HDAC1基因多態(tài)位點(diǎn)與肉牛部分經(jīng)濟(jì)性狀的相關(guān)性分析.pdf

1、組蛋白去乙?；?HDAC)與基因的轉(zhuǎn)錄活性有著密切關(guān)系,轉(zhuǎn)錄活躍區(qū)的核小體組蛋白呈高度乙?；?而不活躍的染色質(zhì)呈去乙酰化狀態(tài)。組蛋白去乙?；诨蜣D(zhuǎn)錄、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、個(gè)體發(fā)育、細(xì)胞增殖和分化中至關(guān)重要。
　　本實(shí)驗(yàn)以15頭南陽(yáng)黃牛和37頭西門(mén)塔爾牛為研究材料,以HDAC1基因?yàn)槟详?yáng)牛和西門(mén)塔爾牛經(jīng)濟(jì)性狀的候選基因,采用 PCR-SSCP和DNA PCR產(chǎn)物直接測(cè)序等技術(shù),檢測(cè)了HDAC1基因3'-UTR、Intron4-Intron

2、5、Intron10-Intron11基因序列的單核苷酸多態(tài)性(SNP),并分析該基因多態(tài)性與南陽(yáng)黃牛和西門(mén)塔爾牛經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)性,以期為西門(mén)塔爾牛和南陽(yáng)黃牛新品系的培育及品種改良等提供理論參考,加速良種肉牛的繁育。本研究的主要實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:
　　1. PCR擴(kuò)增得到南陽(yáng)黃牛和西門(mén)塔爾牛 HDAC1基因的Intron4-Intron5250bp,Intron10-Intron11276bp和3‘UTR非翻譯區(qū)368bp的DNA片段

3、。
　　2.應(yīng)用PCR-SSCP技術(shù)和PCR產(chǎn)物直接測(cè)序法,發(fā)現(xiàn)南陽(yáng)牛和西門(mén)塔爾牛的HDAC1基因Intron4-Intron5片段中均沒(méi)有核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)。
　　3.在南陽(yáng)黃牛和西門(mén)塔爾牛群體中,HDAC1 Intron10-Intron11的102bp處均存在A/G突變位點(diǎn),為同義突變。南陽(yáng)黃牛純合子GG基因型頻率最大,純合子AA基因型最小;而在西門(mén)塔爾牛中,AG雜合子頻率分別大于兩種純合子頻率。在兩種牛群中,G等位基因

4、均占多數(shù)。將該核苷多態(tài)性位點(diǎn)與經(jīng)濟(jì)性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn):AG基因型的南陽(yáng)黃牛,腰角寬顯著長(zhǎng)于AA基因型個(gè)體(P<0.05),且該位點(diǎn)的顯性效應(yīng)也達(dá)到顯著水平;西門(mén)塔爾牛中,AA基因型個(gè)體的背膘厚度性狀低于GG和AG型個(gè)體,差異顯著(P<0.05),該突變位點(diǎn)對(duì)背膘厚度指標(biāo)的基因加性效應(yīng)達(dá)到了顯著水平(P<0.05)。
　　4.南陽(yáng)黃牛HDAC1的3‘非翻譯區(qū)存在兩個(gè)突變,第50bp處A/C多態(tài)性位點(diǎn),存在的兩種基因型中AA型基因型

5、頻率大于AC型;第199bp處的T/C多態(tài)性位點(diǎn),群體中也只存在兩種基因型,且TT基因型頻率大于TC型;在這兩個(gè)SNP中,A核苷等位基因均占到80％左右。而在西門(mén)塔爾牛群體中,HDAC1基因3‘非翻譯區(qū)沒(méi)有發(fā)現(xiàn)多態(tài)性位點(diǎn)。
　　5.分析南陽(yáng)黃牛3‘端非翻譯區(qū)A/C多態(tài)性位點(diǎn)與生長(zhǎng)性狀關(guān)聯(lián)性發(fā)現(xiàn):AC基因型個(gè)體在體長(zhǎng)性狀、體高和十字部高均都顯著高于AA基因型個(gè)體(P<0.05),而T/C位點(diǎn)對(duì)南陽(yáng)黃牛的生長(zhǎng)性狀無(wú)顯著性影響。