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1、分子相互作用網(wǎng)絡(luò)是研究生物分子功能及調(diào)控的基礎(chǔ)之一。目前,許多大規(guī)模實驗已經(jīng)運用于多種模式生物,如酵母、果蠅、線蟲和人類,得到了大量的相互作用數(shù)據(jù)。同時,多個研究機(jī)構(gòu)也相應(yīng)地建立數(shù)據(jù)庫,收集整理實驗得到的相互作用數(shù)據(jù)。然而,在植物中,即使是模式生物擬南芥,也缺乏足夠多的相互作用數(shù)據(jù)來支持系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)分析。因此,我們通過整合多種基因組層面的側(cè)面證據(jù),如基因共表達(dá)、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域相互作用、功能注釋的相關(guān)性、同源相互作用、細(xì)胞內(nèi)共定位以及共進(jìn)化,
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