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文檔簡介
1、DEAD-box家族蛋白是一類ATP依賴的RNA解旋酶,廣泛存在于從細菌到哺乳動物的許多物種中,參與RNA代謝的幾乎所有過程。其中的vasa和PL10基因?qū)τ谏臣毎陌l(fā)生具有重要作用。由于vasa基因在許多動物生殖系細胞中的表達特異性,它被廣泛用作生殖細胞的分子標記物,在動物生殖細胞發(fā)生和生殖調(diào)控等研究中起到了重要的作用。中國明對蝦(Fenneropenaeus chinensis)是我國最重要的經(jīng)濟蝦類之一,對其生殖和發(fā)育的研究具有
2、重要意義。本文采用同源克隆策略,篩選和克隆了中國明對蝦兩個DEAD-box家族基因Fc-vasa和Fc-PL10a的全長cDNA序列,并對其進行了序列特征和表達分析。 克隆得到的Fc-vasa基因cDNA序列全長2893 bp,含有開放閱讀框2139 bp,可以編碼712個氨基酸,F(xiàn)c-PL10a基因cDNA序列全長2398 bp,其中開放閱讀框長1983 bp,編碼660個氨基酸。兩基因推導(dǎo)的氨基酸序列具有DEAD-box家族
3、蛋白共有的全部九個保守結(jié)構(gòu)域和RGG重復(fù)序列,F(xiàn)c-VASA、Fc-PL10A具有VASA和PL10蛋白共同保守的ARKF框,F(xiàn)c-VASA的N端區(qū)域存在3個VASA蛋白特有的鋅指結(jié)構(gòu)(CCHC框)。同源性比對和進化分析顯示兩基因編碼蛋白分別與其他物種的VASA和PL10相關(guān)蛋白具有較高的相似性,證明VASA和PL10蛋白在進化上高度保守。蛋白三維結(jié)構(gòu)預(yù)測蛋白功能顯示兩個蛋白Fc-VASA和Fc-PL10A具備了DEAD-box家族蛋白
4、RNA連接,ATP酶和解旋酶的功能。 半定量RT-PCR分析顯示,F(xiàn)c-vasa基因在成體性腺組織中特異表達,表達量隨著性腺成熟逐漸降低;原位雜交結(jié)果表明Fc-vasa mRNA主要在精原細胞和卵母細胞的胞質(zhì)中表達顯著,因此,推測該基因可能參與中國明對蝦兩性配子的發(fā)生。胚胎和幼蟲RT-PCR分析檢測到2細胞期至膜內(nèi)無節(jié)幼的各期胚胎都含有 Fc-vasa mRNA。但表達量逐漸降低,自出膜后的無節(jié)幼體開始檢測不到表達信號,根據(jù)以上
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