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文檔簡介
1、小麥(Triticum aestivum)在正常的生長過程中,經(jīng)常受到干旱脅迫的影響。研究表明,非編碼RNA直接或者是間接參加了小麥對干旱脅迫的響應(yīng)。通過高通量測序技術(shù)得知,ckcRNA是一種缺失5'末端帽子和3'末端poly(A)尾巴的具閉環(huán)結(jié)構(gòu)的非編碼RNA。在人類、動物和植物中,circRNA作為miRNA的海綿,以“解除”miRNA對其靶基因的抑制作用。然而,迄今為止沒有關(guān)于干旱脅迫下小麥葉片中circRNA的相關(guān)報告。
2、 為了探討干旱脅迫下,小麥幼苗葉片中參與調(diào)控的circRNA的數(shù)量及其潛在的功能,本研究首次使用小麥品種矮抗58(Triticum aestivum L.cv.Aikang58)為材料,在充分澆水(CK組)和PEG處理模擬干旱(PEG組)兩種情況下,分別提取出小麥葉片的總RNA,進行了全基因組的circRNA測序,并用生物信息學(xué)工具對數(shù)據(jù)進行分析。
本研究在干旱脅迫下,篩選和鑒定了小麥葉片中的circRNA,研究了小麥cir
3、cRNA的差異化表達的模式,推斷了circRNA作為miRNA“海綿”的調(diào)控功能,并對差異化表達的circRNA進行實時定量PCR驗證,預(yù)測了circRNA相對應(yīng)mRNA的功能分類,從而進一步揭示了circRNA在circRNA-miRNA-gene三者的調(diào)節(jié)作用。主要試驗如下:
使用PEG模擬干旱對小麥葉片連續(xù)處理5d,小麥幼苗逐漸倒伏,葉片中RWC含量持續(xù)降低,而丙二醛(MDA)和H2O2的含量均持續(xù)增加。小麥為了減緩干旱
4、對自身造成的損傷,小麥幼苗中超氧化物歧化酶(SOD)、過氧化氫酶(CAT)和過氧化物酶(POD)的含量均所有提高。
本研究在小麥幼苗葉片中進行了基于circRNA富集文庫的深度測序,鑒定出88種待選circRNA,與對照組相比,其中62種在干旱脅迫中表達差異顯著。
在干旱應(yīng)答表達的circRNA中,預(yù)測其中的6種對相應(yīng)的miRNA起到“海綿”作用,并且對這6種circRNA進行了qRT-PCR驗證,有5種的結(jié)果與轉(zhuǎn)錄
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