MBL1、FABP4和FABP9基因多態(tài)性及其與奶牛產(chǎn)奶性能和體細(xì)胞評分的相關(guān)性.pdf

1、奶牛的產(chǎn)奶性能直接影響奶生產(chǎn)和經(jīng)濟(jì)效益，隨著遺傳育種的不斷開展，奶牛產(chǎn)奶性能不斷提高，而奶?？共×头敝承阅軇t隨之不斷下降，特別是乳房炎發(fā)病率也隨之升高。乳房炎是影響奶牛產(chǎn)奶性能的一種嚴(yán)重疾病，降低乳房炎有助于提高產(chǎn)奶量和奶品質(zhì)。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展，分子輔助選擇已成為遺傳改良的重要手段之一。
　　本研究基于本研究室前期全基因組SNP關(guān)聯(lián)分析及基因篩選結(jié)果，從候選基因中選擇MBL1、FABP4和FABP9作為本研究的對象，以4

2、50頭荷斯坦奶牛的DNA樣本和產(chǎn)奶量紀(jì)錄為研究材料。對這三個(gè)基因中的12個(gè)SNP在450頭荷斯坦奶牛樣本中進(jìn)行基因分型及連鎖不平衡分析，并對基因多態(tài)性與奶牛體細(xì)胞評分（Somatic Cell Score，SCS）和產(chǎn)奶性能（乳脂率、乳蛋白率、305天奶量、總奶量、總?cè)橹?、總蛋白、高峰奶）進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，篩選和鑒定與SCS和產(chǎn)奶性狀相關(guān)的分子標(biāo)記。主要結(jié)果如下：
　　（1）在MBL1、FABP4和FABP9基因外顯子及側(cè)翼區(qū)域一共獲

3、得28個(gè)SNP，其中有6個(gè)錯(cuò)義突變（Missense SNP），分別是FABP4基因Exon2上rs110757796位點(diǎn)和 Exon3上 rs110652478位點(diǎn)、FABP9基因 Exon2上 rs137165793位點(diǎn)和rs110571965位點(diǎn)、FABP9基因Exon4上rs136262565位點(diǎn)和rs137228156位點(diǎn)；有1個(gè)剪接突變，即FABP4基因Exon3上rs110383592位點(diǎn)；2個(gè)同義突變，MBL1基因Exo

4、n2上rs110326717位點(diǎn)和FABP4基因Exon4上rs110370032位點(diǎn)；其它還包括5端及3端側(cè)翼序列發(fā)現(xiàn)6個(gè)、3端非翻譯區(qū)6個(gè)、內(nèi)含子上7個(gè)。
　?。?）從檢測到的28個(gè)SNP中，選擇其中12個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行基因分型后進(jìn)行連鎖不平衡分析。結(jié)果表明，在FABP4和FABP9基因上，有8個(gè)SNP存在高度連鎖不平衡（r2>0.9），分別是位于FABP4基因的rs110757796位點(diǎn)、rs110383592位點(diǎn)、rs11037

5、0032位點(diǎn)和 rs109077068位點(diǎn)及位于FABP9基因的rs137165793位點(diǎn)、rs137228156位點(diǎn)、rs110807318位點(diǎn)和rs109240772位點(diǎn)。8個(gè)高度連鎖的位點(diǎn)存在3種單倍型（CCCCCAGA，TAGGTGCG，TAGGTGCA）。
　?。?）對位于MBL1基因的兩個(gè)SNP分別與奶牛第一、二、三個(gè)泌乳期進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，發(fā)現(xiàn)位于Intron1的rs208491630位點(diǎn)與奶牛第一個(gè)泌乳期乳脂率第二泌乳

6、期SCS和第三泌乳期乳蛋白率和305天奶量相關(guān)，其中AC基因型為優(yōu)勢基因型。與前三個(gè)泌乳期總數(shù)據(jù)進(jìn)行SCS和產(chǎn)奶性能關(guān)聯(lián)分析，該位點(diǎn)與奶牛乳脂率和乳蛋白率相關(guān)，其中AC基因型為優(yōu)勢基因型（P<0.05）。
　　位于Exon2上rs110326717位點(diǎn)與奶牛第一個(gè)泌乳期高峰奶和第二泌乳期乳脂率、乳蛋白率相關(guān)。與前三個(gè)泌乳期總數(shù)據(jù)進(jìn)行SCS和產(chǎn)奶性能關(guān)聯(lián)分析，該位點(diǎn)與奶牛乳蛋白率相關(guān)，CT型為優(yōu)勢基因型（P<0.05）。
　　

7、（4）FABP4基因rs110652478位點(diǎn)與奶牛第一個(gè)泌乳期乳脂率、第二泌乳期乳蛋白率相關(guān)和第三泌乳期SCS相關(guān)；其中GA基因型為優(yōu)勢基因型（P<0.05）。
　?。?）FABP9基因rs110571965位點(diǎn)與奶牛第一個(gè)泌乳期SCS相關(guān)，且GG基因型為優(yōu)勢基因型（P<0.05）。
　?。?）FABP4和FABP9基因三種單倍型的不同單倍型與奶牛第三個(gè)泌乳期乳蛋白率、總奶量、總蛋白和高峰奶相關(guān)。與前三個(gè)泌乳期總數(shù)據(jù)進(jìn)行S