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文檔簡介
1、背景與目的乙型肝炎病毒(HBV)感染是全球性的嚴(yán)重公共衛(wèi)生問題,是嚴(yán)重危害人類健康的重要傳染病之一。依托國家“十一五”傳染病重大專項(xiàng),進(jìn)一步完善中國 HBV耐藥監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)平臺,從平臺對中國慢性乙型肝炎(乙肝)及乙肝后肝硬化患者核苷(酸)類藥物治療耐藥情況進(jìn)行監(jiān)測和分析。
研究方法第一部分:采用網(wǎng)絡(luò)信息與生物信息技術(shù),建立并初步完善中國乙肝病毒(HBV)耐藥網(wǎng)絡(luò)監(jiān)測平臺,分析當(dāng)前HBV逆轉(zhuǎn)錄酶(RT)區(qū)耐藥相關(guān)基因突變的特點(diǎn)及耐藥
2、現(xiàn)狀。
第二部分:抽提HBV感染者外周血血清HBV DNA,PCR分三段擴(kuò)增HBV RT區(qū)后構(gòu)建片段化DNA文庫,分別采用454和Sanger測序法測定DNA序列。對結(jié)果數(shù)據(jù)進(jìn)行處理后利用生物信息學(xué)軟件進(jìn)行比較分析。
主要結(jié)果第一部分:建立了目前國內(nèi)覆蓋面最廣的大型 HBV基因多功能共享數(shù)據(jù)庫。截止2012年12月份為止,已對9998例乙肝患者進(jìn)行了基因耐藥檢測,其中基因型明確的患者有7551例,B基因型為2421例
3、,占32.06%(2421/7551),C基因型為5088例,占67.38%(5088/7551),D基因型患者為42例,占0.56%(42/7551)。在檢測到原發(fā)性耐藥相關(guān)位點(diǎn)突變及代償性突變5207例(5229/7551,68.96%)患者中,C基因型占3700例(3700/5088,72.72%),B基因型占1482例(1482/2421,61.21%),C基因型的構(gòu)成比明顯高于B基因型(P<0.001);在原發(fā)性耐藥位點(diǎn)突變中
4、,主要耐藥突變(rtM204V/I,rtA181T/V,rtN236T)的檢出率為43.64%(3295/7551),其中 M204I、rtA181T(sW172*)和rtA181V突變常見于C基因型(P值均小于0.01),而N236T突變卻在 B基因型中多見(P<0.001)。在恩替卡韋繼發(fā)性耐藥突變的患者中,M204V比M204I更常見(P<0.001)。國內(nèi)部分地區(qū)或醫(yī)院抗病毒治療的核苷(酸)藥物應(yīng)用方案紛繁復(fù)雜,不夠規(guī)范,多藥耐
5、藥的構(gòu)成比高達(dá)1.73%(131/7551)。第二部分:在檢測的20例患者中,19例患者的454和Sanger測序序列結(jié)果完整,其中B基因型6例,占31.58%(6/19),C基因型13例,占68.42%(13/19);對已報(bào)道的HBV RT區(qū)NA耐藥相關(guān)基因突變進(jìn)行檢測,結(jié)果表明454法可以測到所有 Sanger法所發(fā)現(xiàn)的基因變異,每個(gè)樣本檢測到的變異總數(shù)454法為11~36個(gè),Sanger法為3~17個(gè),Sanger測序檢測到的變異
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