30849.蛋白質若干結構預測問題研究及其軟件實現(xiàn)

1、浙江大學生命科學學院博士學位論文蛋白質若干結構預測問題研究及其軟件實現(xiàn)姓名：顧斐申請學位級別：博士專業(yè)：生物信息學指導教師：吳平陳杭20090112浙江大學博士學位論文段，通過對二級結構片段特征信息的訓練得出三種二級結構類型的代表性特征向量，并將其作為預測的依據(jù)。二級結構片段定位中用到的方法為小波變換法，片段類型的訓練和預測過程中用到的算法為直接平均法。本論文提出的蛋白質二級結構預測方式較為新穎，并且具有生物學意義。在蛋白質二級結構預測

2、中用到的是CB396數(shù)據(jù)集，這個數(shù)據(jù)庫具有低序列相似度和低序列冗余度的特性，并且已經(jīng)有多種方法對該數(shù)據(jù)庫做了測試，方便了本論文結果與其它方法結果的比較。從結果看，本論文的二級結構預測正確率(Q，)達到7021％，SOV的正確率為6714S。這一結果與現(xiàn)有的方法相比相差無幾。最后，利用蛋白質結構類的信息，得到了蛋白質結構類傾向性因子這一特征信患，該特征信息比傳統(tǒng)的傾向性因子更能反映氨基酸對二級結構的偏好性。(4)蛋白質結構預測軟件編寫根據(jù)