肉牛脂代謝相關(guān)基因遺傳多態(tài)性及其與延邊牛肉質(zhì)性狀相關(guān)分析.pdf

1、本研究以魯西牛、南陽牛、延黃牛以及延邊牛4個(gè)品種肉牛群體共計(jì)356個(gè)體為材料，采用序列分析技術(shù)結(jié)合生物信息學(xué)方法，研究了影響牛脂肪代謝的MC4R、LEPR、HSL、LPL、SCD等5個(gè)候選基因部分基因座位的SNP位點(diǎn)，探討了試驗(yàn)牛群的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性;并對(duì)157頭延邊牛在上述位點(diǎn)的肉質(zhì)性狀指標(biāo)進(jìn)行了相關(guān)性分析，以期篩選出顯著影響肉牛肉質(zhì)性狀的功能基因或分子標(biāo)記，為肉牛種質(zhì)資源保存與利用和延邊牛高效選育提供遺傳學(xué)依據(jù)。試驗(yàn)得到以下主要

2、結(jié)果:
　　1、在HSL基因發(fā)現(xiàn)7處突變，四個(gè)試驗(yàn)牛群體在1208bp、1537bp、1574bp、1729bp、1740bp、1869bp、與1921bp處的突變均處于中度多態(tài)和低度多態(tài)。其中，1729bpA→G的突變導(dǎo)致編碼蛋白的氨基酸由谷氨酰胺突變?yōu)榫彼幔?740bpT→C的突變導(dǎo)致絲氨酸突變?yōu)楦彼幔?869bpA→G的突變導(dǎo)致纈氨酸突變?yōu)楫惲涟彼幔?921bpA→G的突變導(dǎo)致谷氨酸突變?yōu)橘嚢彼帷?br>　　與延邊牛肉質(zhì)

3、性狀相關(guān)分析表明:1208bp A→C位點(diǎn)與眼肌面積、系水力、亮度、肉豆寇酸、油酸、亞油酸、亞麻酸、絲氨酸、甘氨酸、丙氨酸、異亮氨酸、亮氨酸、賴氨酸呈顯著相關(guān)顯著相關(guān);1537bpA→C位點(diǎn)與蒸煮損失、滴水損失、黃色度顯著相關(guān);1729bp A→G位點(diǎn)與宰前活重、胴體重、背膘厚、肉豆寇酸、棕櫚酸、亞油酸、絲氨酸、精氨酸、賴氨酸顯著相關(guān);1921bp A→G位點(diǎn)與宰前活重、胴體重、肉豆寇酸、亞油酸、亞麻酸、絲氨酸、甘氨酸、丙氨酸、異亮氨酸

4、、亮氨酸、脯氨酸、賴氨酸顯著相關(guān)。
　　2、在LPL基因329bp的A→T突變?cè)谘舆吪Ｈ后w中處于中度多態(tài)，其余牛群體均處于低度多態(tài);該突變引起蘇氨酸突變?yōu)榻z氨酸，與延邊牛眼肌面積、蒸煮損失、滴水損失、PH、肉豆蔻酸、亞油酸、絲氨酸、甘氨酸、丙氨酸、賴氨酸顯著相關(guān);
　　3、在LEPR基因2831bp的C→T突變?cè)谒膫€(gè)牛群體中均處于中度多態(tài)，使蘇氨酸突變?yōu)榈鞍彼?，引起了疏水性結(jié)構(gòu)改變，導(dǎo)致蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)在第940處左右出現(xiàn)一個(gè)

5、α螺旋丟失、β折疊增加，改變了三級(jí)結(jié)構(gòu)中α螺旋、β轉(zhuǎn)角的空間位置，經(jīng)相關(guān)分析表明該位點(diǎn)與延邊牛背膘厚、眼肌面積、蒸煮損失顯著相關(guān)。
　　4、在MC4R基因1069bp發(fā)現(xiàn)C→G的突變?cè)谒膫€(gè)牛群體中屬于中度多態(tài)，引起亮氨酸突變?yōu)槔i氨酸，疏水性結(jié)構(gòu)改變，導(dǎo)致蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)在166、243、281處出現(xiàn)α螺旋丟失、β折疊丟失，三級(jí)結(jié)構(gòu)中β轉(zhuǎn)角的空間位置發(fā)生改變。相關(guān)分析表明該位點(diǎn)與延邊牛背膘厚、亮度、黃色度、肉豆蔻酸、亞油酸及亞麻酸顯著

6、相關(guān)。
　　5、在SCD基因發(fā)現(xiàn)3處突變?cè)谒膫€(gè)牛群體中均處于中度多態(tài)。其中，1022bp處的突變使編碼蛋白的氨基酸由丙氨酸突變?yōu)槔i氨酸，導(dǎo)致了疏水性結(jié)構(gòu)改變，表現(xiàn)為纈氨酸編碼蛋白的疏水性高于丙氨酸編碼蛋白的疏水性;引起蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)在第291處出現(xiàn)α螺旋的丟失、無規(guī)則卷曲丟失，289處出現(xiàn)β折疊丟失，但蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)沒有變化。相關(guān)分析表明846bp A→G的突變與延邊牛宰前活重、胴體重、背膘厚、硬脂酸、亞油酸、天冬氨酸、谷氨酸、甘