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文檔簡介
1、昆蟲表皮在昆蟲的生長發(fā)育過程中起著非常重要的重用,而表皮結(jié)構(gòu)及功能的完整性在很大程度上依賴于幾丁質(zhì)對表皮結(jié)構(gòu)的維系。昆蟲中負責(zé)幾丁質(zhì)合成酶(CHS)基因陸續(xù)得到了解析,然而在家蠶中尚沒有相關(guān)報道。
通過對昆蟲CS表達譜、基因的體外干涉、突變體表型的研究表明昆蟲表皮具有一個轉(zhuǎn)移的幾丁質(zhì)合成酶,負責(zé)其幾丁質(zhì)的合成。幾丁質(zhì)合成發(fā)生障礙將直接影響表皮結(jié)構(gòu),表皮中蛋白質(zhì)的分布和功能也將發(fā)生異常。因而,幾丁質(zhì)合成代謝受阻會影響到昆蟲在
2、各個變態(tài)時期的生長。
家蠶是重要的經(jīng)濟昆蟲,同時也是鱗翅目模式昆蟲。由于幾丁質(zhì)不存在于哺乳動物體內(nèi),因此,幾丁質(zhì)合成酶也就成為生物防治的一個重要靶標。對于家蠶幾丁質(zhì)合成酶的研究有助于了解家蠶幾丁質(zhì)合成酶的作用機理,為其在害蟲防治方面的利用奠定基礎(chǔ)。本文利用家蠶基因組數(shù)據(jù),全基因組芯片數(shù)據(jù)分析了家蠶BmCHS1的基因序列及結(jié)構(gòu);利用分子克隆技術(shù)獲得了該基因的全長cDNA片段,分析了其時期及組織表達譜,另外還分析了它的進化分析
3、。主要結(jié)果如下:
1.家蠶BmCHS1基因的全長cDNA克隆
通過生物信息分析,我們在家蠶基因組數(shù)據(jù)庫中篩選得到一個幾丁質(zhì)合成酶基因的部分基因組片段,以此為基礎(chǔ),結(jié)合EST數(shù)據(jù),采用分子克隆的方法,得到該基因的全長cDNA序列,命名為BmCHS1。BmCHS1全長5293bp,其中ORF框為4188bp,5'UTR為726bp,3'UTR為379bp。
2.家蠶BmCHS1基因的結(jié)構(gòu)
4、 經(jīng)過分析發(fā)現(xiàn),家蠶BmCHS1位于4號染色體上,具有21個外顯子,20個內(nèi)含子。且通過在線軟件分析發(fā)現(xiàn)BmCHS1編碼的蛋白質(zhì)具有13個跨膜螺旋,為一個理論等電點6.32,分子量159.5kDa的多次跨膜的蛋白質(zhì)。使用SignalP3.0 Server分析發(fā)現(xiàn)前17個氨基酸可能為信號肽。對基因5'段序列分析發(fā)現(xiàn),上游存在著包括hunchback,Br-C等7個轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控位點。
3.家蠶BmCHS1基因的序列進化分析
5、
通過將各種昆蟲CHS1蛋白進行多序列比對分析發(fā)現(xiàn),CHS1和其他存在于昆蟲表皮中的幾丁質(zhì)合成酶表現(xiàn)出更高的同源性,且家蠶BmCHS1和同屬于鱗翅目的甜菜夜蛾的CHS1之間的同源性明顯高于和其他昆蟲。分析還發(fā)現(xiàn)各種昆蟲的幾丁質(zhì)合成酶與真菌的幾丁質(zhì)合成酶之間的進化距離較遠。
4.家蠶BmCHS1基因的時空表達特征
通過RT-PCR分析家蠶BmCHS1基因在5齡3天各個組織中的表達發(fā)現(xiàn),BmCHS1
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