家蠶中腸和培養(yǎng)細(xì)胞的蛋白質(zhì)組學(xué)研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、利用雙向電泳和基質(zhì)輔助激光解析飛行時間質(zhì)譜結(jié)合的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對家蠶5齡期不同發(fā)育時期的中腸蛋白質(zhì)組進(jìn)行了比較研究;通過多維液相色譜和串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用的蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對5齡期第2天家蠶幼蟲的中腸蛋白質(zhì)組組成進(jìn)行了分析,通過一維電泳、多維液相色譜分離技術(shù)以及串聯(lián)質(zhì)譜結(jié)合的方法對BmNPV感染前后的家蠶BmN培養(yǎng)細(xì)胞的蛋白質(zhì)組組成進(jìn)行了分析研究,對比它們之間的差異性。在此基礎(chǔ)上通過生物信息學(xué)分析和分子生物學(xué)技術(shù)對通過蛋白質(zhì)組學(xué)鑒定的2種抗病毒蛋

2、白的分子生物學(xué)特征以及抗病毒活性進(jìn)行了分析和研究。主要結(jié)果如下:
   1、對家蠶5齡期第2天、第5天和第7天的中腸組織蛋白質(zhì)進(jìn)行了2D電泳,建立不同時期標(biāo)準(zhǔn)的蛋白質(zhì)參考圖譜。利用ImageMaster2D Platinum對蛋白圖譜進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)家蠶中腸蛋白質(zhì)大多分布在pI值4-8、分子量20-70 kDa的區(qū)域。5齡期家蠶第2天的蛋白質(zhì)斑點數(shù)目為869個,第5天為966個,新增蛋白數(shù)目97個,增加的蛋白主要分布在pI6-9,

3、分子量20-40 KDa區(qū)間;進(jìn)入幼蟲成熟期(第7天)的蛋白質(zhì)斑點數(shù)目明顯減少,僅為420個,斑點數(shù)減少了56.5%。利用MALDI-TOF-MS對差異表達(dá)的部分蛋白質(zhì)斑點進(jìn)行鑒定,發(fā)現(xiàn)在5齡期初期和旺食期(第2天和第5天),表達(dá)量較大的蛋白主要是由家蠶中腸的肌肉層和上皮層的結(jié)構(gòu)蛋白,與中腸消化和吸收功能相關(guān)的蛋白以及與家蠶細(xì)胞凋亡相關(guān)的蛋白組成,它們分別是肌動蛋白、胞質(zhì)型肌動蛋白A3al、微管蛋白α-8鏈、角蛋白1、熱激70 kDA蛋

4、白類似物3、液泡性ATP合成酶催化單位A、硫醇抗氧化蛋白、AGL165Wp、精氨酸激酶等、血淋巴3nk蛋白(基因6G1)和主要血漿蛋白30 k等。這些蛋白大多數(shù)在家蠶5齡期末期表達(dá)量下降,甚至完全降解,除液泡性ATP合成酶催化單位A以外。液泡性ATP合成酶催化單位A表達(dá)量上升可能和家蠶中腸5齡期末期需要大量的能量降解家蠶中腸本身的組織蛋白,從而盡快消化失去生物功能的家蠶中腸組織有關(guān)。
   2、為了進(jìn)一步詳細(xì)解析中腸蛋白質(zhì)組的組

5、成并解釋中腸的生物學(xué)功能,利用納米液相色譜電噴霧串聯(lián)質(zhì)譜分析了家蠶中腸的蛋白質(zhì)組,獲得的質(zhì)譜數(shù)據(jù)利用X!Tandem搜索軟件通過不同的參數(shù)進(jìn)行分析,并且通過泊松模型進(jìn)行確認(rèn),最終共獲得90個蛋白點。其中79個蛋白點被首次描述,發(fā)現(xiàn)22個蛋白點與中腸的消化功能密切相關(guān),包括中腸上皮細(xì)胞分泌的11種酶,腸壁肌肉所需要的8種驅(qū)動蛋白和防止食物摩擦腸壁受傷的3種圍食膜蛋白;44種蛋白與物質(zhì)和能量的代謝相關(guān);11種蛋白與信號轉(zhuǎn)換、物質(zhì)運輸以及細(xì)胞

6、骨架相關(guān)。
   3、利用一維SDS凝膠電泳和串聯(lián)質(zhì)譜連用的方法研究家蠶培養(yǎng)細(xì)胞BmN蛋白質(zhì)組的組成,鑒定到1478種的蛋白質(zhì),通過GO分類注釋發(fā)現(xiàn),這些蛋白具有不同的等電點和分子量,含有多種不同的生物活性,像催化活性、結(jié)合活性、分子轉(zhuǎn)導(dǎo)活性、動力活性、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)活性、酶調(diào)節(jié)活性以及抗氧化活性。利用相同的方法研究BmNPV感染后BmN培養(yǎng)細(xì)胞蛋白質(zhì)組組成,鑒定的蛋白質(zhì)數(shù)目為303個,通過對比發(fā)現(xiàn),感染后新出現(xiàn)的特異蛋白點數(shù)目有8個

7、,分別是微管蛋白β-1,脂肪酶,絲氨酸蛋白酶2,ICE-5蛋白,網(wǎng)格蛋白,鳥氨酸結(jié)合蛋白,凋亡蛋白激活因子以及另外一個未知的蛋白。在這些蛋白中,網(wǎng)格蛋白、微管蛋白β-1和病毒的侵染途徑有關(guān);脂肪酶、絲氨酸蛋白酶以及鳥氨酸結(jié)合蛋白和抗病毒相關(guān);而ICE-5蛋白、凋亡蛋白激活因子和家蠶BmN細(xì)胞凋亡相關(guān),最后一種蛋白的功能未知。
   4、對上述發(fā)現(xiàn)的抗病毒蛋白進(jìn)行了進(jìn)一步分析,從中國家蠶和野蠶幼蟲中腸細(xì)胞克隆獲得了抗家蠶核型多角體

8、病毒BmNPV的脂肪酶基因Lipase cDNA(GenBank AY945209和AY945212)。對野蠶中的抗病毒蛋白進(jìn)行了重點研究。野蠶基因Lipase cDNA大小906 bp,編碼301個氨基酸,蛋白質(zhì)分子質(zhì)量約為28.9 kD。進(jìn)一步克隆了其基因組全長,結(jié)果表明野蠶基因由2147 bp組成,包含4個外顯子和3個內(nèi)含子。分析了該基因在野蠶體內(nèi)的活動規(guī)律,發(fā)現(xiàn)該基因的表達(dá)具有組織特異性,僅限于野蠶中腸組織表達(dá);該基因在幼蟲齡中

9、表達(dá)水平較高,而在幼蟲眠期和熟蠶內(nèi)幾乎沒有表達(dá)。通過基因的體外表達(dá)獲得重組蛋白Lipase,發(fā)現(xiàn)該蛋白能夠有效抑制BmNPV病毒對家蛋的感染,說明該蛋白具有較強(qiáng)的抗BmNPV的生物學(xué)活性。
   5、從野蠶中腸內(nèi)克隆了抗家蠶BmNPV病毒的SP-2 cDNA(GenBank登錄號:AY945210),基因大小855bp,編碼284個氨基酸的蛋白質(zhì),分子量29.6kDa,基因組全長1376bp,包含5個外顯子和4個內(nèi)含子。該基因的

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