基于rbcL、matK基因序列探討松科系統(tǒng)進化的可能性及rbcL、matK基因SSCP分析.pdf

1、太白紅杉(Larix chinensis Beissn)屬秦嶺特有植物,是森林上限樹種,被列為國家二級保護植物.根據(jù)文獻記載以及我們的野外調(diào)查:太白紅杉的個體數(shù)目少,局限分布于秦嶺的少數(shù)地區(qū).一般認為,太白紅杉是第四紀冰川的孑遺植物,歷經(jīng)冰川的覆蓋后,地面上首先恢復的木本植物是松科植物,因此我們有必要探討落葉松屬的系統(tǒng)演化及太白紅杉在松科的系統(tǒng)位置.rbcL基因和matK基因均為葉綠體基因.rbcL基因編碼核酮糖-1,5-二磷酸羧化/加

2、氧酶(Rubisco,Rbc)的大亞基,matK基因位于trnK基因的內(nèi)含子中,編碼的成熟酶參與RNA轉(zhuǎn)錄體中Ⅱ型內(nèi)含子的剪切.目前這兩個基因已廣泛用于植物系統(tǒng)發(fā)育分析.基于以上考慮,我們首先擴增了太白紅杉、華北落葉松、大果紅杉的rbcL基因和matK基因序列,結(jié)合網(wǎng)上共享的松科其它植物的序列對太白紅杉的系統(tǒng)位置作了探索.其次,探討了不同松科植物材料DNA的提取條件以及rbcL基因和matK基因的PCR-SSCP影響條件.所謂SSCP即

3、單鏈構(gòu)象多型性.雙鏈DNA高溫解鏈后即快速冷卻,使單鏈DNA在低溫下由于堿基的部分互補發(fā)生自身折疊,形成二級結(jié)構(gòu),通常DNA一級結(jié)構(gòu)的一個堿基發(fā)生改變就會導致構(gòu)型的變異,這種變異經(jīng)中性聚丙烯酰胺凝膠電泳通過帶型差異表現(xiàn)出來.PCR-SSCP就是將PCR產(chǎn)物變性后作的中性聚丙烯酰胺凝膠電泳分析.第三,多數(shù)學者認為,在提取植物總DNA時,多糖是影響提取效果的一個很重要因素.但是在我們的試驗中,對太白紅杉的種子和幼苗分別進行了多糖含量的測定,