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文檔簡介
1、目的:篩選哈薩克族食管鱗癌甲基化基因,并研究其病理學(xué)意義。
方法:在細(xì)胞水平,采用人類全基因組寡核苷酸微陣列芯片,熒光雙交換法檢測5-雜氮-2’-脫氧胞苷(5-aza-CdR)干預(yù)的食管鱗癌細(xì)胞Eca109與正常培養(yǎng)的Eca109細(xì)胞中的差異表達(dá)基因,通過甲基化特異性PCR(MSP)和實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)分別驗(yàn)證其甲基化狀態(tài)和表達(dá)量變化;在組織水平,選取18對(duì)哈薩克族食管鱗癌組織樣本,通過MSP和qRT-PCR
2、進(jìn)一步驗(yàn)證細(xì)胞水平篩選出的高度甲基化基因的甲基化狀態(tài)和表達(dá)量變化,并分析其與哈薩克族食管鱗癌患者臨床病理參數(shù)的相關(guān)性。
結(jié)果:經(jīng)5-aza-CdR干預(yù)的Eca109細(xì)胞形態(tài)發(fā)生改變,細(xì)胞密度降低,細(xì)胞間接觸變松,細(xì)胞體積增大,細(xì)胞內(nèi)可見大量空泡,呈凋亡形態(tài),存活細(xì)胞數(shù)減少?;蛐酒Y選獲得384個(gè)差異表達(dá)基因,其中303個(gè)基因表達(dá)上調(diào),81個(gè)基因表達(dá)下調(diào);表達(dá)上調(diào)基因中,組織因子途徑抑制物-2(TFPI2)基因表達(dá)上調(diào)11.4
3、2倍,在Eca109細(xì)胞中,重復(fù)驗(yàn)證的MSP結(jié)果顯示:正常培養(yǎng)組甲基化陽性,干預(yù)組非甲基化陽性;其啟動(dòng)子區(qū)甲基化陽性率在哈薩克族食管鱗癌組織中為45%。TFPI2基因表達(dá)量在細(xì)胞水平和哈薩克族食管鱗癌組織均有顯著差異(p<0.05)。A激酶錨定蛋白12(AKAP12)基因表達(dá)上調(diào)4.05倍,但其啟動(dòng)子區(qū)甲基化在食管鱗癌發(fā)生率均較低,在細(xì)胞水平和哈薩克族食管鱗癌組織表達(dá)量無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。TFPI2基因表達(dá)量及甲基化均與哈薩克族食管鱗癌組織的
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