金華豬經(jīng)濟(jì)性狀選擇信號(hào)探測(cè).pdf

1、金華豬歷史上經(jīng)歷了上千年的自然及人工選擇，是珍貴的研究肉質(zhì)、抗病力、生產(chǎn)、繁殖性狀的模型豬種。杜洛克，長(zhǎng)白豬，大白豬是歐洲知名的商業(yè)豬種，經(jīng)歷了長(zhǎng)期系統(tǒng)化的人工選擇來(lái)滿足市場(chǎng)需求，而金華豬和其他六個(gè)中國(guó)豬種是中國(guó)東南部浙江省本土長(zhǎng)期馴養(yǎng)的地方豬種，成長(zhǎng)于相對(duì)孤立的環(huán)境，所以保留了一些獨(dú)特的高頻率有利等位基因及經(jīng)濟(jì)性狀。此項(xiàng)研究的目的是利用491頭中外豬種2％的全基因組測(cè)序的108603個(gè)SNP位點(diǎn)，通過(guò)金華豬種分別與國(guó)外豬種和其他六個(gè)中

2、國(guó)地方豬種對(duì)比探測(cè)金華豬和其他豬種間選擇印記的區(qū)別（6個(gè)中國(guó)地方豬種和3個(gè)國(guó)外豬種作為參考對(duì)照組）。我們用多群體單倍型純合性檢測(cè)(XP-EHH)方法揭示了金華豬和其他豬種間顯著差異的選擇信號(hào)。一些候選基因如GH，CRHE，TRAF4，和CCK被發(fā)現(xiàn)與肉質(zhì)，健康，以及繁殖性狀有關(guān)。此外，研究顯示金華豬與肉質(zhì)，免疫應(yīng)答和繁殖性狀有關(guān)的基因組區(qū)域在馴養(yǎng)和連續(xù)的人工育種過(guò)程中發(fā)生了正向選擇。被檢測(cè)出的發(fā)生正向選擇的基因和相應(yīng)的生物路徑表明金華豬