復(fù)序列等原因,目前對(duì)真核生物的編碼區(qū)預(yù)測(cè)還沒(méi)能取得很好的效果。本文針對(duì)真核生物
2、,主要研究了小鼠基因的預(yù)測(cè)方法。
本文從三個(gè)方面對(duì)基因預(yù)測(cè)進(jìn)行介紹。第一部分:生物信息學(xué)的基本知識(shí)背景簡(jiǎn)介,基因預(yù)測(cè)的國(guó)內(nèi)外研究情況和意義。第二部分:基因預(yù)測(cè)的第一步是基因序列的數(shù)值化映射研究。介紹幾種基因序列的統(tǒng)計(jì)特征及其提取,結(jié)合fisher判別法用這些統(tǒng)計(jì)特征對(duì)基因序列進(jìn)行分類(lèi)判別。第三部分:在3-周期性這一統(tǒng)計(jì)特征的基礎(chǔ)上對(duì)功率譜進(jìn)行研究,提出基于堿基幅角的功率譜和信噪比,并選取適當(dāng)閡值判別。用小鼠基因進(jìn)行試驗(yàn)證明,基
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