1、發(fā)菜,學名發(fā)狀念珠藻(Nostoc flagelliforme),是一種具有較高食用及藥用價值的光能自養(yǎng)型藍藻。在生長代謝過程中,發(fā)菜細胞向胞外分泌大量的發(fā)菜多糖,對細胞起到保護作用,同時研究發(fā)現(xiàn)其亦具有抗氧化、抗病毒、抗腫瘤以及提高免疫等生物活性,有一定的藥用價值。
在鹽脅迫條件下,發(fā)菜多糖分泌量增加。前期對鹽脅迫及正常培養(yǎng)條件下的發(fā)菜樣品進行轉(zhuǎn)錄組測序分析,挖掘參與發(fā)菜響應(yīng)高鹽脅迫的相關(guān)基因。本課題在轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果的基礎(chǔ)上
2、,篩選出部分可能參與鹽脅迫下發(fā)菜多糖代謝相關(guān)的差異表達基因,以發(fā)菜基因組為模板,對其進行克隆與表達,分析差異表達基因的基本特征,豐富發(fā)菜的基因數(shù)據(jù),為進一步研究發(fā)菜多糖的代謝調(diào)控機制提供理論基礎(chǔ)。
對發(fā)菜中的三個糖基轉(zhuǎn)移酶基因(GT1、GT2、GT3)、GDP-甘露糖4,6-脫水酶基因(GMD)、多糖輸出蛋白基因(PEP)進行克隆,得到基因序列,分別對其進行生物信息學分析,結(jié)果如下:
GT1、GT2、GT3、GMD、
3、PEP基因序列大小分別為1290bp、1173bp、948bp、1080bp、1467bp,核酸序列分析均具有較高的保守性。GT1、GT2、GT3、GMD、PEP蛋白分子量大小分別為47.54kDa、43.16kDa、35.99kDa、41.08kDa、51.28kDa,理論等電點分別為9.33、7.64、6.34、5.73、5.50。GT1、GT2、GT3、GMD、PEP均為親水性蛋白,不具有跨膜活性。GT1、GT2、GT3的二級結(jié)構(gòu)
4、主要為隨機卷曲和α螺旋,GMD和PEP的二級結(jié)構(gòu)為隨機卷曲、α螺旋和折疊。
將GT1、GT2、GT3、GMD、PEP進行擴增,與載體pET28a連接,IPTG誘導其在大腸桿菌BL21中表達,分別以IPTG濃度、加入IPTG時菌液OD值、培養(yǎng)溫度為變量進行單因素實驗,SDS-PAGE蛋白電泳比較目的蛋白的表達效果,確定目的蛋白表達的適宜條件。結(jié)果表明,蛋白表達的條件為:IPTG終濃度為1mM,加入IPTG時菌液OD值為0.8,加