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1、系統(tǒng)發(fā)生學(xué)的研究已經(jīng)有幾十年的歷史了。目前,大部分的研究都是基于DNA或者蛋白質(zhì)序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)生分析的,并且針對(duì)不同物種演示它們的進(jìn)化歷史。這些方法最終都將產(chǎn)生一棵系統(tǒng)發(fā)生樹,樹的節(jié)點(diǎn)代表物種,而節(jié)點(diǎn)間的連邊代表物種間的進(jìn)化關(guān)系。由于基因序列數(shù)據(jù)的不足,通過分析不同物種的代謝網(wǎng)絡(luò)可以更深層次的發(fā)現(xiàn)這些物種的進(jìn)化和類別關(guān)系。代謝網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)可以用酶圖來表示,本文提出一種新的酶圖間距離的計(jì)算方法,用圖的頂點(diǎn)間相似度和圖的結(jié)構(gòu)關(guān)系來定義圖的
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