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文檔簡介
1、浙江沿海越冬大黃魚年年有凍死,為了探索大黃魚應對低溫環(huán)境時相關基因的表達變化,本實驗模擬了大黃魚越冬季節(jié)養(yǎng)殖環(huán)境,對大黃魚進行室內低溫協(xié)迫實驗,運用 cDNA末端快速擴增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技術克隆部分低溫相關基因的全長,并利用實時熒光定量(quantitative real-time PCR,qPCR)技術研究候選耐寒基因在正常越冬水溫(12℃)和急性、慢性降溫處理條件下相關組
2、織的表達量變化。研究結果如下:
大黃魚MIPS基因 cDNA全長為2657bp,5′非編碼區(qū)(untranslated region,UTR)248bp,3′非編碼區(qū)750bp,開放閱讀框為1659 bp,起于ATG和終于TAA,編碼一個由553個氨基酸組成的蛋白;大黃魚 SCD-1a基因 cDNA全長為3125bp,5′非編碼區(qū)133bp,3′非編碼區(qū)1978bp,開放閱讀框為1014 bp,起于ATG和終于TAA,編碼一個
3、由338個氨基酸組成的蛋白;大黃魚 SCD-1b基因 cDNA全長為2647bp,5′非編碼區(qū)15bp,3′非編碼區(qū)1624bp,開放閱讀框為1008 bp,起于ATG和終于TGA,編碼一個由336個氨基酸組成的蛋白。并對三個基因進行跨膜域預測,結果表明 SCD-1a和SCD-1b基因編碼的蛋白有明顯的跨膜區(qū),推測其為跨膜類蛋白。
大黃魚在正常越冬水溫(12℃)情況下,MIPS基因在鰓中表達量最高,在皮膚、腦、腎和脾組織中的表
4、達量低,而在肌肉、腸、肝、性腺和心組織中幾乎不表達;大黃魚 SCD-1a基因主要在肝組織中表達,SCD-1b基因主要在肝和肌肉組織中表達,在其他組織中少量表達或幾乎不表達;大黃魚 CIRP基因在10種組織中均有表達,肝中表達量最高,性腺中表達最少。
緩慢降溫路線為:12℃→10℃→8℃→6℃,降溫速率為0.5℃/d。經慢性低溫脅迫后,MIPS基因在鰓、皮膚、和心組織中均呈先顯著上升后顯著下降的趨勢,腦和肌肉組織則在整個脅迫過程
5、中呈持續(xù)升高趨勢。CIRP基因在鰓、皮膚、腎和心四個組織中最先發(fā)生響應,隨后是肌肉組織。SCD-1a基因鰓組織呈升高趨勢,脾、肌肉、腸和腦組織先升高后下降,肝組織呈下降趨勢。SCD-1b基因皮膚和腦呈現升高趨勢,肌肉、腸和心組織先上升后下降,肝組織表達量持續(xù)在高水平,變化不顯著。
急性降溫幅度為:12℃→8℃,取樣時間點為0 h、0.5 h、2 h、4 h。經急性性低溫脅迫后,MIPS基因除腸組織以外其他組織的表達量總體呈上升
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