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1、計(jì)算機(jī)模擬研究分子間相互作用和分子行為已經(jīng)被證明是一種強(qiáng)而有力的手段。新型藥物運(yùn)輸系統(tǒng)的開發(fā)是當(dāng)前醫(yī)藥領(lǐng)域研究的熱點(diǎn)話題。而弄清細(xì)胞膜中的跨膜蛋白對(duì)藥物—載體復(fù)合體進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)有著怎樣的影響是一個(gè)基礎(chǔ)問題。本文我們應(yīng)用粗?;肿觿?dòng)力學(xué)模擬了G4 PAMAM樹枝形大分子與KALP多肽在不同pH溶液中的相互作用。我們發(fā)現(xiàn)KALP多肽在兩種pH環(huán)境下對(duì)樹枝形分子的大小、形狀及密度分布影響不大,樹枝形分子內(nèi)部有一定的空間容納KALP多肽分子。自由
2、能的計(jì)算結(jié)果表明在酸性和中性環(huán)境中兩種分子都不容易形成穩(wěn)定的復(fù)合結(jié)構(gòu)。
神經(jīng)退行性疾病與錯(cuò)誤折疊蛋白的組建及沉積形成淀粉樣纖維有關(guān),探索聚集物動(dòng)力學(xué)和纖維的形成途徑吸引了相當(dāng)多的實(shí)驗(yàn)和計(jì)算方面研究者的關(guān)注。淀粉樣蛋白斑是所謂構(gòu)象性疾病的一個(gè)典型特征,例如阿爾茲海默癥或其他海綿狀組織腦病。本文我們應(yīng)用粗?;肿觿?dòng)力學(xué)模擬了G4 PAMAM樹枝形大分子與Amyloid fibril在不同pH溶液中的相互作用。我們發(fā)現(xiàn)Amyloid
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