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文檔簡(jiǎn)介
1、2002年國(guó)際食品微生物標(biāo)準(zhǔn)化委員會(huì)(ICMSF)把阪崎腸桿菌列為“嚴(yán)重危害特定人群,危害生命或慢性實(shí)質(zhì)性后遺癥或長(zhǎng)期影響”的一種致病菌。嬰兒配方奶粉是其最主要的傳播途徑,而且嬰兒配方奶粉中微量的阪崎腸桿菌污染(<3CFU/100g)也能導(dǎo)致感染的發(fā)生,因此檢測(cè)阪崎腸桿菌的方法是否靈敏、特異及快速至關(guān)重要。
目前對(duì)阪崎腸桿菌的檢測(cè)方法主要有FDA推薦的傳統(tǒng)檢測(cè)方法,免疫學(xué)方法和PCR方法。傳統(tǒng)檢測(cè)方法操作繁瑣,檢測(cè)時(shí)間長(zhǎng),
2、而且靈敏度較低;免疫學(xué)方法的特異性和靈敏度也不理想;PCR方法敏感、快速,但由于需要昂貴的儀器設(shè)備、繁瑣的電泳過(guò)程,而使其難以在基層普及和推廣。采用環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(Loop-mediated isothermal amplification,簡(jiǎn)稱LAMP)技術(shù),檢測(cè)嬰兒配方奶粉中的阪崎腸桿菌,靈敏度高,特異性強(qiáng),檢測(cè)方法簡(jiǎn)便,耗時(shí)短而且檢測(cè)成本低,能夠在基層普及和推廣。
針對(duì)阪崎腸桿菌(ATCC29544)GenBank中
3、(基因號(hào)AY702093)16S-23S rRNA的保守序列,運(yùn)用在線引物設(shè)計(jì)軟件(https://primerexplorer.jp/lamp3.0.0/index.html)設(shè)計(jì)LAMP引物。對(duì)反應(yīng)時(shí)間、反應(yīng)溫度、鎂離子濃度等擴(kuò)增條件進(jìn)行優(yōu)化,確定25 μL的 LAMP反應(yīng)體系為:內(nèi)引物(FIP和BIP)各1.2 μM,外引物(F3和B3)各0.2 μM,環(huán)引物(LF和LB)各0.6 μM,2.5 mM dNTP,1.6 M甜菜堿,
4、4 mM MgSO4,10×Bst DNA聚合酶反應(yīng)緩沖液,8U的Bst DNA聚合酶大片段,3 μL DNA模板和用滅菌雙蒸水補(bǔ)足體系。LAMP反應(yīng)過(guò)程是首先在64℃水浴鍋中反應(yīng)20min,然后將其放入80℃水浴鍋中,水浴10min終止反應(yīng),通過(guò)肉眼觀察有無(wú)白色焦磷酸鎂沉淀,即可判斷是否發(fā)生了LAMP反應(yīng)。
為了比較LAMP檢測(cè)阪崎腸桿菌靈敏度和人工污染檢出限,以 PCR方法作對(duì)照。PCR反應(yīng)的引物是改良LAMP的兩條外
5、引物(F3和B3)。結(jié)果表明,改良LAMP檢測(cè)阪崎腸桿菌的檢出限為0.101CFU/mL,人工污染阪崎腸桿菌的嬰兒配方奶粉的檢出限為1.100CFU/g。采用試劑盒提取DNA,從樣品處理到報(bào)告結(jié)果,耗時(shí)1h。對(duì)照PCR耗時(shí)3h,檢測(cè)阪崎腸桿菌的檢出限為101CFU/mL,人工污染阪崎腸桿菌的嬰兒配方奶粉的檢出限為1100CFU/g。改良LAMP的靈敏度是PCR的1000倍。
對(duì)普通LAMP和改良LAMP以及改良LAMP自身
6、加環(huán)引物和未加環(huán)引物進(jìn)行了檢測(cè)阪崎腸桿菌純培養(yǎng)和人工污染檢出限的比較,結(jié)果表明,改良LAMP的靈敏度是普通LAMP和未加環(huán)引物改良LAMP的10倍。
初步研究了6種模板制備方法對(duì)LAMP檢測(cè)嬰兒配方奶粉中阪崎腸桿菌的影響。研究表明LAMP方法對(duì)制備模板DNA的要求不高。通過(guò)對(duì)實(shí)際樣品進(jìn)行檢測(cè),將本方法與行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)SN/T1632.1-2005方法進(jìn)行比較,確定LAMP方法敏感性為100%,特異性為98.15%,符合率為98.
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