藏雞生產(chǎn)性能研究及雞三個基因的分離、SNPs檢測及其與經(jīng)濟性狀的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、藏雞是我國青藏高原在原始飼養(yǎng)狀態(tài)下保存下來的珍貴家禽品種。藏雞具有耐寒、抗病、抗缺氧、肉質(zhì)鮮美、藥用價值較高,耐粗放和可觀賞性強等優(yōu)良特性,同時也有生長速度慢、產(chǎn)蛋率低的缺點。如何在保存好這一珍貴遺傳資源的同時,一方面在不影響藏雞優(yōu)良特性的情況下通過引入雜交改良藏雞的缺點以培育新藏雞,另一方面通過經(jīng)濟雜交和產(chǎn)品開發(fā)利用好藏雞就成為當前重要的研究課題。
　　 本研究在農(nóng)業(yè)部“948”項目的基礎(chǔ)上,針對目前藏雞研究現(xiàn)狀,一方面通過引

2、進國外優(yōu)良雞種對藏雞進行雜交利用,另一方面利用我室所建藏雞腿肌全長cDNA文庫信息及侯選基因策略,采用生物信息學與分子生物學技術(shù)相結(jié)合的方法,克隆和分離與重要經(jīng)濟性能有關(guān)的新基因,為分子標記輔助選擇育種提供分子遺傳基礎(chǔ).主要取得了如下結(jié)果:
　　 1.對藏雞、隱性白羽雞和藏隱F1代(藏雞♂×隱性白羽雞♀)的產(chǎn)蛋性能進行分析,發(fā)現(xiàn)藏隱F1代64周齡產(chǎn)蛋數(shù)、蛋重及蛋的大小都較藏雞顯著提高(P<0.05)。同時,對藏雞、隱性白羽雞、藏

3、隱F1代及75％藏雞血液的雜種(藏♂×藏隱F1♀)早期生長發(fā)育進行了比較,結(jié)果表明:藏隱F1代的各周齡體重、周增重及脛長生長情況都高于75％藏雞血液的雜種和純藏雞,達到顯著水平(P<0.05)。
　　 2.運用三種非線性模型Logistic、Gompertz、von Bertalanffy對藏雞的早期生長發(fā)育規(guī)律進行了曲線模擬。三種模型都能較好的模擬藏雞的生長發(fā)育規(guī)律,但Gompertz更加適宜模擬藏雞的生長過程。
　　

4、 3.依據(jù)本實驗室所建藏雞腿肌全長cDNA文庫信息及侯選基因策略,分離并鑒定了雞MyoT基因的全長cDNA序列,并獲得了Cacng1和Camk2d基因片段。結(jié)合雞基因組序列信息,進一步對MyoT,Cacng1和Camk2d基因氨基酸序列、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進行了初步分析和預測。
　　 4.采用了PCR-RFLP、mp-PCR和M-ASP三種方法檢測了MyoT,Cacng1和Camk2d等3個基因7個位點的多態(tài)性和Cacng1基因第2內(nèi)含

5、子長片段的插入/缺失造成的PCR產(chǎn)物長度多態(tài)性,分析了部分多態(tài)位點在不同雞種中的基因型頻率和基因頻率,并分析了各基因型在不同雞種中的分布差異。
　　 5.在我室與西藏大學農(nóng)牧學院合作所建立的試驗群體(藏雞、隱性白羽雞、藏隱F1代和75％藏雞血液的雜種)中采用方差分析的最小二乘法分析了上述三個基因的酶切位點多態(tài)性與部分經(jīng)濟性狀的關(guān)聯(lián)。結(jié)果發(fā)現(xiàn):①MyoT基因第10外顯子Hin6Ⅰ多態(tài)位點不同基因型與腿肌重、腿肌率、全凈膛率和腿肌肉

6、色顯著關(guān)聯(lián)(P<0.05)；3’-UTR區(qū)RsaⅠ多態(tài)位點不同基因型與屠體重、皮下脂肪厚顯著關(guān)聯(lián)(P<0.05)；采用mp-PCR方法在3’-UTR引入了-BsuRⅠ多態(tài)位點,發(fā)現(xiàn)不同基因型與屠體重、肌間脂肪寬、半凈膛重、全凈膛重間差異顯著(P<0.05)。②Cacng1基因第2內(nèi)含子的長片段插入/缺失位點LS與SS基因型個體間嫩度差異極顯著(P<0.01)；第4外顯子MspⅠ多態(tài)位點不同基因型與嫩度和腿肌肉色顯著關(guān)聯(lián)(P<0.05)；

7、Cacng1基因第5外顯子M-ASP多態(tài)位點不同基因型與肝重、滴水損失顯著關(guān)聯(lián)(P<0.05),與胸肌肉色極顯著相關(guān)(P<0.01)；3’-UTR區(qū)MspⅠ多態(tài)位點不同基因型與腿肌肉色顯著關(guān)聯(lián)(P<0.05),并發(fā)現(xiàn)該多態(tài)位點與滴水損失也存在相關(guān)趨勢(P=0.072)。③Camk2d基因第15外顯子VspⅠ多態(tài)位點不同基因型與腹脂重極顯著關(guān)聯(lián)(P<0.01),與pH值顯著關(guān)聯(lián)(P<0.05)。
　　 6.以成年自來航母雞的心、肝