家兔PPARγ和MYF5基因多態(tài)性及其與部分經(jīng)濟(jì)性狀的關(guān)聯(lián)研究.pdf

1、過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體γ(peroxisome proliferator-activativedreceptors，PPARγ)在脂肪細(xì)胞分化、脂肪代謝、胰島素敏感性、糖代謝和能量平衡等過(guò)程中起重要的調(diào)節(jié)作用;而生肌因子5(myogenic factor5，MYF5)調(diào)節(jié)肌肉定型、增殖、分化及生后肌肉生長(zhǎng)。本試驗(yàn)采用直接測(cè)序方法檢測(cè)PPARγ和MYF52個(gè)基因編碼區(qū)的變異位點(diǎn)，并用飛行質(zhì)譜分型技術(shù)對(duì)235只家兔（伊拉兔93只，香檳兔

2、81只，天府黑兔61只）候選SNPs進(jìn)行基因分型，篩選出對(duì)經(jīng)濟(jì)性狀具有遺傳效應(yīng)的SNPs，然后用271只新西蘭兔擴(kuò)大樣本驗(yàn)證關(guān)聯(lián)性，最后通過(guò)定量進(jìn)一步研究PPARγ基因的作用機(jī)制，以期篩選出可用于家兔分子育種的遺傳標(biāo)記。試驗(yàn)結(jié)果如下:
　　1.通過(guò)直接測(cè)序在家兔PPARγ基因編碼區(qū)檢測(cè)到1個(gè)同義突變(c.207A＞C);在MYF5基因編碼區(qū)檢測(cè)到2個(gè)同義突變(c.708C＞T、c.66G＞A)和1個(gè)非同義突變(c.571T＞C)，

3、c.571T＞C導(dǎo)致氨基酸由絲氨酸變?yōu)楦彼?而c.708C＞T位點(diǎn)的|△RSCU|大于c.66G＞A位點(diǎn)。所以最終將PPARγ基因c.207A＞C，MYF5基因c.571T＞C、c.708C＞T做為候選SNPs做進(jìn)一步的分析研究。
　　2.PPARγ基因c.207A＞C位點(diǎn)在伊拉兔、香檳兔、天府黑兔中均檢測(cè)到三種基因型(AA、AC、CC)。遺傳結(jié)構(gòu)分析研究表明，伊拉兔中3種基因型頻率分別為:0.3804、0.4565、0.163

4、1;香檳兔中3種基因型頻率分別為:0.2375、0.5500、0.2125;天府黑兔中3種基因型頻率分別為:0.4590、0.5246、0.0164。A等位基因?yàn)閮?yōu)勢(shì)等位基因，頻率分別為0.6086、0.5125、0.7213。驗(yàn)證試驗(yàn)兔-新西蘭兔中，AA基因型頻率最高，為0.5092; AC、CC基因型頻率分別為0.4317、0.0590;A等位基因頻率為0.7250。x2檢驗(yàn)表明PPARγ c.207A＞C位點(diǎn)在四個(gè)品種中均符合Ha

5、rdy-Weinberg平衡(P＞0.05)。
　　3.MYF5基因c.571T＞C位點(diǎn)在伊拉兔、香檳兔、天府黑兔中均檢測(cè)到3種基因型(TT、TC、CC)。伊拉兔中3種基因型頻率分別為:0.3371、0.3371、0.3248;香檳兔中3種基因型頻率分別為:0.1235、0.3580、0.5185;天府黑兔中3種基因型頻率分別為:0.5833、0.3000、0.1167。T等位基因在三個(gè)品種中的頻率分別為:0.5056、0.302

6、5、0.6975。驗(yàn)證試驗(yàn)兔-新西蘭兔中，TT基因型頻率最高，為0.5234; TC、CC基因型頻率分別為0.2031、0.2735;T等位基因頻率為0.6250。x2檢驗(yàn)表明c.571T＞C位點(diǎn)在香檳和天府黑兔中符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05)，而在伊拉兔和新西蘭兔中嚴(yán)重偏離Hardy-Weinberg平衡（P＜0.01）。
　　4.MYF5基因c.708C＞T位點(diǎn)在伊拉兔、香檳兔、天府黑兔中均檢測(cè)到3種基因

