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1、福建農(nóng)林大學(xué)碩士學(xué)位論文恥垢分枝桿菌ercc3基因相互作用蛋白的串聯(lián)親和純化姓名:鄭嘉熙申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):生物化學(xué)與分子生物學(xué)指導(dǎo)教師:汪世華20100401福建農(nóng)林大學(xué)碩士學(xué)位論文TandemAffinityPurificationofProteinInteractedwithMycobacteriumsmegmatisercc3ABSTRACT:EukaryoticXPB/Ercc3isasubunitofproteincom
2、plexTFIIHwhichparticipateintranscriptioninitiate,promotorclearanceandnucleotideexcisionrepair(NER)ofDNAdamageXPBusesitsATP—dependenthelicaseactivityandssDNAdependentATPaseactivitytoplayaroleintheopeningofDNAdoublestrandi
3、ntranscriptionandremoveofdamagecontainedDNAfragmentinNERXPBalsoparticipatecellcycleregulationandotherregulationpathwayasamolecularsensorandresponsortoalotofcellpathwaysInprokaryoticlifeMycobacteriumwefoundthehomologueofe
4、ukaryoticercc3,butnoothertranscriptionandNERrelativegenewhichinteractandCOworkwitheukaryoticercc3MycobacteriumhasitsprokaryotetranscriptionandNERsystemofitselfSothefunctionofercc3geneinMycobactefiumisstilltoaquestionalis
5、sueByaMycobacterimrecombineersystembaseonphagegene,weinsertedTAPtag(proteinATEVproteasesitecalmodulinbindingprotein)intoCteminalofercc3geneinMsmegmatisgenomeAsaresulttherecombinantMsmegmatisexpressercc3tapgeneasthewildty
6、peercc3gene,sincetheyalebothsimplecopyandtranscriptedbythesamepromotorUsedthemethodofTAP(randomaffinitypurification),wepurifiedtheErcc3TAPanditsinteractionproteinfromcellextractionAfterSDS—PAGEandsilverstain,thepurificat
7、ionofinteractionproteinwasidentifiedbyLCMSTheLCMSresultrevealedalistofpossibleinteractionproteinwithErcc3,includeDNAdirectedRNApolymerasep’andpsubunit(pDCandrpoB),andrecombinantproteinrecAByinvitrotestsuchasfarwesternand
8、pulldown,wefoundErcc3interactiondirectlywithRPOCinvitroAndotherexperiencefoundErce3alsointeractwithhypotheticalproteinATPaseandMSMEG_5705Butwedidn’tfinddistinctphenotypeonercc3delectedstrainFromthedataabove,wecandeduceth
9、atercc3(withitsinteractionpartner)mayparticipateintranscriptioninitiation,particularlytranscriptioninsomespecialenvironmentKeywords:MycobacteriumsmegmatisXPB/erce3tandemaffinitypurifictiontranscriptioninitiationproteinin
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