蛋白質結構折疊分析與速率預測.pdf

1、蛋白質是生物體內存在最多的物質，在生命體的各項活動中擔當著重要的角色。蛋白質的折疊問題是生物物理學的重要課題之一，主要研究蛋白質的序列、結構與功能三者之間的關系。蛋白質折疊研究的兩個方向為:結構與序列之間的關系，以及序列、結構和折疊速率的關系。
　　1、熒光光譜法在研究蛋白質的折疊構象變化及對蛋白質進行定量分析方面都起到重要的作用。本章探討了熒光光譜的概念、發(fā)光機理及特點，分析了熒光光譜法研究蛋白質折疊的機理，對熒光光譜技術在檢測

2、蛋白質的構象變化、測定蛋白質含量以及性質方面的應用進行了綜述。
　　2、基于蛋白質的2D HP模型，運用蒙特卡洛算法，在計算機上模擬了蛋白質折疊的過程。用不同的氨基酸親疏水的劃分法，分析了五種不同疏水性特征的劃分對蛋白質折疊的最小能量構象及其能量值的影響情況。2D HP模型的實驗結果表明，不同的氨基酸疏水特征劃分法對同一段蛋白質序列的折疊構象及最小能量影響較大;同一段序列在同一種親疏水劃分法中，從序列的正向及其反向分別開始模擬蛋白

3、質折疊構象，蛋白質折疊結構的能量與蛋白質折疊的起始位置無關，與其構象之間存在一定的關系。
　　3、從蛋白質的一級結構出發(fā)，預測氨基酸的親疏水性對蛋白質折疊速率的影響。本章從20種氨基酸中的每種氨基酸親疏水值出發(fā)，分析了氨基酸的親疏水性對蛋白質折疊速率的影響。得出結論，20種氨基酸中的每種氨基酸親疏水特征值之和是影響蛋白質折疊速率重要因素之一。
　　4、從蛋白質的三維結構出發(fā)，分別提取氨基酸主鏈上的碳α原子(Ca)、氮原子(N