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文檔簡介
1、關于基因型一表型相關問題的統(tǒng)計遺傳學及計算生物學分析陳文海指導老師:谷迅教授復旦大學生命科學學院復旦大學博士學位論文關于基因型表型相關問題的統(tǒng)計遺傳學及計算生物學分析目錄摘要iAbstmctiii前言l第一章文獻綜述31:I引言312Fisher幾何模型及表型進化的選擇模型313基因多效性的度量4131多效性的直接計算及問題4132利用數學模型通過其它觀測來間接計算s14利用數學模型來間接計算基因多效性:Gu方法簡介一6141蛋白質序列
2、進化模型6142選擇強度與模型分類914_3蛋白質序列的進化速率11144估計基因多效性和選擇強度13145基因多效性的初步分析16IA6對Gu方法的幾點評注i715胞吐作用1716參考文獻21第二章關于基因多效性概念和統(tǒng)計估計問題的進一步探討鴣21引言2822(hl模型的簡要介紹2923多層次基因型表型映射模型及最小多效性的概念3324基因型表型映射的線性模型及其秩的定義3424。I單映射情景34242線性變換映射模型:從一步映射推廣
3、到多步映射3s25基因型表型映射下秩的估計36251穩(wěn)態(tài)選擇模型下的自然選擇系數37252MartinLenormand方法37253Gu方法3826有效最小多效性:對于x的一種各選解釋38261MartinLcnormand方法:r=l對應于隨機突變39262Gu方法39263PigancauWalkcr方法3927數據分析和測試。40271Gu方法對蛋白質序列的應用一40272Gu方法對核苷酸序列的應用412S基于Matlab的計算
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