RXR藥效團(tuán)模建和分子對(duì)接研究.pdf

1、RXR能以形成同源二聚體(RXR∶RXR)或與其它核受體(RAR、TR、VDR、LXR、FXR、PPARs、NGFIB)形成異源二聚體的形式調(diào)節(jié)多個(gè)基因轉(zhuǎn)錄。因此對(duì)多種核受體有調(diào)節(jié)作用，成為近幾年藥物開發(fā)的重要靶點(diǎn)之一。
　　 本實(shí)驗(yàn)利用Catalyst軟件生成并研究了RXR(α，β，γ)激動(dòng)劑和RXRα拮抗劑的三維藥效團(tuán)模型。并利用DOCK軟件對(duì)RXR(α，β)激動(dòng)劑與相應(yīng)受體進(jìn)行了對(duì)接研究。
　　 RXRα激動(dòng)劑最佳

2、模型包括四個(gè)藥效團(tuán)元素(3個(gè)疏水團(tuán)，1個(gè)氫鍵受體)和8個(gè)排除體積。分子對(duì)接結(jié)果顯示配體分子絕大部分處于受體的疏水區(qū)域，周圍有較多體積較大的氨基酸形成空間位阻，限制配體分子與受體結(jié)合，配體分子能與Ala332間形成氫鍵。藥效團(tuán)模型能與分子對(duì)接結(jié)果很好地?cái)M合，互相印證了結(jié)果的可靠性。
　　 RXRα拮抗劑的三維藥效團(tuán)模型包括四個(gè)藥效團(tuán)元素(3個(gè)疏水團(tuán)，1個(gè)氫鍵受體，1個(gè)芳香環(huán))和5個(gè)排除體積。
　　 RXRβ激動(dòng)劑的三維藥效

3、團(tuán)模型包括四個(gè)藥效團(tuán)元素(1個(gè)氫鍵受體，2個(gè)脂肪疏水團(tuán)，1個(gè)芳香疏水團(tuán))和9個(gè)排除體積。分子對(duì)接結(jié)果顯示配體分子絕大部分處于受體的疏水區(qū)域，周圍有較多體積較大的氨基酸形成空間位阻，限制配體分子與受體結(jié)合，配體分子能與Ala398、Arg387間形成氫鍵。藥效團(tuán)模型能與分子對(duì)接結(jié)果很好地?cái)M合，互相印證了結(jié)果的可靠性。
　　 RXRγ激動(dòng)劑的三維藥效團(tuán)模型包括五個(gè)藥效團(tuán)元素(1個(gè)氫鍵受體，3個(gè)脂肪疏水團(tuán)，1個(gè)芳香疏水團(tuán))和5個(gè)排除體