遺傳性非息肉型結(jié)直腸癌一家系全外顯子組測序分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:對一個HNPCC家系中3例患者進(jìn)行全外顯子測序,初步篩選HNPCC的易感基因。
  方法:收集一個典型HNPCC家系中3個患者的靜脈血采用全外顯子捕獲和新一代測序技術(shù)進(jìn)行高通量測序,測序結(jié)果與人類HAPMAP, dbSNP130和1000 Genome Project數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對過濾己報道的常見變異,再過濾掉同義突變,將先證者及其弟、其妹三人單核苷酸非同義突變進(jìn)行整合,初步篩選出HNPCC候選基因。
  結(jié)果:①通過

2、原始質(zhì)量評分過濾,兄弟妹三個患者共得到60.4G的數(shù)據(jù)。②過濾掉不在外顯子區(qū)域的單核苷酸變化(SNVs),落在外顯子區(qū)域的單核苷酸變化數(shù)目分別為91,224,395個,133,688,255個105,656,069個;過濾掉公共數(shù)據(jù)庫(HAPMAPB,dbSNP130和1000Genome Project)的常見變異,落在外顯子區(qū)域的未報道的單核苷酸變化數(shù)目分別為83,257,847、120,411,348個和95,653,932個;過

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