四川骨髓庫(kù)漢族人群MICA等位基因分布.pdf

1、目的:
　　 研究中國(guó)造血干細(xì)胞捐獻(xiàn)者資料庫(kù)(CMDP)四川分庫(kù)中四川籍漢族人群MICA等位基因分布特點(diǎn)及其與HLA組成的單倍型特點(diǎn)。并初步估計(jì)四川造血干細(xì)胞移植供受者之間可能存在的MICA位點(diǎn)錯(cuò)配情況。
　　 方法:
　　 從四川骨髓庫(kù)2008年12月-2009年11月街頭采集的600余份川籍漢族無(wú)關(guān)志愿者樣本中,隨機(jī)選擇119(人)份,這些樣本均已完成HLA-A/B/DRB1高分辨分型；從四川省臍帶血造血干細(xì)

2、胞庫(kù)HLA臨床檢測(cè)室選取10例已完成HLA-A/B/DRB1低分辨分型,等待造血干細(xì)胞移植治療的血液病患者標(biāo)本。分別采用PCR—SBT和PCR—SSP技術(shù),對(duì)MICA基因第2—6外顯子測(cè)序分型和MICA基因缺失型(MICA*Del)檢測(cè)。應(yīng)用直接計(jì)數(shù)法計(jì)算MICA各等位基因頻率；應(yīng)用卡方檢驗(yàn)比較MICA等位基因在不同人群中的分布差異；應(yīng)用ARLEQUIN3.5.1.2軟件對(duì)該群體HLA-B/MICA2位點(diǎn)連鎖不平衡分析和單倍型頻率計(jì)算以

3、及HLA-A/B/MICA/HLA-DRB14位點(diǎn)單倍型頻率計(jì)算。
　　 結(jié)果:
　　 共檢測(cè)到13種已知MICA等位基因和2種新的MICA等位基因。其中以MICA*010(25.2％)最常見(jiàn),其次為MICA*F008:01/04(23.1％),MICA*002:01(16.0％),MICA*019(10.5％),MICA*012:01(8.8％),MICA*049(4.2％)和MICA*009:01(3.8％),這7種

4、等位基因占所檢出MICA等位基因的91.6％。與浙江漢族相比,僅MICA*027分布存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,與內(nèi)蒙古漢族、韓國(guó)人、美國(guó)白人及非洲裔美國(guó)人相比,有5—11種不同MICA等位基因分布存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。四川骨髓庫(kù)漢族與上述5個(gè)群體間總體分布均存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。本研究發(fā)現(xiàn)3例2種新的MICA等位基因,被世界衛(wèi)生組織HLA因子命名委員會(huì)分別命名為MICA*064N和MICA*010:02。與MICA*064N序列最為相似的是MICA*027,

5、二者僅存在801位G>A堿基取代,導(dǎo)致編碼胞外α3結(jié)構(gòu)域的244位密碼子由色氨酸(UGG)密碼子變成了終止密碼子(UGA)；與MICA*010:02序列最為相似的是MICA*010,二者僅存在933位T>C堿基取代,該堿基突變?yōu)橥x突變。連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn),四川骨髓庫(kù)漢族人群中B*1301-MICA*045,B*4801-MICA*Del緊密連鎖；A*0207-B*4601-MICA*010-DRB1*0901為最常見(jiàn)的4位點(diǎn)單倍型。對(duì)