利用基因芯片技術(shù)篩選食管癌細(xì)胞侵襲轉(zhuǎn)移相關(guān)分子靶標(biāo).pdf

1、目的：應(yīng)用基因芯片技術(shù)篩選食管癌侵襲轉(zhuǎn)移相關(guān)基因，初步了解食管鱗癌侵襲轉(zhuǎn)移相關(guān)機(jī)制。
　　方法：利用Transwell侵襲小室技術(shù)建立具有不同侵襲轉(zhuǎn)移潛能的人食管鱗癌Eca109和Eca109-T4細(xì)胞株；分別提取Eca109和Eca109-T4的總RNA，用轉(zhuǎn)錄Cy5和Cy3熒光標(biāo)記成cDNA探針，再與Affymetrix基因芯片雜交，雜交信號用Genechip?Scanner3000掃描，SAM3.0、Cluster3.0軟件

2、分析和處理數(shù)據(jù)；運(yùn)用實時熒光定量PCR（real-time quantitative PCR，qRT-PCR）技術(shù)對CXCR7、SDC2、HSP90α1、TNFRSF10D基因進(jìn)行驗證；數(shù)據(jù)采用SPSS17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計分析。
　　結(jié)果：篩選出Eca109和Eca109-T4差異基因有80個：與母系比較，在Eca109-T4中上調(diào)表達(dá)的基因有34個，下調(diào)表達(dá)的基因有46個。其中，經(jīng)實時熒光定量 PCR（qRT-PCR）驗證：CX

3、CR7在Eca109-T4中的mRNA表達(dá)量（9.86±1.38）顯著高于 Eca109（6.04±1.88，P﹤0.05），SDC2在 Eca109-T4中的mRNA表達(dá)量（0.07±0.0067）顯著高于Eca109（0.04±0.0037，P﹤0.05），HSP90α1在Eca109-T4中的mRNA表達(dá)量（0.18±0.0460）顯著高于 Eca109（0.05±0.0098，P﹤0.05），TNFRSF10D在Eca109-T