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文檔簡介
1、捻轉(zhuǎn)血矛線蟲(Haemonchus contortus)是危害反芻動物最主要的病原之一,呈全球性分布,在熱帶和亞熱帶地區(qū)感染尤為嚴重,成蟲主要寄生在反芻動物的皺胃及小腸,以吸取宿主血液為生,臨床表現(xiàn)為貧血、水腫和腹瀉等癥狀,嚴重時可引起宿主死亡。由于缺乏相應的商業(yè)化疫苗,應用化學驅(qū)蟲藥仍是治療捻轉(zhuǎn)血矛線蟲感染的首要措施,但是長期無節(jié)制的使用藥物,導致在全球范圍內(nèi)都出現(xiàn)了抗藥性的問題,甚至有的地區(qū)已發(fā)展為多重抗藥性。為了更好的制定有效的應
2、對措施,延緩抗藥性的產(chǎn)生,了解抗藥性相關(guān)突變的起源與分布勢在必行。
苯并咪唑類藥物是最常用的三類驅(qū)蟲藥之一,也是目前抗藥性機制研究最為透徹的。已經(jīng)證明,捻轉(zhuǎn)血矛線蟲的Ⅰ型β微管蛋白基因的三個SNP位點(F167Y,E198A和F200Y)是引起苯并咪唑類產(chǎn)生抗藥性的主要原因。國外已有大量關(guān)于捻轉(zhuǎn)血矛線蟲苯并咪唑類抗藥性的報道,近些年還出現(xiàn)了抗藥性突變起源和分布方面的研究,但是國內(nèi)在此方面的研究相對匱乏,因此本研究通過對中國地區(qū)
3、不同種群的捻轉(zhuǎn)血矛線蟲進行Ⅰ型β微管蛋白基因的分析,從而預測了抗藥性的存在、抗藥程度和分布情況,以及進行了種群遺傳多樣性分析和抗藥性突變起源的分析。
(1)Ⅰ型β微管蛋白基因的多樣性分析
選取了湖北、河北、云南、陜西、廣西、內(nèi)蒙古、遼寧和黑龍江八個種群,共192條捻轉(zhuǎn)血矛線蟲雄蟲用于Ⅰ型β微管蛋白基因的擴增,并采用直接測序的方法進行三個SNP位點的檢測。在中國的捻轉(zhuǎn)血矛線蟲種群中,都沒有檢測到167位點的突變(F16
4、7Y),而198和200位點都出現(xiàn)了不同程度的突變(E198A和F200Y);根據(jù)198和200位點的突變情況,一共檢測到了六種基因型;除此之外,計算了兩個基因座的等位基因頻率,在198位點,抗藥型等位基因頻率為0-70%;在200位點,抗藥型等位基因頻率為0-31%。
通過構(gòu)建基因池對八個種群進行了遺傳多樣性分析和系統(tǒng)進化分析。結(jié)果表明,八個種群的單倍型多態(tài)性和核苷酸多態(tài)性都較為豐富,單倍型多樣性(Hd)變化從0.455到0
5、.939,核苷酸多樣性指數(shù)(π)的變化從0.018到0.039;種群間配對的FST值都相對較低,從0.00907到0.30732,表明八個種群的遺傳分化程度不高,種群之間存在較高的基因流動,中國地區(qū)的種群中沒有較明顯的遺傳結(jié)構(gòu);AMOVA顯示有93%的遺傳變異來自種群內(nèi)部,不同地理位置和不同宿主對中國的捻轉(zhuǎn)血矛線蟲的種群結(jié)構(gòu)影響較小。
運用三種方法進行了系統(tǒng)進化分析,結(jié)果顯示兩個E198A的單倍型序列分布在進化網(wǎng)絡圖的兩個不同
6、的分支部分,同時每個分支還含有至少一個敏感型的單倍型序列,表明中國地區(qū)的捻轉(zhuǎn)血矛線蟲中E198A具有兩個獨立的起源;7個含有F200Y的單倍型序列分布在進化網(wǎng)絡圖的三個不同的分支部分,每個分支也含有至少一個敏感型單倍型序列,表明F200Y具有至少三個不同的起源。
(2)四引物ARMS-PCR檢測方法的建立
基于本研究的結(jié)果,設計了四引物ARMS-PCR方法用于Ⅰ型β微管蛋白基因E198A的檢測,并與直接測序結(jié)果進行準
7、確度的比較。結(jié)果顯示優(yōu)化PCR反應體系,尤其是調(diào)整內(nèi)外引物的濃度比例可以達到更好的擴增效果。通過瓊脂糖凝膠電泳可以清晰的區(qū)分該位點三種不同的基因型,同時出現(xiàn)433bp和200bp表示純合敏感基因型,同時出現(xiàn)433bp和284bp表示純合抗藥基因型,同時出現(xiàn)433bp,284bp和200bp表示雜合基因型。表明該方法可以成功用于捻轉(zhuǎn)血矛線蟲E198A的檢測,并且準確度高,操作簡單。
本研究首次對中國地區(qū)捻轉(zhuǎn)血矛線蟲的苯并咪唑類抗
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