家蠶軟化病病毒印度株序列分析和家蠶濃核病毒的PCR檢測技術(shù).pdf

1、家蠶傳染性軟化病病毒(Bombyx mori infectious flacherie virus，BmIFV)和家蠶濃核病病毒(Bombyx mori densovirus，BmDNV)是養(yǎng)蠶生產(chǎn)中的2種非包涵體病毒，其單獨或混合感染曾引起生產(chǎn)上的大規(guī)模流行和嚴重的養(yǎng)蠶經(jīng)濟損失。因此，解明2種病毒的基因組和建立相應的檢測技術(shù)是研究其流行規(guī)律的基礎(chǔ)之一。
　　 本研究利用5’和3'cDNA末端快速擴增和常規(guī)RT-PCR技術(shù)成功獲

2、得了全長9665bp的BmIFV印度株全基因組(Gene bank：HM569717)，編碼3085個氨基酸的多聚蛋白。全基因組序列分析表明：該病毒株與BmIFV中國株、日本株的核苷酸和氨基酸的同源性為99％，其中3’非編碼區(qū)同源性是98％，結(jié)構(gòu)蛋白VP1、VP3、VP4與前導蛋白(L蛋白)的同源性為100％。依據(jù)RNA依賴性RNA聚合酶保守序列構(gòu)建進化樹顯示：三株病毒有極高的親緣關(guān)系。對傳染性軟腐病病毒屬不同地域的同種病毒的基因序列比

3、較發(fā)現(xiàn)：Iflavirus屬不同地域的同種病毒的變異率低，可能與昆蟲未健全免疫系統(tǒng)有關(guān)。BmIFV印度株全基因組的獲得和少變異的特點，為開展小RNA病毒的功能基因組學研究，以及建立良好通用性的BmIFV檢測技術(shù)提供了重要的參考依據(jù)。
　　 此外，根據(jù)目前尚無具有較好實用性的BmDNV快速檢測技術(shù)的現(xiàn)狀，根據(jù)家蠶濃核病病毒基因組特點利用VD1和VD2共有的末端反向重復序列(Inverted Terminal Repeats，ITR