SNAP分子標(biāo)記檢測玉米Ael，Sul，D9，ZmRap基因多態(tài)性.pdf

1、本研究以我國山東省、湖北省和河南省主要骨干自交系中的58個玉米自交系為材料，應(yīng)用Single-nucleotide amplified polymorphisms(SNAP)分析了Ael、Sul、D9、ZR四個基因的single nucleotide polymorphisms(SNP)，對所得結(jié)果進(jìn)行單倍型分析，聚類分析，連鎖不平衡分析，從而探討了這58個玉米自交系的遺傳多樣性，并對導(dǎo)致遺傳多樣性的原因進(jìn)行了討論。主要結(jié)果如下：

2、 1.建立了玉米SNAP．PCR體系，玉米SNAP標(biāo)記的PCR程序?yàn)椋?4℃變性3min；94℃變性20s，60℃退火10s，72℃延伸10s，37個循環(huán)；最后72℃延伸3min，4℃保存，反應(yīng)總體積20μl，模板DNA濃度為20ng，Mg2+濃度為2.0μmol/L，該體系的擴(kuò)增結(jié)果重復(fù)性好，穩(wěn)定性強(qiáng)，玉米多態(tài)性譜帶豐富。 2.根據(jù)SNP(Single-nucleotide polymorphisms)標(biāo)記聚類分析的結(jié)果，將

3、58個玉米自交系分成6個類群。聚類分析揭示了硬粒型，馬齒型和半馬齒型的玉米品種分別構(gòu)成了不同的亞群，例如：Ⅰ-Ⅰ包括品種B73，武314，318-4，E28，浚92-8，178，昌-72，87-1，獨(dú)321，黃582，撫96，掖502，P138，374，鄂玉21，X0017，13781，3184，撫85，k12s22，k22137，4c310，冀35-66，9801，$73。其中，E28，黃582，鄂t2l，13781四個品種為半馬齒型

4、，3184，撫85為馬齒型，其他所有的自交系品種種質(zhì)表型為硬粒型。Ⅰ—Ⅰ亞類中，Ael基因主要為TTCG的單倍型，V-Ⅱ主要表現(xiàn)為TCCG，TCTA等單倍型。Sul基因，Ⅰ-Ⅰ亞類中主要表現(xiàn)為TAG，TGG兩種單倍型，這個結(jié)果說明，種質(zhì)資源的特征，包括硬粒性，馬齒型，半馬齒型可能是由基因Ael和Sul SNP位點(diǎn)的單倍型特征決定的。這種單倍型的特征由人工選擇獲得，人工選擇導(dǎo)致了被選擇位點(diǎn)遺傳多樣性的降低。根據(jù)種質(zhì)資源結(jié)合聚類分析圖譜，可

5、以為雜交優(yōu)勢提供理論基礎(chǔ)，為雜交育種工作提供指導(dǎo)作用。同時也說明了SNAP分子標(biāo)記可以用于雜種優(yōu)勢群的劃分。 3.玉米自交系選育過程中的選擇壓力，由于連鎖不平衡現(xiàn)象的存在，單倍型的數(shù)目遠(yuǎn)遠(yuǎn)小于預(yù)期的數(shù)目。連鎖不平衡現(xiàn)象的分析，對基因內(nèi)，基因間，以及染色體間的SNP位點(diǎn)之間的連鎖不平衡現(xiàn)象的分析。結(jié)果顯示，有些SNP位點(diǎn)之間顯示比較強(qiáng)的連鎖現(xiàn)象，而另一些SNP位點(diǎn)之間連鎖現(xiàn)象比較弱或者沒有連鎖現(xiàn)象發(fā)生。這種SNP位點(diǎn)之間不同的連鎖