蕪菁花葉病毒的種群遺傳學(xué)與水稻黑條矮縮病毒山東分離物的分子特性.pdf

1、蕪菁花葉病毒(Turnip mosaic virus，TuMV)為世界性分布的病毒，在28個(gè)國(guó)家和地區(qū)中TuMV的危害性僅次于黃瓜花葉病毒(Cucumbermosaic virus，CMV)，是侵染蔬菜作物的第二大病毒。水稻黑條矮縮病毒(Rice black-streaked dwarf virus，RBSDV)引起玉米粗縮病，給我國(guó)玉米生產(chǎn)造成了嚴(yán)重?fù)p失。 本研究測(cè)定了2007～2008年兩年間山東省十字花科蔬菜上58個(gè)TuM

2、V分離物3'-端基因組(包括部分NIb、完整CP和部分3'-UTR)序列，擴(kuò)增產(chǎn)物長(zhǎng)度為1082 bp，其中包含28 bp NIb序列、867 bp CP序列及187 bp非編碼區(qū)序列(3'-UTR)。CP基因編碼288個(gè)氨基酸。 將這58個(gè)TuMV分離物CP基因與GenBank上下載的122個(gè)TuMV中國(guó)分離物的CP基因進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析，發(fā)現(xiàn)中國(guó)TuMV分離物可以分為3個(gè)組，分別為basal-BR組、Asian-BR組和wor

3、ld-B組。basal-BR組分離物只在山東省、河北省、浙江省和河南省發(fā)現(xiàn)。 basal-BR組可進(jìn)一步分為3個(gè)亞組，basal-BR II亞組是泰安和濰坊蘿卜上TuMV分離物的主流株系。basal-BR Ⅲ亞組分離物只在山東泰安發(fā)現(xiàn)，并且呈爆發(fā)趨勢(shì)。中國(guó)的和日本的basal-BR I亞組和basal-BR II亞組分離物分別屬于同一個(gè)種群，而中國(guó)和日本的basal-BR Ⅲ亞組分離物分別屬于兩個(gè)不同的種群。 對(duì)2005

4、年～2008年間泰安和濰坊地區(qū)蘿卜上TuMV分離物進(jìn)行核苷酸多樣性分析發(fā)現(xiàn)，2007年泰安地區(qū)蘿卜上TuMV分離物CP編碼區(qū)所承受的選擇壓力最小，2006年濰坊地區(qū)蘿卜上TuMV分離物CP編碼區(qū)所承受的選擇壓力最大。對(duì)臺(tái)灣、四川、山東、云南、浙江和北京這6個(gè)省市的TuMV分離物進(jìn)行核苷酸多樣性分析發(fā)現(xiàn)，四川省的TuMV分離物CP基因所處的選擇壓力是這6個(gè)省市中最大的，而浙江分離物CP基因所處的選擇壓力最小。 利用RT-PCR技術(shù)

5、，從山東省臨沂和泰安兩地表現(xiàn)矮化、粗縮病癥狀的玉米上擴(kuò)增到水稻黑條矮縮病毒(Rice black-streaked dwarf virus，RBSDV)4個(gè)分離物S10片段，克隆了該基因并測(cè)定了其核苷酸序列。擴(kuò)增片段長(zhǎng)1801 bp，其中5'-UTR為21 bp，3'-UTR長(zhǎng)度為103 bp，中間為1677 bp的開(kāi)放閱讀框(22-1698)，編碼558個(gè)氨基酸的衣殼蛋白。在根據(jù)S10片段序列構(gòu)建的系統(tǒng)樹(shù)中，這4個(gè)分離物和GenBa