小麥TaDREB1基因的單核苷酸多態(tài)性及其與抗旱性的關(guān)系.pdf

1、　　本文以抗旱性不同的20份六倍體小麥和3份小麥的二倍體野生近緣種為材料，以小麥TaDREB1基因?yàn)檠芯繉?duì)象，用直接測(cè)序法篩查抗旱等抗逆相關(guān)基因TaDREB1的單核苷酸多態(tài)性(SNP)，分析不同抗旱性小麥種質(zhì)中TaDREB1的單堿基突變規(guī)律，揭示小麥抗旱性與TaDREB1單核苷酸多態(tài)性之間的關(guān)系。得到如下研究結(jié)果：　　1、小麥不同基因型之間TaDREB1DNA序列的單核苷酸多態(tài)性豐富。在20個(gè)小麥基因型之間共發(fā)現(xiàn)209個(gè)SNPs和2個(gè)

2、InDels，多態(tài)性頻率分別為1SNP/140bp和1InDel/16540bp。在3個(gè)二倍體小麥基因型中共發(fā)現(xiàn)62個(gè)SNPs和12個(gè)InDels，多態(tài)性頻率分別為1SNP/80bp和lInDel/413bp。也發(fā)現(xiàn)了TaDREB1的一個(gè)內(nèi)含子，位于第302-303堿基之間?！　?、在TaDREB1的DNA序列中發(fā)現(xiàn)兩個(gè)堿基突變的熱點(diǎn)區(qū)。一個(gè)熱點(diǎn)區(qū)是在AF303376的1165-1181堿基之間，有7個(gè)位點(diǎn)發(fā)生突變，共發(fā)現(xiàn)43個(gè)SNP

3、s，占全部SNPs(209個(gè))的20.6﹪，突變頻率為每1SNP/8bp；另一個(gè)熱點(diǎn)區(qū)位于1200-1230堿基之間，有15個(gè)位點(diǎn)發(fā)生突變，共發(fā)現(xiàn)52個(gè)SNPs，占全部SNPs的24.9﹪，突變頻率為每1SNP/12bp，兩個(gè)突變熱點(diǎn)區(qū)均位于編碼區(qū)?！　?、核苷酸多樣性(Л)是個(gè)體間給定位點(diǎn)序列的平均多樣性，表明一個(gè)基因的遺傳變異程度。供試材料TaDREB1的核苷酸多樣性(Л)值為0.01211，說(shuō)明在小麥群體中，任意兩個(gè)同源染色體的

4、TaDREB1基因之間每83個(gè)核苷酸中有一個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)?！　?、單倍型(Haplotype)分析表明：大部分抗旱基因型具有相同的單倍型結(jié)構(gòu)，揭示了TaDREB1基因單核苷酸多態(tài)性與抗旱性表型的相關(guān)性，Haplotype1和Haplotype3是主要抗旱單倍型；但同時(shí)也發(fā)現(xiàn)在個(gè)別單倍型里既有抗旱型材料也有不抗旱型的材料，揭示了抗旱性的復(fù)雜性?！　?、依據(jù)小麥二倍體近緣種TaDREB1基因的單核苷酸多態(tài)性對(duì)三個(gè)基因組進(jìn)行聚類分析，發(fā)現(xiàn)A