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文檔簡介
1、目的:探討建立應(yīng)用實(shí)時熒光定量RT-PCR(Real-Time QuantitativeReverse Transcription Polymerase chain Reaction,RQ-RT-PCR) 檢測AML1/ETO融合基因的RNA標(biāo)準(zhǔn)品的方法,并以此作為工具監(jiān)測急性粒細(xì)胞白血病部分成熟型(M2)患者微小殘留病(Minimal Residual Disease,MRD)的狀態(tài),為判斷預(yù)后、預(yù)測復(fù)發(fā)、探索強(qiáng)化治療時機(jī)、最終實(shí)現(xiàn)個
2、體化治療提供依據(jù)。 方法:1、提取患者標(biāo)本的總RNA,根據(jù)已知序列設(shè)計(jì)特異性引物:2、應(yīng)用定性的RT-PCR在患者標(biāo)本中篩選AML1/ETO融合基因,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳確認(rèn)后回收;3、回收的含有目的基因的PCR產(chǎn)物與質(zhì)粒PMD-18T連接后,轉(zhuǎn)入大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞JM-109;4、將大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞接種于AIX選擇性平板37℃過夜培養(yǎng)擴(kuò)增,挑取陽性菌落提取質(zhì)粒;5、以質(zhì)粒為摸板進(jìn)行PCR反應(yīng),經(jīng)電泳確認(rèn)連接成功的質(zhì)粒提取DNA送
3、寶生物公司進(jìn)行測序確認(rèn);6、將含有目的基因的陽性質(zhì)粒經(jīng)HindⅢ酶切后進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄,電泳確認(rèn)后測取OD值,得到RNA標(biāo)準(zhǔn)品10<'10>拷貝數(shù);7、應(yīng)用RQ-RT-PCR.驗(yàn)證標(biāo)準(zhǔn)品的性能并對此方法進(jìn)行方法學(xué)評價;8、對37例患者骨髓或外周血單個核標(biāo)本進(jìn)行了檢測,并對其中5例患者進(jìn)行了跟蹤監(jiān)測;9、應(yīng)用流式細(xì)胞儀檢測患者白血病相關(guān)的免疫表型及凋亡相關(guān)蛋白Bcl-2、Bcl-x<,L>及Bax,并對1例AML1/ETO融合基因陰性的患者進(jìn)
4、行了跟蹤監(jiān)測。 結(jié)果:1、調(diào)取目的基因AML1/ETO的片段長度為402bp,回收并經(jīng)載體擴(kuò)增后測序確認(rèn)為所需的目的基因;2、構(gòu)建的RNA標(biāo)準(zhǔn)品可以得到線性好的標(biāo)準(zhǔn)曲線(方程為Y=-3.477*LOG(X)+41.63),擴(kuò)增效率較高(E=93.9﹪),融解曲線顯示特異性較好,融解溫度在83℃±1℃,表明標(biāo)準(zhǔn)品構(gòu)建成功;3、熒光定量PCR檢測目的基因AML1/ETO的敏感性為10<'-5>,重復(fù)性較好,批內(nèi)變異為6﹪,批間變異為
5、10﹪,特異性較高; 4、患者初診組及復(fù)發(fā)組的目的基因AML1/ETO的相對值的平均值高于完全緩解組(CR),P<0.05,且存在個體差異;5、隨訪的患者,初診時目的基因AMLl/ETO的相對值很高,完全緩解時降低,復(fù)發(fā)時明顯升高,初診和CR兩個時間點(diǎn)目的基因AML1/ETO的相對值相差2個數(shù)量級以上病人的復(fù)發(fā)危險性相對較小,如果基因AML1/ETO的相對值持續(xù)升高,提示患者的生存期較短預(yù)后較差;6、經(jīng)治療持續(xù)未緩解的病人跟蹤監(jiān)測凋亡相
6、關(guān)蛋白Bel-2/Bax表達(dá)比值呈上升趨勢;7、患者體內(nèi)CD13和HLA-DR表達(dá)穩(wěn)定,且與病情發(fā)展相關(guān),可作為無特異性融合基因的患者檢測MRD的補(bǔ)充手段;8、對患者21免疫表型跟蹤監(jiān)測表明在治療過程中出現(xiàn)了表型漂移。 結(jié)論:RO-RT-PCR方法檢測AML1/ETO。融合基因的敏感性和特異性較高,可信度和穩(wěn)定性較好:融合基因表達(dá)水平的改變與臨床疾病進(jìn)展關(guān)系一致,對AML1/ETO融合基因陽性的患者M(jìn)RD的定量動態(tài)監(jiān)測有助于反映
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