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文檔簡(jiǎn)介
1、中華絨螯蟹(Eriocheir sinensis)俗稱河蟹,是一種重要的淡水養(yǎng)殖種類,在我國(guó)的淡水養(yǎng)殖業(yè)中占有很大的比重。目前,在中國(guó)江蘇省河蟹養(yǎng)殖是一個(gè)快速發(fā)展的行業(yè),每年的產(chǎn)值在40億美元左右。然而,隨著其養(yǎng)殖規(guī)模的不斷擴(kuò)大及集約化程度的提高,一些由細(xì)菌、病毒和寄生蟲引起的疾病嚴(yán)重阻礙了河蟹養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展,并造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。中華絨螯蟹顫抖病就是其中最嚴(yán)重的病害之一,而中華絨螯蟹螺原體(Spiroplasma erioche
2、iris)是引發(fā)該病的一種新型病原微生物。前期的研究證實(shí),該病原主要通過(guò)河蟹的鰓或者體表進(jìn)入到宿主的體內(nèi),并首先侵染其靶細(xì)胞—血細(xì)胞,在血細(xì)胞中大量繁殖并伴隨著血液循環(huán)進(jìn)而侵染河蟹的神經(jīng)、肌肉等組織,最終引起河蟹附肢的顫抖并最終導(dǎo)致宿主死亡。河蟹血細(xì)胞作為該病原重要的靶細(xì)胞,其必定在宿主對(duì)該病原的免疫中發(fā)揮重要的作用,因此,探究螺原體侵染河蟹血細(xì)胞的機(jī)制以及河蟹的免疫防御機(jī)制,對(duì)減少該病原對(duì)河蟹養(yǎng)殖業(yè)的危害具有重要的意義。本碩士學(xué)位論文
3、在目前已有的研究基礎(chǔ)上,首先,通過(guò)相對(duì)定量和絕對(duì)定量同位素標(biāo)記(isobaric tags forrelative and absolute quantization iTRAQ)和液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)技術(shù),篩選中華絨螯蟹螺原體感染10天后河蟹血細(xì)胞中差異表達(dá)的蛋白,并通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)分析該病原可能存在的侵染機(jī)制以及宿主對(duì)該病原免疫防御機(jī)制。其次,通過(guò)分析差異表達(dá)蛋白,挑選兩種蛋白(Rab7和14-3-3)通過(guò)基因克隆
4、、蛋白表達(dá)、抗體制備等,進(jìn)一步研究這兩種蛋白在病原的侵染和宿主的免疫機(jī)制當(dāng)中發(fā)揮的作用。本論文為進(jìn)一步探究中華絨螯蟹螺原體侵染河蟹的分子機(jī)制以及河蟹的免疫機(jī)制提供堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ),并為進(jìn)一步減少螺原體對(duì)河蟹養(yǎng)殖業(yè)的危害提供理論依據(jù),該論文主要從以下三個(gè)方面來(lái)開(kāi)展研究:
1.iTRAQ篩選螺原體感染前后中華絨螯蟹血細(xì)胞的差異蛋白
本實(shí)驗(yàn)通過(guò)iTRAQ技術(shù)篩選螺原體感染前后河蟹血細(xì)胞差異表達(dá)的蛋白,初步鑒定這些蛋白,根據(jù)功能分
5、為免疫相關(guān)蛋白、生理相關(guān)蛋白以及細(xì)胞骨架相關(guān)蛋白等等。本實(shí)驗(yàn)選擇差異倍數(shù)≥1.2的蛋白進(jìn)行功能分析,實(shí)驗(yàn)中篩選出來(lái)的具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的差異蛋白(上調(diào)蛋白和下調(diào)蛋白)一共有76種。其中上調(diào)蛋白有35種,下調(diào)蛋白有41種,在這些差異表達(dá)的蛋白中大約有20種是與免疫相關(guān)的蛋白。上調(diào)蛋白包括谷胱甘肽轉(zhuǎn)氨酶(prostaglandin D synthase,GST),鐵蛋白(ferritin)和熱休克60(heat shock protein60,
6、HSP60)等。下調(diào)蛋白包括兩種凝集素蛋白(mannosebinding protein and hemocytin)、三種絲氨酸蛋白酶抑制劑蛋白(two serpins and pacifastin)、三種不同的絲氨酸蛋白酶等等。選擇其中的8種蛋白(a2M,GST, ferritin,tubulin,crustin,thioredoxin,clip domain serine proteaseand serpin),通過(guò)實(shí)時(shí)定量PCR
7、(qRT-PCR)的方法檢測(cè)其對(duì)應(yīng)蛋白在基因水平的變化,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明除了tubulin其余的結(jié)果都與iTRAQ篩選結(jié)果基本保持一致。
2.Rab7基因克隆、蛋白原核表達(dá)及相關(guān)功能研究
Rab7屬于小G蛋白家族中的一種,近期的研究表明Rab蛋白在甲殼類的先天性免疫當(dāng)中發(fā)揮著重要作用。本研究為了進(jìn)一步驗(yàn)證iTRAQ篩選的Rab7蛋白表達(dá)變化以及進(jìn)一步揭示該蛋白在河蟹的免疫反應(yīng)當(dāng)中發(fā)揮的作用。本實(shí)驗(yàn)首先通過(guò)RACE技術(shù)擴(kuò)增
8、了Rab7的基因全長(zhǎng),并成功在體外完成原核表達(dá)、純化以及多克隆抗體的制備。qRT-PCR檢測(cè)在螺原體的感染下Rab7 mRNA表達(dá)變化,通過(guò)Western blot技術(shù)檢測(cè)在螺原體的感染下河蟹血細(xì)胞當(dāng)中Rab7蛋白的表達(dá),其結(jié)果與iTRQA基本一致。這一結(jié)果進(jìn)一步說(shuō)明了Rab7在河蟹應(yīng)對(duì)螺原體的感染中發(fā)揮重要作用。
3.14-3-3基因克隆、蛋白原核表達(dá)及相關(guān)功能研究
14-3-3蛋白是一類酸性可溶性蛋白并且在真核生
9、物中有著廣泛的分布,最近的研究表明14-3-3蛋白在甲殼類的先天性免疫過(guò)程當(dāng)中發(fā)揮重要作用。本研究為了進(jìn)一步驗(yàn)證iTRAQ中得到的14-3-3蛋白的表達(dá)變化并進(jìn)一步揭示該蛋白在河蟹的免疫反應(yīng)當(dāng)中的作用。首先,通過(guò)PCR技術(shù)克隆14-3-3的基因,并對(duì)序列進(jìn)行分析。其次,成功在體外完成該蛋白的原核表達(dá),純化以及多克隆抗體的制各純化。qRT-PCR技術(shù)檢測(cè)在螺原體的感染下14-3-3 mRNA的表達(dá)變化,通過(guò)Western blot檢測(cè)該蛋
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