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文檔簡(jiǎn)介
1、本研究從8個(gè)細(xì)胞凋亡相關(guān)基因(BCL2、BAX、 CASP3、CASP8、CASP9、CASP10、TNF-α和MIF)中,選定10個(gè)推斷的功能SNP位點(diǎn),通過這些SNP位點(diǎn)與連續(xù)收集的445例晚期非小細(xì)胞肺癌患者鉑類聯(lián)合化療療效、血液毒性和胃腸道毒性的關(guān)聯(lián)分析,以期發(fā)現(xiàn)能預(yù)測(cè)療效或毒性的分子標(biāo)記。
關(guān)聯(lián)研究表明,CASP3 rs6948變異等位基因C顯著降低血液毒性風(fēng)險(xiǎn):AC相對(duì)于AA,OR0.588,95%CI0.369-
2、0.940; CC相對(duì)于AA,OR0.174,95%CI0.038-0.784;pfor trend0.010,呈現(xiàn)基因劑量效應(yīng)。TNF-αrs1800629變異等位基因A顯著增加胃腸道毒性風(fēng)險(xiǎn):GA相對(duì)于GG,OR3.354,95%CI1.302-8.640,p值0.012。攜帶BAX rs4645878變異等位基因A的52例個(gè)體(有效病例389)不發(fā)生高度血小板毒性。CASP8 rs3834129、CASP10rs13006529和
3、CASP10rs3900115三個(gè)位點(diǎn)雜合子相對(duì)于野生純合子顯著降低白細(xì)胞毒性,OR(95%CI)分別為0.557(0.334-0.930)、0.587(0.325-0.980)和0.575(0.344-0.959),p值分別為0.025、0.041和0.034。在順鉑-長(zhǎng)春瑞濱治療組中,BCL2 rs2279115變異等位基因A在顯性模型中顯著降低療效,OR0.454,95%CI0.207-0.998,p值0.049。在BCL2 rs
4、1564483與療效的年齡分層關(guān)聯(lián)分析中,出現(xiàn)了截然不同的結(jié)果:在≤57歲年齡組中,BCL2 rs1564483變異純合子加雜合子相對(duì)于野生純合子顯著降低療效,OR為0.327,95%CI為0.116-0.924,p值為0.035;在>57歲年齡組中,則相反,該位點(diǎn)變異純合子加雜合子相對(duì)于野生純合子顯著提高療效,OR為3.088,95%CI為1.528-6.239,p值為0.002。
上述關(guān)聯(lián)分析結(jié)果還需進(jìn)一步擴(kuò)大樣本量和利用
5、其它獨(dú)立樣本加以驗(yàn)證。
為證實(shí)CASP3 rs6948與血液毒性的關(guān)聯(lián),我們另外招募52例經(jīng)鉑類治療的肺癌患者,對(duì)其外周血白細(xì)胞中的mRNA量進(jìn)行熒光實(shí)時(shí)定量PCR分析。攜帶rs6948變異等位基因C的個(gè)體,其CASP3 mRNA相對(duì)表達(dá)量的平均值相對(duì)于野生純合子AA個(gè)體,下降約27.5%,與變異等位基因C降低CASP3 mRNA表達(dá)量、從而降低血液毒性風(fēng)險(xiǎn)的預(yù)期相一致。
我們?cè)?2例樣本中取20例對(duì)CASP33'U
6、TR進(jìn)行測(cè)序,發(fā)現(xiàn)除了rs6948多態(tài)外,僅存在rs1049216多態(tài)。根據(jù)PHASE2.0.2估算,兩位點(diǎn)緊密連鎖,存在兩種單倍型:A/C(A為rs6948等位基因,C為rs1049216等位基因)和C/T(C為rs6948等位基因,T為rs1049216等位基因)。據(jù)此,我們構(gòu)建了包含CASP3整個(gè)3'UTR的pGL3-PromoterA/C和pGL3-PromoterC/T重組子。雙熒光分析表明,變異等位基因重組子pGL3-Pro
7、moterC/T相對(duì)于野生等位基因重組子pGL3-Promoter A/C,螢火蟲熒光酶相對(duì)表達(dá)量顯著降低。
經(jīng)TargetScan預(yù)測(cè),rs6948可能位于miR-24的靶序列中,rs1049216可能位于miR-664的靶序列中。進(jìn)一步研究首先應(yīng)證實(shí)引起翻譯抑制的原因是rs6948多態(tài)還是rs1049216多態(tài)或者兩者皆是;其次應(yīng)證實(shí)rs6948是否位于miR-24的靶序列中或者rs1049216是否位于miR-664的靶
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