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1、分類號(hào):幽!旦:墨]密級(jí):UDC:華東理工大學(xué)學(xué)位論文用于擬干酪乳桿菌代謝組學(xué)分析的樣品處理方法研究和應(yīng)用李曉雪指導(dǎo)教師姓名:王永紅教授華東理工大學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室生化工程研究中心申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè)名稱:微生物學(xué)論文定稿日期:20130420論文答辯日期:20130602學(xué)位授予單位:華東理工大學(xué)學(xué)位授予日期:御僻6囂2窶答辯委員會(huì)主席:張嗣良教授評(píng)閱人:儲(chǔ)炬教授張毅教授華東理工大學(xué)碩士學(xué)位論文第1頁(yè)用于擬干酪乳桿菌代謝組學(xué)分析樣品的
2、處理方法研究和應(yīng)用摘要用氣相色譜質(zhì)譜聯(lián)用(GasChromatographyMassSpectrometry,GCMS)技術(shù)建立了用于檢測(cè)擬干酪乳桿菌胞內(nèi)代謝物的代謝組學(xué)研究方法。考察了不同溶解劑(吡啶、四氫呋喃、甲氧胺鹽酸鹽)和衍生化試劑(N甲基叔丁基二甲基硅基三氟乙酰胺、N,O雙(三甲基硅烷基)三氟乙酰三甲基氯硅烷和N甲基N三甲基硅烷基三氟乙酰胺),對(duì)質(zhì)譜峰的信號(hào)強(qiáng)度和個(gè)數(shù)的影響,確定使用毗啶作為溶解劑、N,O雙(甲基硅烷基)氟乙酰
3、三甲基氯硅烷作為衍生劑的兩步衍生法效果最佳。以擬干酪乳桿菌為分析對(duì)象,共鑒定出49種胞內(nèi)中間代謝物。方法學(xué)考察結(jié)果表明,該方法具有良好的精密度、穩(wěn)定性和重現(xiàn)性。此外,還采用主成分分析方法對(duì)所獲得的擬干酪乳桿菌發(fā)酵過(guò)程胞內(nèi)代謝產(chǎn)物變化數(shù)據(jù)進(jìn)行了代謝模式識(shí)別研究。本文建立了一個(gè)用于擬干酪乳桿菌代謝組學(xué)研究的樣品滅活和萃取方法。使用單元和多元數(shù)據(jù)分析方法,分析了不同滅活方法(60%甲醇、60%甲醇/09%碳酸銨(pH60)、60%甲醇/09%
4、氯化鈉、40%乙醇/09%氯化鈉和60%甘油/135%氯化鈉)和萃取方法(100%甲醇,70%甲醇,甲醇/氯仿,乙腈/甲醇/水,連續(xù)萃取)作用效果。研究結(jié)果表明發(fā)現(xiàn)60%甲醇/09%氯化鈉滅活效率最高并且能夠有效降低胞內(nèi)代謝物滲出,是最適合的滅活方法。此外,建立了連續(xù)萃取方法,先使用70%甲醇萃取然后再使用乙腈/甲醇/水萃取,此萃取方法的萃取效率最高且重復(fù)性好。此外,本文將建立的GCMS分析方法和代謝組學(xué)研究的樣品處理方法成功用于分析擬
5、干酪乳桿菌發(fā)酵生產(chǎn)乳酸過(guò)程中的代謝變化。乳酸發(fā)酵過(guò)程隨著發(fā)酵進(jìn)行,菌體進(jìn)入穩(wěn)定期后,溶氧往往出現(xiàn)回升現(xiàn)象,同時(shí)乳酸產(chǎn)率和得率都有~定程度的下降。采集溶氧(DissolvedOxygen,DO)回升前后發(fā)酵樣品進(jìn)行代謝物組分析,并采用主成分分析法(PrincipalComponentAnalysis,PCA)對(duì)所獲得的代謝物組數(shù)據(jù)進(jìn)行模式識(shí)別。分析結(jié)果表明,發(fā)酵過(guò)程中伴隨著DO回升,大多數(shù)胞內(nèi)代謝物濃度隨時(shí)間變化發(fā)生顯著性差異,主要是EM
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