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文檔簡介
1、目的:利用全外顯子測序技術結合尿道下裂家系,尋找尿道下裂新的可疑易感基因,分析可疑易感基因的相關功能和作用途徑,得到優(yōu)選新致病基因,為后續(xù)開展新致病基因的生物信息學和功能小鼠模型研究提供依據(jù),從而進一步闡明尿道下裂的分子發(fā)病機制。
方法:本課題組收集了一個珍貴的尿道下裂家系,對家系中所有患者利用PCR、毛細管電泳技術進行已報道易感基因的篩查,排除已知易感基因在該家系中的影響。在此研究結果上,利用全外顯子測序技術對該家系開展研究
2、,將得到的外顯子數(shù)據(jù)結合大量公共數(shù)據(jù)庫提供的外顯子數(shù)據(jù)開展分析,解釋研究結果,發(fā)現(xiàn)可疑新致病基因。同時將可疑新致病的突變位點在家系正常男性中進行篩查,排除非致病基因突變后,得到優(yōu)選新致病基因,收集、分析高度可疑新致病基因的功能后得到優(yōu)選新致病基因。
結果:本課題組排除了已報道易感基因對該尿道下裂家系樣本的影響,后對該家系中3名患者開展全外顯子測序,將獲得的數(shù)據(jù)利用公共數(shù)據(jù)庫提供的外顯子數(shù)據(jù)進行比對和分析,找出3位患者共有的異常
3、位點,發(fā)現(xiàn)了分布于17個不同基因的12個位點插入/缺失和7個位點改變,將這些異常位點在家系正常男性中進行篩查,共得到分布于6個可疑致病基因的6個位點改變,收集、分析可疑新致病基因的功能,在這些可疑基因中包含著一些值得深入研究的基因,SRA1基因與性激素受體信號通路有關,NOTCH2NL基因可能介導多種細胞的細胞間的相互作用。
結論:本課題組的研究通過全外顯子測序技術在尿道下裂家系中發(fā)現(xiàn)的可疑基因符合我們初期對可疑基因數(shù)目的估計
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