7、型(CC、CT、TT)。伊拉兔中3種基因型頻率分別為:0.3978、0.4946、0.1076;檳兔中3種基因型頻率分別為:0.1605、0.6420、0.1975;天府黑兔中3種基因型頻率分別為:0.6721、0.3115、0.0163;C等位基因在三個(gè)品種中的頻率分別為:0.6451、0.4814、0.8278。驗(yàn)證試驗(yàn)兔-新西蘭兔中，CC基因型頻率最高，為0.5352; CT、TT基因型頻率分別為0.2422、0.2226;C等位

8、基因頻率為0.6563。x2檢驗(yàn)表明c.708C＞T位點(diǎn)在新西蘭兔(P＜0.01)和香檳兔(P＜0.05)中偏離Hardy-Weinberg平衡。
　　5.在香檳兔和伊拉兔中，PPARγ c.207A＞C位點(diǎn)AC基因型個(gè)體84日齡體重顯著高于AA基因型個(gè)體(P＜0.05)，AA、AC基因型的背最長(zhǎng)肌肌內(nèi)脂肪含量顯著高于CC基因型個(gè)體(P＜0.01)，且AA基因型個(gè)體背最長(zhǎng)肌肌內(nèi)脂肪含量顯著高于AC基因型個(gè)體(P＜0.05)。在新西

9、蘭兔中，CC基因型個(gè)體70日齡體重和84日齡體重顯著高于AA基因型個(gè)體(P＜0.05);且CC基因型個(gè)體35日齡到84日齡平均日增重顯著高于AA(P＜0.05)、AC(P＜0.01)基因型個(gè)體。
　　6.MYF5 c.571T＞C位點(diǎn)與伊拉兔、香檳兔84日齡體重顯著相關(guān)。TC基因型個(gè)體84日齡體重顯著高于TT基因型個(gè)體(P＜0.05);同樣地，新西蘭兔TC基因型個(gè)體84日齡體重顯著高于TT基因型個(gè)體(P＜0.05)，而且TC基因型

10、個(gè)體35日齡到84日齡的平均日增重顯著高于TT基因型個(gè)體(P＜0.05)。但是c.571T＞C位點(diǎn)與伊拉兔兔、香檳兔28日齡體重、70日齡體重、全凈膛重、全凈膛屠宰率、半凈膛重、半凈膛屠宰率、熟肉率、背最長(zhǎng)肌肌內(nèi)脂肪含量和右后腿肌肌內(nèi)脂肪含量沒(méi)有顯著關(guān)聯(lián)(P＞0.05)。
　　7.MYF5 c.708C＞T位點(diǎn)與伊拉兔、香檳兔84日齡體重、全凈膛重、半凈膛重顯著相關(guān)。CT基因型個(gè)體84日齡體重顯著高于CC基因型個(gè)體(P＜0.05)

11、，而且CT基因型個(gè)體的全凈膛重(1309.4243±13.3502)和半凈膛重(1413.9414±14.3049)的最小二乘均值顯著高于CC基因型個(gè)體(1250.4335±18.9968和1352.6705±20.3554)(P＜0.05)。同樣，新西蘭兔c.708C＞T位點(diǎn)CT基因型個(gè)體84日齡體重顯著高于CC基因型個(gè)體(P＜0.05)。
　　8.新西蘭兔PPARγ基因mRNA表達(dá)量在35日齡到56日齡階段呈現(xiàn)上升趨勢(shì)，而56

12、日齡到70日齡其表達(dá)量降低。且56日齡PPARγ mRNA表達(dá)量顯著高于35日齡和70日齡表達(dá)量(P＜0.01)，此外35日齡表達(dá)量顯著高于70日齡表達(dá)量(P＜0.01)。不同基因型之間的PPARγ mRNA的表達(dá)量無(wú)顯著差異(P＞0.05)。
　　試驗(yàn)結(jié)果表明MYF5基因可作為影響家兔生產(chǎn)的候選基因，而且MYF5c.571T＞C和c.708C＞T位點(diǎn)可作為家兔84日齡階段體重選擇的分子標(biāo)記，選擇兩個(gè)位點(diǎn)TC和CT基因型個(gè)體能獲得