利用基因芯片篩選乳腺癌相關(guān)差異表達(dá)基因.pdf

1、背景:目前乳腺癌已經(jīng)在世界范圍內(nèi)成為嚴(yán)重威脅女性健康的重大惡性疾病之一。上世紀(jì)80年代以來(lái)，在全球范圍內(nèi)乳腺癌分發(fā)病率都呈現(xiàn)出非常明顯的上升趨勢(shì)，每年以2％～3％的速度遞增，而這一現(xiàn)象在發(fā)展中國(guó)家尤為突出。有數(shù)據(jù)顯示，2000～2005年，中國(guó)乳腺癌發(fā)病人數(shù)增長(zhǎng)38.5％，死亡人數(shù)增長(zhǎng)37.1％。目前乳腺癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程尚不完全明了，從而在一定程度上對(duì)乳腺癌的早期診斷、相關(guān)治療帶來(lái)很大的困惑。任何腫瘤的發(fā)生發(fā)展都包含了十分復(fù)雜的生物學(xué)過(guò)程

2、。對(duì)個(gè)體而言，所有機(jī)體細(xì)胞攜帶相同的遺傳模板，那么各種細(xì)胞型，包括癌細(xì)胞在內(nèi)，是如何獲得不同的表型的呢？科學(xué)家最終發(fā)現(xiàn)，各種類型細(xì)胞對(duì)基因組的選擇性表達(dá)決定了細(xì)胞的不同表型，同時(shí)提示我們基因表達(dá)的異常改變是正常細(xì)胞向惡性腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)變的基礎(chǔ)。任何腫瘤都起源于正常組織，腫瘤細(xì)胞是由失去了聚集能力和構(gòu)成正常組織能力的細(xì)胞構(gòu)成的。RNA，是連接DNA與蛋白的橋梁。通過(guò)分析RNA水平的差異，能夠?yàn)槲覀兿乱徊皆诜肿铀窖芯肯嚓P(guān)基因／蛋白在疾病發(fā)生發(fā)

3、展過(guò)程中的作用提供理論依據(jù)，也是尋找疾病相關(guān)基因／蛋白的一種理想方法。因此通過(guò)基因表達(dá)譜芯片比較乳腺癌及正常乳腺組織的差異表達(dá)基因，并據(jù)此進(jìn)行相關(guān)生物學(xué)過(guò)稱與乳腺癌發(fā)生發(fā)展之間的關(guān)系，將對(duì)明確乳腺癌的生物學(xué)過(guò)程提供一定的研究基礎(chǔ)。
　　 目的:本次研究旨在探索乳腺癌組織與自身正常乳腺組織、乳腺良性疾病之間的差異表達(dá)基因，為今后進(jìn)一步研究相關(guān)基因與乳腺癌的關(guān)系，相關(guān)基因或其表達(dá)產(chǎn)物在乳腺癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程中的作用打下基礎(chǔ)。
　　

4、 方法:本研究采用全人類基因組芯片，檢測(cè)7對(duì)乳腺癌及其正常乳腺組織、7例乳腺良性疾病的差異表達(dá)基因，通過(guò)real-time PCR對(duì)芯片試驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證，并根據(jù)GeneOntology(GO)分類體系初步對(duì)得出的差異表達(dá)基因進(jìn)行功能分類。
　　 結(jié)果:
　　 1．差異表達(dá)基因：乳腺癌組織同癌旁正常乳腺組織相比，共得出344個(gè)差異表達(dá)基因。在這一組基因中，上表達(dá)的有273個(gè)，下表達(dá)的有71個(gè)（與細(xì)胞增殖有關(guān)的基因有27個(gè)

5、，其中上表達(dá)的有21個(gè)，下表達(dá)的有6個(gè)；與細(xì)胞粘附有關(guān)的基因有15個(gè)，其中上表達(dá)的有5個(gè)，下表達(dá)的有10個(gè)；與細(xì)胞凋亡有關(guān)的基因有23個(gè)，其中上表達(dá)的有20個(gè)，下表達(dá)的有3個(gè)）。乳腺癌組織與乳腺良性疾病的差異表達(dá)基因有235個(gè)，上表達(dá)的有140個(gè)，下表達(dá)的有95個(gè)（與細(xì)胞增殖有關(guān)的基因有10個(gè)，其中上表達(dá)的有8個(gè)，下表達(dá)的有2個(gè)；與細(xì)胞粘附有關(guān)的基因有12個(gè)，其中上表達(dá)的有7個(gè)，下表達(dá)的有5個(gè)；與細(xì)胞凋亡有關(guān)的基因有11個(gè)，其中上表達(dá)的

6、有10個(gè)，下表達(dá)的有1個(gè)）。
　　 2．乳腺癌和正常乳腺組織的聚類分析：采用cluster3.0軟件對(duì)所得實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析，可以發(fā)現(xiàn)三種乳腺組織不能完全分開。單純分析7對(duì)乳腺癌和癌旁正常乳腺組織，聚類分析圖顯示二者也不能夠完整的分開。
　　 結(jié)論:乳腺癌組織與正常乳腺組織間在基因的表達(dá)層面存在明顯差異。篩選得到的基因涉及細(xì)胞增殖、細(xì)胞粘附、細(xì)胞凋亡等腫瘤發(fā)生發(fā)展的重要生物學(xué)過(guò)程，可能與乳腺癌的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)，但仍需