兔波氏桿菌和巴氏桿菌LAMP快速診斷技術研究.pdf

1、兔波氏桿菌（Bordetella bronchiseptica，Bb）和巴氏桿菌(Pasteurella multocida，Pm)是引起兔呼吸道傳染病的主要致病菌，臨床上這兩種菌有時呈現(xiàn)混合感染，由于它們在菌落形態(tài)、臨床癥狀以及病理變化等方面都存在許多相似的地方，僅靠表面癥狀容易造成誤診，所以建立一種操作簡便、快速靈敏和特異性強的檢測方法顯得十分必要。環(huán)介導等溫擴增(Loop-mediated isothermal amplifica

2、tion，LAMP)技術是Notomi等在2000年開發(fā)的一種新穎的核酸擴增技術，通過一種鏈置換DNA聚合酶(Bst DNA polymerase)的作用，在恒溫條件下高效、快速、特異地擴增靶基因，不需要PCR的熱循環(huán)步驟和繁瑣的電泳檢測過程，為病原在臨床上的快速診斷提供了全新的思路。
　　本研究針對Bb16S rRNA基因和Pm Kmt1基因，使用在線設計軟件(https://primerexplorer.jp/lamp3.0.

3、0/index.html)設計LAMP引物，然后分別對反應溫度和時間、dNTPs濃度、Mg2+濃度、Betaine濃度、Bst DNA Polymerase濃度以及引物濃度進行了優(yōu)化，建立了LAMP反應體系。
　　本研究利用LAMP技術對8株兔源性細菌分別進行Bb和Pm的特異性試驗，結(jié)果顯示僅有目標菌株為陽性，其余7株細菌均為陰性，表明LAMP檢測技術具有良好的特異性。
　　本研究采用Qiagen試劑盒法制備模板進行LAMP

4、反應，該方法檢測Bb和Pm的檢出限分別為1.65CFU/mL和1.29CFU/mL，而對照PCR檢測Bb和Pm的檢出限分別為165CFU/mL和129CFU/mL，表明LAMP技術的靈敏度為普通PCR的100倍。
　　本研究用已優(yōu)化的LAMP檢測方法分別對15份Bb陽性樣品和10份Pm陽性樣品進行穩(wěn)定性與重復性試驗，檢測結(jié)果均為陽性，表明該方法具有良好的穩(wěn)定性與重復性。
　　本研究比較了3種基因組DNA提取方法對LAMP檢測

5、結(jié)果的影響，研究結(jié)果表明LAMP方法對制備模板DNA的要求不高，采用煮沸法提取基因組DNA，不僅節(jié)約提取時間，而且也大大降低檢測成本。
　　本研究分別檢測了54份Bb樣品和44份Pm樣品，同時與實驗室已建立的PCR方法做了比較，結(jié)果表明:Bb-LAMP方法的陽性檢出率為77.78％，特異性為85.71％，敏感性為100％，符合率為96.3％;Pm-LAMP方法的陽性檢出率為47.73％，特異性為88.46％，敏感性為100％，符合