單克隆抗體N連接型糖基化的動(dòng)態(tài)圖建模及仿真平臺(tái)開(kāi)發(fā).pdf

1、單克隆抗體藥物是當(dāng)前國(guó)際市場(chǎng)上最具價(jià)值的藥品種類(lèi)之一。雖然單抗藥品需求量大，但由于對(duì)單抗藥制造機(jī)理的不了解和批量制備工藝的不成熟，藥品的產(chǎn)量明顯供不應(yīng)求。糖基化反應(yīng)是單克隆抗體制備過(guò)程中非常重要的一個(gè)環(huán)節(jié)，而且大多數(shù)單抗藥品制備涉及的都是N連接型的糖基化反應(yīng)。N連接型的糖基化反應(yīng)過(guò)程的研究涉及糖基化反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)和糖基化反應(yīng)的動(dòng)態(tài)模型，另外快速準(zhǔn)確地對(duì)糖基化反應(yīng)過(guò)程進(jìn)行仿真計(jì)算也是非常重要的。因此本文針對(duì)糖基化反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)和糖基化反應(yīng)的動(dòng)態(tài)模型以

2、及N連接型的糖基化反應(yīng)仿真計(jì)算平臺(tái)的研發(fā)進(jìn)行了研究和探索，主要分為以下三個(gè)方面:
　　針對(duì)糖基化反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)的生成問(wèn)題，引入圖論的方法，使用圖模型表示N連接糖型結(jié)構(gòu)和N連接型糖基化反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)。在圖表示的基礎(chǔ)上，N連接型糖基化反應(yīng)的發(fā)生條件可以使用糖基化反應(yīng)規(guī)則表來(lái)表示。配合分支限界法，使用糖基化反應(yīng)規(guī)則表可以生成相應(yīng)的糖基化反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)。
　　針對(duì)建立糖基化反應(yīng)動(dòng)態(tài)模型的問(wèn)題，指出N連接型糖基化反應(yīng)的動(dòng)態(tài)模型包含兩個(gè)部分，一是糖蛋白的

3、轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程，二是N連接型糖基化的反應(yīng)過(guò)程。糖蛋白的轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程描述的是合成的蛋白質(zhì)是如何在高爾基體內(nèi)各個(gè)膜囊間順次轉(zhuǎn)移的，而N連接型糖基化的反應(yīng)過(guò)程描述的是在合成的蛋白質(zhì)上是如何連接寡糖鏈，并且這些寡糖鏈?zhǔn)侨绾卧谔腔D(zhuǎn)移酶和糖苷酶的作用下連接新的單糖的。綜合兩部分的反應(yīng)方程，可以得到N連接型糖基化反應(yīng)的動(dòng)態(tài)方程，從而可以通過(guò)仿真計(jì)算得出相應(yīng)的動(dòng)態(tài)過(guò)程。
　　針對(duì)N連接型的糖基化反應(yīng)仿真計(jì)算的問(wèn)題，研發(fā)了N連接型糖基化反應(yīng)仿真平臺(tái)GMV。